本发明公开了一种风冷电池系统及其热管理方法，将多个风冷电箱层级的电芯叠加排布形成电池簇封闭于以电池舱内，以提高能量密度以及IP防护等级，对电池舱设置空调出风口和空调回风口，与空调连接，通过导风罩将空调出风导至风冷电箱下方的散热翅片冷板处对风冷电箱进行散热，形成风冷回路，保障系统散热；同时考虑到由于空气的密度和热容较低，相较于水冷机组的进出水温度，在相同换热量下，空调进出风的温差更大，因此电箱层级的电芯温差更大，从而造成电池簇级别电芯温差较大，匹配有相应的热管理策略，对电芯进行温度控制，解决电芯温差问题。