KR102228552B1 - Method of predicting multiple targets of drug utilizing random forest QSAR models

    公开(公告)号:KR102228552B1

    公开(公告)日:2021-03-16

    申请号:KR1020180109415A

    申请日:2018-09-13

    CPC classification number: G16B15/00 G16B40/00 G16C20/70

    Abstract: 인체에 존재하는 다수의 표적들에 대한 약물의 결합을 예측하는 방법이 개시된다. 표적들과 결합하는 약물의 구조 정보를 기계 학습하여 각 표적 별로 독립적인 랜덤 포레스트 예측 모델을 생성한 후, 그 예측 모델에 예측대상 약물의 구조 정보를 입력한다. 각 표적 별 랜덤 포레스트 예측모델에서, 표적들 각각에 대한 구조 정보가 입력된 예측대상 약물의 결합 가능성을 각 표적별 표적 점수로 생성하고, 각 표적별 표적 점수를 평가 데이터의 점수를 기반으로 약물과 표적이 상호작용할 확률인 약물-표적 결합 확률로 전환한다. 그 약물-표적 결합 확률에 기초하여 소정의 결합 확률값 이상을 갖는 표적들을 선별하여 상기 예측대상 약물의 예상 표적 리스트로 반환한다. 이런 알고리즘을 약물 표적 예측 서버에 구현하여, 사용자가 클라이언트 단말기를 통해 예측대상 약물의 최상위 표적을 검색할 수 있다.

    아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하기 위한 예측장치 및 예측방법
    2.
    发明公开
    아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하기 위한 예측장치 및 예측방법 有权
    用于从氨基酸或核酸序列预测重要部分的预测装置及其方法

    公开(公告)号:KR1020120125846A

    公开(公告)日:2012-11-19

    申请号:KR1020110043545

    申请日:2011-05-09

    CPC classification number: G06F19/22 G06F17/11 G06F19/14

    Abstract: PURPOSE: A prediction device predicting an important part from amino acid or nucleic acid sequences and a method thereof are provided to detailedly and accurately measure an important part of a life molecule sequence, thereby reducing costs and time required for discovering the important part. CONSTITUTION: A sequence database(130) stores information of an amino acid or nucleic acid sequence. A multi sequence arranging means(120) searches and arranges sequences related to the inputted amino acid or nucleic acid sequence in the sequence database. A multi sequence arrangement post-processing means(140) controls redundancy of a similar sequence based on multi sequence arrangement. A sequence profile calculating means(150) calculates a sequence profile based on multi sequence arrangement post-processing. A joint probability calculating means(160) calculates a joint probability of the amino acid and the nucleic acid based on the multi sequence arrangement post-processing means and the sequence profile calculating means. [Reference numerals] (110) Input means; (120) Multi sequence arranging means; (130) Sequence database; (140) Multi sequence arrangement post-processing means; (150) Sequence profile calculating means; (160) Joint probability calculating means; (170) Coevolution analyzing means; (180) Essential portion selecting means; (190) Output means

    Abstract translation: 目的:提供从氨基酸或核酸序列预测重要部分的预测装置及其方法,以详细和准确地测量生命分子序列的重要部分,从而降低发现重要部分所需的成本和时间。 构成:序列数据库(130)存储氨基酸或核酸序列的信息。 多序列排列装置(120)在序列数据库中搜索和排列与输入的氨基酸或核酸序列有关的序列。 多序列排列后处理装置(140)基于多序列排列来控制类似序列的冗余。 序列轮廓计算装置(150)基于多序列排列后处理来计算序列轮廓。 联合概率计算装置(160)基于多序列排列后处理装置和序列轮廓计算装置计算氨基酸和核酸的联合概率。 (附图标记)(110)输入装置; (120)多序列排列装置; (130)序列数据库; (140)多序排列后处理装置; (150)序列轮廓计算装置; (160)联合概率计算装置; (170)共演化分析手段; (180)基本部分选择装置; (190)输出装置

