本发明属于甜瓜基因工程技术领域，具体涉及一个与甜瓜（Cucumis melo L.）蔓茎长短性状基因SI/si紧密连锁的分子标记及其应用专利申请事宜。该分子标记命名为CmSSR17253；由CmSSR17253‑F和CmSSR17253‑R组成。该分子标记可用于识别、定位甜瓜短蔓基因si和正常蔓基因SI，用于分子标记辅助育种。本申请能够较好克服现有常规育种筛选、鉴定方法的时间周期长、工作量大等缺陷，从而大幅加速育种进程；另一方面，由于借助于PCR扩增方法进行检测，具有特异性好、准确度高、鉴定效率高等优点，可在甜瓜幼苗早期即可准确判定甜瓜材料表型，从而有针对性开展后续育种工作。