Abstract:
본 발명은 고구마잎말림바이러스를 검출하기 위한 등온증폭반응용 프라이머 세트, 이를 포함하는 조성물, 및 상기 조성물을 이용한 고구마잎말림바이러스의 검출방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로는 고구마잎말림바이러스의 검출을 위한 등온증폭 반응용 4개의 프라이머 세트와 이를 포함하는 프라이머 조성물 및 검출방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 검출방법은 등온증폭법을 이용하여 단시간 내에 전문장비 없이 효과적으로 고구마잎말림바이러스를 검출할 수 있다. 또한 고농도의 SYBR Green I을 이용하여 자연광하에서 육안으로 신속하게 진단할 수 있다. 따라서 고구마재배농가에 막대한 피해를 줄 수 있는 고구마 감염성 바이러스를 조기에 검출 가능하게 하여 보다 신속하고 효율적인 고구마 바이러스 진단 시스템을 구축할 수 있을 것으로 기대된다.
Abstract:
PURPOSE: A primer composition for loop-mediated isothermal amplification reaction for quickly detecting honeysuckle yellow vein virus is provided to early detect the virus, and to establish a quick and efficient system for diagnosing the virus. CONSTITUTION: A primer set for loop-mediated isothermal amplification reaction for detecting honeysuckle yellow vein virus contains sequence numbers 1-4. The virus is selected from the group consisting of Korea mutant strains(GQ477135), Japanese mutant strains(AB236325), New Zealand mutant strains(FJ817425), UK1 mutant strains(NC_005807), and UK2 mutant strains(AJ543429). A primer composition for loop-mediated isothermal amplification reaction for detecting honeysuckle yellow vein virus contains the primer set. The composition further contains DNA polymerase, dNTPs, and a reaction buffer. A method for detecting honeysuckle yellow vein virus comprises: a step of isolating genome DNAs; a step of performing loop-mediated isothermal amplification reaction at 60-70 deg. C for 30 minutes-2 hours; and a step of detecting the amplified product.
Abstract:
PURPOSE: A primer composition for loop-mediated isothermal amplification reaction for detecting tobacco leaf curl virus is provided to early detect the virus, and to prevent economic loss. CONSTITUTION: A primer set for loop-mediated isothermal amplification reaction for detecting tobacco leaf curl virus has sequence numbers 1-4. The prime set contains sequence numbers 17-20. The virus is selected from the group consisting of: NCBI No. HM164547, HM164541, HM164545, and HM164550 mutant strains found in Korea; and NCBI No. EF620536, NC_004641, NC_004654, AB287439, AB028604, AB055008, AB055009, and AB079689 mutant strains found in Japan. A composition contains DNA polymerase for loop-mediated isothermal amplification reaction, dNTPs, and a reaction buffer.