    조립식 연삭휠
    4.
    发明授权
    조립식 연삭휠 失效
    预制砂轮

    公开(公告)号:KR100155221B1

    公开(公告)日:1999-01-15

    申请号:KR1019950021532

    申请日:1995-07-21

    Abstract: 본 발명은 조립식 연삭휠에 관한 것이다. 좀 더 구체적으로, 본 발명은 연삭지석의 교체가 가능하여 휠 본체를 영구적으로 사용할 수 있으며, 난삭재의 표면을 고정밀도로 가공할 수 있는 조립식 연삭휠에 관한 것이다. 본 발명의 조립식 연삭휠은 외주연에 연삭지석(4) 및 연삭지석 고정수단을 입설할 수 있도록 톱니형태를 지닌 다수개의 홈(2)이 등간격으로 형성되어 연삭지석(4)을 고정시키기 위한 휠 본체(1); 전기한 휠 본체(1)의 홈(2)에 입설고정되어 휠 본체(1)의 회전에 의해 피삭재의 연삭가공을 수행하는 연삭지석(4); 및, 전기한 연삭지석(4)을 전기한 휠 본체(1)의 홈(2)에 고정시키기 위한 연삭지석 고정수단으로 구성된 것을 특징으로 한다. 본 발명의 조립식 연삭휠은 연삭지석의 교체가 용이하여 휠 본체를 영구적으로 사용할 수 있으므로 연삭가공을 경제적으로 수행할 수 있고, 종래의 단속연삭용 연삭휠과 달리, 드레서의 마멸을 방지할 수 있으며, 난삭재의 표면을 고정밀로 가공할 수 있다는 것이 확인되었다.

    정밀로울러 경면가공용 전해자기점탄성 연마장치
    5.
    发明授权
    정밀로울러 경면가공용 전해자기점탄성 연마장치 失效
    精密滚子硬表面加工用电磁磁性电磁抛光系统

    公开(公告)号:KR100149285B1

    公开(公告)日:1998-11-16

    申请号:KR1019950009580

    申请日:1995-04-24

    Abstract: 본 발명은 정밀로울러 경면가공용 전해자기점탄성 연마장치에 관한 것이다. 좀 더 구체적으로, 본 발명은 정밀로울러의 경면가공시 전해액에 자기장을 걸어줌으로써 연마작용을 촉진시켜 연마효율을 증진시킬 수 있는 정밀로울러 경면가공용 전해자기점탄성 연마장치에 관한 것이다. 본 발명의 연마장치는 정밀로울러(1)의 가공면에 전류를 인가하기 위한 음전극(2)과 양전극(14), 양전극(14)과 연결되며 정밀로울러(1)에 전류를 인가하기 위한 브러쉬(13), 정밀로울러(1)의 가공면에 자기장을 인가하기 위한 영구자석(3), 영구자석(3)을 고정시키기 위한 영구자석 부착수단(12) 및 정밀로울러(1)와 음전극(2) 사이의 전해연마간극(9)으로 구성된 전해자기 연마부; 복수개의 전해액 분출구(11)를 포함하여 정밀로울러(1)의 가공면에 전해액을 공급하기 위한 전해액 분출수단 및 전해액을 공급하기 위한 전해액 주입구(4)로 구성된 전해액 공급부; 및 점탄성 연마페이퍼(5), 점탄성 연마페이퍼(5)를 고정하기 위한 점탄성 연마페이퍼 부착수단(6), 점탄성 연마페이퍼 부착수단(6)을 정밀로울러(1)의 가공면과 긴밀하게 접촉시키기 위한 가압 스프링(7), 압력계(8) 및 점탄성 연마페이퍼 부착수단의 위치를 조절하기 위한 가로이송대(10)로 구성된 점탄성 연마부를 포함한다.

    랜덤 포레스트 모델을 활용한 약물의 다중 표적 예측 방법

    公开(公告)号:KR102228552B1

    公开(公告)日:2021-03-16

    申请号:KR1020180109415

    申请日:2018-09-13

    Abstract: 인체에존재하는다수의표적들에대한약물의결합을예측하는방법이개시된다. 표적들과결합하는약물의구조정보를기계학습하여각 표적별로독립적인랜덤포레스트예측모델을생성한후, 그예측모델에예측대상약물의구조정보를입력한다. 각표적별 랜덤포레스트예측모델에서, 표적들각각에대한구조정보가입력된예측대상약물의결합가능성을각 표적별표적점수로생성하고, 각표적별표적점수를평가데이터의점수를기반으로약물과표적이상호작용할확률인약물-표적결합확률로전환한다. 그약물-표적결합확률에기초하여소정의결합확률값이상을갖는표적들을선별하여상기예측대상약물의예상표적리스트로반환한다. 이런알고리즘을약물표적예측서버에구현하여, 사용자가클라이언트단말기를통해예측대상약물의최상위표적을검색할수 있다.

