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公开(公告)号：KR1020080051013A
公开(公告)日：2008-06-10
申请号：KR1020070094739
申请日：2007-09-18
Applicant: 한국전자통신연구원
CPC classification number: G06T7/215
Abstract: An apparatus and a method for recognizing person behaviors using a motion vector are provided to cope with an emergency situation effectively that may occur with an observation target person. A recognition table storage unit(11) stores behavior configuration information corresponding to an average motion vector. An image collecting unit(12) collects images inputted from the exterior. A motion vector calculating unit(13) recognizes an object from an image collected by the image collecting unit and calculates motion vectors of the object. An average motion vector calculating unit(14) calculates an average motion vector with respect to the motion vectors calculated by the motion vector calculating unit. A behavior recognizing unit(15) searches the recognition table storage unit with the average motion vector calculated by the average motion vector calculating unit to recognize a corresponding behavior.
Abstract translation: 提供一种使用运动矢量识别人物行为的装置和方法，以便有效地处理可能与观察目标人物发生的紧急情况。 识别表存储单元（11）存储对应于平均运动矢量的行为配置信息。 图像采集单元（12）收集从外部输入的图像。 运动矢量计算单元（13）从由图像采集单元收集的图像识别对象，并计算对象的运动矢量。 平均运动矢量计算单元（14）针对由运动矢量计算单元计算的运动矢量计算平均运动矢量。 行为识别单元（15）利用由平均运动矢量计算单元计算的平均运动矢量来识别识别表存储单元，以识别对应的行为。
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公开(公告)号：KR100813008B1
公开(公告)日：2008-03-13
申请号：KR1020060123331
申请日：2006-12-06
Applicant: 한국전자통신연구원
IPC: G01N33/48
Abstract: An apparatus and a method for predicting a gene module are provided to predict the gene module(a group of genes) controlled by the same transcription factor group and performing the same function in a cell from gene expression data and transcription factor binding information. An apparatus for predicting a gene module(103) comprises: a gene expression similarity matrix generation means(104) which generates a gene expression similarity matrix using gene expression date from the outside gene expression data; a gene expression similarity graph generation means(105) which generates a gene expression similarity graph using the gene expression similarity matrix generated from the gene expression similarity matrix generation means; a crowd portion graph generation means(106) which applies a crowd portion graph algorithm to the gene expression similarity graph to generate a crowd portion graph; and a significant gene module generation means(107) which extracts the transcription factor binding information from the outside transcription factor binding database using the crowd portion graph to generate a significant gene module, wherein the crowd portion graph generation means generates the crowd portion graph accepting the replication of the gene.
Abstract translation: 提供一种用于预测基因模块的装置和方法，以预测由相同转录因子组控制的基因模块（一组基因），并从基因表达数据和转录因子结合信息在细胞中起相同的功能。 一种用于预测基因模块（103）的装置，包括：使用基因表达日期从外部基因表达数据生成基因表达相似性矩阵的基因表达相似性矩阵生成装置（104） 使用从基因表达相似矩阵生成单元生成的基因表达相似性矩阵生成基因表达相似图的基因表达相似图生成单元（105） 人群部分图生成装置，将群体部分图算法应用于基因表达相似图，生成人群部分图; 以及使用人群部分图从外部转录因子结合数据库中提取转录因子结合信息以产生重要基因模块的显着基因模块产生装置（107），其中，群体部分图生成装置生成接受 基因的复制。
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公开(公告)号：KR1020070060996A
公开(公告)日：2007-06-13
申请号：KR1020060025682
申请日：2006-03-21
Applicant: 한국전자통신연구원
IPC: G06F17/30
Abstract: A method and a system for verifying protein-protein interaction by using a protein homology relationship are provided to verify the protein-protein interaction of one protein extracted from a biological experiment at a low expense by comparing the extracted protein-protein interaction with the protein-protein interactions proved in various kinds of proteins. A protein information database(140) stores information for various kinds of proteins. A protein-protein interaction database(160) stores the protein-protein interaction of the proteins. A homology relationship generator(110) generates more than one homology relationship between one source protein and other proteins by filtering the proteins closely related to the source protein from other proteins in the protein information database. A protein-protein interaction generator(120) generates the protein-protein interaction corresponding to the source protein-protein interaction by using the generated homology relationship. A protein-protein interaction estimator(130) estimates whether the generated protein-protein interaction is included in other proteins by using the protein-protein interaction database.
