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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：KR1020080019857A
公开(公告)日：2008-03-05
申请号：KR1020060082296
申请日：2006-08-29
Applicant: 한국과학기술원
Abstract: A device and a method for predicting a tertiary structure from amino acid sequences of protein are provided to reduce a cost and time for experimentally declaring a structure of the protein by predicting the tertiary structure of the amino acid sequences of the protein correctly/precisely more than usual prediction methods. A sequence preprocessor(100) preprocesses unknown protein sequences inputted from an input device(10). A mold protein database(102) stores information of mold protein. A matching comparator(101) compares unknown protein with the mold protein based on the mold protein database. A protein similarity network database(104) stores structure similarity among the mold proteins. A global comparator(103) compares the unknown protein with the mold protein globally based on the protein similarity network database. A mold selector(105) selects more than one of the mold proteins having a structure similar to the unknown protein based on a result of the matching comparator and the global comparator. A modeler(106) predicts a 3D(Dimensional) structure of the unknown protein based on the result of the mold selector. A verifier(107) verifies the predicted protein structure. An output part(20) outputs the predicted protein structure.
Abstract translation: 提供一种用于从蛋白质的氨基酸序列预测三级结构的装置和方法，以通过预测蛋白质的氨基酸序列的三级结构正确/精确地超过以上来精确地降低用于实验地宣告蛋白质结构的成本和时间 通常的预测方法。 序列预处理器（100）预处理从输入设备（10）输入的未知蛋白质序列。 模具蛋白质数据库（102）存储模具蛋白质的信息。 匹配比较器（101）基于模具蛋白质数据库比较未知蛋白质与模具蛋白质。 蛋白质相似性网络数据库（104）存储模具蛋白质之间的结构相似性。 全球比较（103）基于蛋白质相似性网络数据库，全球比较未知蛋白质与模具蛋白质。 模具选择器（105）基于匹配比较器和全局比较器的结果选择具有与未知蛋白质相似结构的多于一种的模具蛋白质。 建模者（106）基于模具选择器的结果预测未知蛋白质的3D（尺寸）结构。 验证器（107）验证预测的蛋白质结构。 输出部（20）输出预测的蛋白质结构。
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公开(公告)号：KR101743254B1
公开(公告)日：2017-06-07
申请号：KR1020150021408
申请日：2015-02-12
Applicant: 한국과학기술원
Abstract: 확률그래프모델을이용한단백질의중요부위예측장치가개시된다. 아미노산또는핵산서열에대한미지서열이수신되는입력부, 아미노산또는핵산서열의정보가저장되고, 단백질의 3차원구조가저장되는데이터베이스및 데이터베이스를이용하여상기미지서열의중요부위를예측하는제어부를포함하되, 제어부는, 수신된아미노산또는핵산서열과진화적으로관련된서열들로생성한다중서열정렬, 상기수신된아미노산또는핵산서열의단백질구조를이용하여생성한 MRF(Markov Random Field) 모델및 상기 MRF 모델을기초로설정한제한조건항중 적어도하나를기초로 MRF 모델파라미터를산출하여서로다른위치사이의진화적연관성및 각잔기의진화적의존성을측정하고, 측정된진화적연관성및 진화적의존성을기초로상기미지서열의중요부위를예측한다.
Abstract translation: 公开了一种使用概率图模型预测蛋白质的临界区域的设备。 和用于氨基酸或一个输入单元，一个氨基酸或所接收，其包括核酸序列的核酸序列信息的图像序列：控制器使用数据库和数据库来估计图像序列的关键部分是蛋白存储的三维结构 时，控制单元，通过用与所接收的氨基酸或核酸序列和进化的序列比对，并且在接收到的氨基酸或核酸序列（马尔可夫随机场）MRF模型和MRF模型相关氨基酸序列所得的蛋白质结构中产生 通过根据基于不同位置之间的进化关系，每个残基的进化依赖测量和测量的进化关系和进化相关性的基础上的防设定中的至少一个计算约束MRF模型参数 预测未知序列的重要区域。
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公开(公告)号：KR100836166B1
公开(公告)日：2008-06-09
申请号：KR1020060082296
申请日：2006-08-29
Applicant: 한국과학기술원
Abstract: 본 발명은 단백질의 아미노산 서열로부터 삼차 구조를 예측하기 위한 장치 및 이의 예측 방법에 관한 것으로, 구체적으로 입력수단; 상기 입력수단에서 입력된 미지 단백질 서열을 전처리하는 수단; 주형 단백질 데이터베이스; 짝 비교 수단; 단백질 유사도 네트워크 데이터베이스; 상기 단백질 유사도 네트워크 데이터베이스에 기초하여 미지 단백질과 주형 단백질을 전역적으로 비교하는 전역 비교 수단; 주형 선택 수단; 모델링 수단; 상기 예측된 단백질 구조를 검증하는 검증 수단; 및 출력수단을 포함하여 이루어지는 미지 단백질의 삼차 구조 예측 장치 및 이의 예측 방법에 관한 것이다. 본 발명은 기존의 단백질 예측 방법들보다 정확하고 정밀하게 단백질의 삼차 구조를 예측해줌으로써, 실험적으로 단백질 구조를 밝히는데 소비되는 비용과 시간을 절감하는 효과가 있으므로 각종 질병을 치료를 위한 연구 분야에 유용하게 사용될 수 있다.
단백질, 삼차 구조, 예측 방법, 단백질 유사도 네트워크 데이터베이스-
公开(公告)号：KR1019960037214A
公开(公告)日：1996-11-19
申请号：KR1019950009580
申请日：1995-04-24
Applicant: 한국과학기술원
IPC: C25F3/00
Abstract: 본 발명은 정밀로울러 경면가공용 전해자기점탄성 연마장치에 관한 것이다. 좀 더 구체적으로, 본 발명은 정밀로울러의 경면가공시 전해액에 자기장을 걸어줌으로써 연마작용을 촉진시켜 연마효율을 증진시킬 수 있는 정밀로울러 경면가공용 전해자기점탄성 연마장치에 관한 것이다. 본 발명의 연마장치는 정밀로울러(1)의 가공면에 전류를 인가하기 위한 음전극(2)와 양전극(14), 양전극(14)과 연결되며 정밀로울러(1)에 전류를 인가하기 위한 브러쉬(13), 정밀로울러(1)의 가공면에 자기장을 인가하기 위한 영구자석(3), 영구자석(3)을 고정시키기 위한 영구자석 부착수단(12) 및 정밀로울러(1)와 음전극(2) 사이의 전해연마간극(9)으로 구성된 전해자기 연마부; 복수개의 전해액 분출구(11)를 포함하여 정밀로울러(1)의 가공면에 전해액을 공급하기 위한 전해액분출수단 및 전해액을 공급하기 위한 전해액 주입구(4)로 구성된 전해액 공급부; 및 점탄성 연마페이퍼(5), 점탄성 연마페어퍼(5)를 고정하기 위한 점탄성 연마페이퍼 부착수단(6), 점탄성 연마페이퍼 부착수단(6)을 정밀로울러(1)의 가공면과 긴밀하게 접촉시키기 위한 가압 스프링(7), 압력계(8) 및 점탄성 연마페이퍼 부착수단의 위치를 조절하기 위한 가로이송대(10)로 구성된 점탄성 연마부를 포함한다.
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