本发明提供了一种基于基因表达监控的麦芽浸出率评价方法，涉及食品检测领域。该方法包括总RNA的提取与纯化、逆转录反应制备cDNA模板、多重PCR反应、毛细管电泳得到基因电泳图谱、图谱数据分析得到麦芽水解相关基因的表达峰高H、利用麦芽水解相关基因的表达峰高H计算麦芽浸出率，针对麦芽水解相关基因LD，AMY1，AMY4，GLU，ASP，CYS，SERⅠ，SERⅢ，MET，TRX，PDI，SEP，WRKY和内控基因ACT。该方法能够基于淀粉、蛋白水解酶的基因表达监控，建立预测麦芽浸出率的方法，从而用于评价麦芽浸出率；与传统的测定方法相比，准确度高，效率高且方法简便。