Abstract translation: 提供了一种利用蛋白质同源关系验证蛋白质 - 蛋白质相互作用的方法和系统，通过比较提取的蛋白质 - 蛋白质相互作用与蛋白质 - 蛋白质相互作用来验证从生物实验中提取的一种蛋白质的蛋白质 - 蛋白质相互作用， 蛋白质相互作用证明了各种蛋白质。 蛋白质信息数据库（140）存储各种蛋白质的信息。 蛋白质 - 蛋白质相互作用数据库（160）存储蛋白质的蛋白质 - 蛋白质相互作用。 同源关系发生器（110）通过过滤与蛋白质信息数据库中的其他蛋白质与源蛋白密切相关的蛋白质而在一种源蛋白质和其他蛋白质之间产生多于一种的同源关系。 蛋白质 - 蛋白质相互作用发生器（120）通过使用产生的同源性关系产生对应于源蛋白质 - 蛋白质相互作用的蛋白质 - 蛋白质相互作用。 蛋白质 - 蛋白质相互作用估计器（130）通过使用蛋白质 - 蛋白质相互作用数据库来估计生成的蛋白质 - 蛋白质相互作用是否包含在其他蛋白质中。
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公开(公告)号：KR1020070060959A
公开(公告)日：2007-06-13
申请号：KR1020060013695
申请日：2006-02-13
Applicant: 한국전자통신연구원
CPC classification number: G06F19/16
Abstract: A device and a method for searching a protein active site are provided to search the similar active site at low complexity, and offer a convenient interface for selecting the desired active side with the extracted active site or displayed atoms. An active site database(160) stores information for a plurality of reference active site information. A comparator(150) calculates 3D structural similarity between the input active site and the reference active sites according to the number of residues overlapped with each other. A searcher searches the reference active site for the input active site according to the similarity. An active site extractor(130) receives a PDB(Protein Data Bank) file including the active site information and extracts the active site from the PDB file. A display part(120) displays the extracted active site. An active site selector(140) provides the active site selected by the user to the comparator as the input active site.
Abstract translation: 提供了一种用于搜索蛋白质活性位点的装置和方法，以低复杂度搜索相似的活性位点，并提供了一个方便的界面，用于选择所提取的活性位点或显示的原子所需的活性侧。 活动站点数据库（160）存储多个参考活动站点信息的信息。 比较器（150）根据彼此重叠的残差数来计算输入活性位点与参考活性位点之间的3D结构相似性。 搜索者根据相似性搜索参考活动网站的输入活动网站。 活动站点提取器（130）接收包含活动站点信息的PDB（蛋白质数据库）文件，并从PDB文件中提取活动站点。 显示部件（120）显示所提取的活动位置。 活动站点选择器（140）将由用户选择的活动站点提供给比较器作为输入活动站点。
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公开(公告)号：KR100597089B1
公开(公告)日：2006-07-05
申请号：KR1020030091012
申请日：2003-12-13
Applicant: 한국전자통신연구원
IPC: C12Q1/68
Abstract: 본 발명은 유전자 발현 프로파일을 이용한 유사 유전자 그룹의 탐색 방법에 관한 것으로, 특히 마이크로 어레이 실험으로부터 획득한 유전자 발현 프로파일을 분석하여 중요한 시드 유전자를 자동으로 설정하고 이를 기반으로 유사 유전자 그룹을 탐색함으로써, 대상 유전자의 수에 관계없이 효과적으로 탐색가능하며, 복잡한 초기 입력변수를 요구하지 않아 사용자가 보다 쉽게 사용할 수 있도록 한 유전자 발현 프로파일을 이용한 유사 유전자 그룹의 탐색 방법에 관한 것이다.
본 발명의 유전자 발현 프로파일을 이용한 유사 유전자 그룹의 탐색 방법은, 유전자 발현 프로파일을 이용한 유사 유전자 그룹을 탐색하는 방법에 있어서, (a) 상기 유전자 발현 프로파일을 선행 처리하는 단계; (b) 상기 선행 처리된 유전자 발현 프로파일로부터 k(k=1,2,3,……,n)개의 시드 유전자를 설정하는 단계; (c) 상기 설정된 시드 유전자에 의해 k개의 시드 유전자를 추출하는 단계; (d) 상기 추출된 시드 유전자에 의해 유사 유전자 그룹을 탐색하는 단계; 및 (e) 상기 탐색된 유사 유전자 그룹을 평가하는 단계를 포함하여 이루어진 것을 특징으로 한다.
유전자(gene), 유전자 발현 프로파일(gene expression profiles), 탐색-
Patent Agency Ranking
公开(公告)号：KR1020060070582A
公开(公告)日：2006-06-26
申请号：KR1020040109001
申请日：2004-12-20
Applicant: 한국전자통신연구원
IPC: G06F19/10
CPC classification number: G06F19/10
Abstract: 바이오 객체 상호작용 네트워크를 통합하는 방법 및 장치가 개시된다. 본 발명은, 기본 및 대상 상호작용 네트워크를 통합하는 방법에 있어서, a)사용자에 의해 미리 정의된 소정의 비교 연산자에 기초하여, 상기 기본 및 대상 상호작용 네트워크 각각에서 바이오 객체 및 상호작용 관계를 중복 없이 유일하게 하는 전처리 단계; 및 b)상기 전처리된 상호작용 네트워크의 바이오 객체 및 상호작용 관계에 기초하여 상기 네트워크의 합집합, 교집합, 차집합 또는 사상을 생성하는 네트워크 연산 단계를 포함한다. 본 발명에 의하면, 하나 이상의 상호작용을 사용자의 의도에 따라 다양한 시각에서 통합할 수 있게 하는 상호작용 네트워크 통합 방법 및 장치가 제공된다.
바이오 객체, DNA, RNA, 단백질, 상호작용, 네트워크 통합-
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公开(公告)号：KR100550329B1
公开(公告)日：2006-02-08
申请号：KR1020030080817
申请日：2003-11-15
Applicant: 한국전자통신연구원
IPC: G06F17/30
Abstract: 본 발명은 단백질 3차원 구조공간상에서 원자 또는 펩티드 결합관계에 의해 각 에지패턴의 분포인 3차원 에지 히스토그램을 생성하고 그 히스토그램의 유사도를 통해 사용자의 질의 단백질과 구조적으로 유사한 단백질들을 검출 제공하는 단백질 구조 비교검색 장치 및 방법에 관한 것이다.
본 발명은 사용자로부터 질의 단백질을 입력받아 단백질 구조 검색서버에 유사 단백질의 검색을 요청하고 그 검색 결과를 출력하는 검색 클라어언트; 각종 단백질들에 대한 3D 에지 히스토그램을 생성하고 이들을 데이터베이스화하는 3D 에지 히스토그램 추출/저장장치; 및 질의 단백질에 대한 3D 에지 히스토그램을 생성한 후 이를 상기 데이터베이스화된 각종 단백질의 3D 에지 히스토그램들과 상호 비교하여 유사도를 산출하고 소정 이상의 유사도를 갖는 단백질들을 검색 제공하는 단백질 구조 검색서버;로 구성된다.
단백질 구조 검색, 결합선 분포, 3차원 에지 히스토그램, 생물정보학, PDB, PCA-
公开(公告)号：KR100544978B1
公开(公告)日：2006-01-24
申请号：KR1020030078055
申请日：2003-11-05
Applicant: 한국전자통신연구원
IPC: G06F17/30
Abstract: 본 발명은 네트워크상의 생물정보에 접근하고 이의 분석/가공을 위한 기본 정보 생성을 위해, 다양한 형태와 방식으로 표현되는 생물정보 데이터베이스를 대상으로 보다 안정적이고 효과적으로 생물정보를 추출할 수 있도록 하는 랩퍼 명세 언어에 기반한 인터넷상의 반구조화된 생물정보 추출 방법에 관한 것이다.
본 발명은 대상 생물정보의 구조 및 그 내재된 시멘틱을 선언적으로 기술하여 랩퍼를 명세하는 단계와, 랩퍼 명세로부터 대상 생물정보에 대한 구조 및 연산을 파싱하여 실제 랩퍼를 생성하는 단계와, 생성된 랩퍼를 실행하여 네트워크상의 대상 생물정보를 추출하고 그 누적되는 생물정보를 변형하여 통합 메타 모델을 구축하는 단계를 포함하여 이루어진다.
바이오인포매틱스, 생물정보 데이터베이스, 랩퍼 명세언어, HTML/XML, 생물정보 통합시스템, 랩퍼 템플릿, 모델 템플릿-
公开(公告)号：KR100540594B1
公开(公告)日：2006-01-10
申请号：KR1020030095036
申请日：2003-12-22
Applicant: 한국전자통신연구원
Abstract: 본 발명은 단백질 상호작용 데이터를 시각화 하기 위한 기술에 관한 것이다. 특히, 단백질 상호작용 데이터의 기능기반 추상화 방법 및 이를 이용한 시각화 방법 및 장치에 관한 것이다.
본 발명은 각 단백질을 정점으로 단백질간의 각 상호작용을 간선으로 할당하여 데이터를 형성하는 (a) 단계, 정점 및 정점 주변에 위치한 소정의 기능 또는 기능들을 가진 정점들을 클러스터로 그룹핑하고, 각 클러스터를 정점으로 클러스터간의 각 상호작용을 간선을 할당하여 새로운 데이터를 형성하는 (b) 단계, 및 상기 (b) 단계를 소정 횟수 수행하는 (c) 단계를 포함하는 단백질 상호작용 데이터의 기능기반 추상화 방법을 제공한며, 또한 이를 이용한 시각화 방법 및 장치를 제공한다.
본 발명에 의한 단백질 상호작용 데이터의 기능기반 추상화 방법 및 이를 이용한 시각화 방법 및 장치는 대용량 단백질의 상호작용을 쉽게 눈으로 시각화 할 수 있다는 장점이 있다.
단백질(protein), 상호작용(interaction), 시각화(visualization), 온톨로지(ontology), 추상화(abstraction).
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