    비음수 행렬 3-요소분해를 이용한 질병 및 질병 연관 유전자를 예측하는 예측장치 및 방법
    7.
    发明授权
    비음수 행렬 3-요소분해를 이용한 질병 및 질병 연관 유전자를 예측하는 예측장치 및 방법 有权
    使用非负矩阵三态化预测疾病和疾病相关基因的预测装置和方法

    公开(公告)号:KR101565005B1

    公开(公告)日:2015-11-03

    申请号:KR1020140183097

    申请日:2014-12-18

    Inventor: 김동섭 정찬석

    Abstract: 비음수행렬 3-요소분해를이용한질병및 질병연관유전자를예측하는예측장치및 방법이개시된다. 유전체변이의데이터를수신하는입력부및 수신된데이터를기초로변이유해성을예측하는변이유해성예측부, 예측된유해성예측값, 질병유전자정보및 유전자사이의상호작용정보중 적어도하나를이용하여비음수행렬 3-요소분해(Non-negative Matrix Tri-Factorization, NMTF) 최적해를산출하기위한제한조건을설정하여제한조건항을생성하는제한조건항생성부, 수신된데이터를행렬형태로변환하여 NMTF 입력행렬을생성하는 NMTF 입력행렬생성부, 제한조건항및 NMTF 입력행렬을기초로 NMTF 최적해를산출하는 NMTF 산출부및 산출된 NMTF 최적해를기초로유전체변이의질병유무및 질병발생에연관된유전자를예측하는질병및 유전자예측부를포함하는제어부를포함한다.

    Abstract translation: 公开了一种使用非负矩阵三因子分解(NMTF)预测疾病和与该疾病相关的基因的装置和方法。 该装置包括:输入单元,其接收关于遗传变体的数据; 基于接收到的数据来预测变体伤害的变体伤害预测单元; 约束条件项产生单元,其通过使用预测的伤害预测值,疾病基因信息和基因 - 基因相互作用信息中的至少一个来设置约束来生成约束条件项以便找到NMTF最优解; NMTF输入矩阵生成单元,其通过将接收的数据变换为矩阵形式来生成NMTF输入矩阵; NMTF输出单元,其基于约束条件项和NMTF输入矩阵计算NMTF最优解; 以及控制部分,其包括疾病和基因预测单元,其基于所计算的NMTF最优解来预测遗传变异是否导致疾病和与疾病相关的基因。

    아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하기 위한 예측장치 및 예측방법
    8.
    发明授权
    아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하기 위한 예측장치 및 예측방법 有权
    用于从氨基酸或核酸序列预测重要部分的预测装置及其方法

    公开(公告)号:KR101317470B1

    公开(公告)日:2013-10-11

    申请号:KR1020110043545

    申请日:2011-05-09

    Abstract: 본 발명은 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하기 위한 장치 및 예측방법에 관한 것으로, 구체적으로 아미노산 또는 핵산 서열이 입력되는 입력수단; 상기 입력수단에서 입력된 아미노산 또는 핵산 서열과 진화적으로 관련 있는 서열들을 검색하고 이들을 서로 정렬하는 다중서열정렬 수단; 아미노산 또는 핵산 서열의 정보가 저장된 서열 데이터베이스; 상기 다중서열정렬에 기초하여 유사한 서열의 중복성을 조정하는 다중서열정렬 후처리수단; 상기 다중서열정렬 후처리수단에 기초하여 서열 프로파일을 계산해주는 서열프로파일 계산수단; 상기 다중서열정렬 후처리수단과 상기 서열프로파일 계산수단에 기초하여 아미노산 또는 핵산의 결합 확률을 계산해주는 결합확률 계산수단; 상기 결합확률 계산수단에 기초하여 서열상의 서로 다른 위치 사이의 연관성을 측정하는 공진화 분석수단; 상기 공진화 분석수단에 기초하여 미지 서열의 중요부위를 예측하는 중요부위 선택수단; 및 상기 예측된 중요부위를 출력하는 출력수단;을 포함하여 이루어지는 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하는 예측장치에 관한 것이다.

    LRR 융합단백질의 설계 방법
    10.
    发明公开
    LRR 융합단백질의 설계 방법 无效
    LRR融合蛋白的设计方法

    公开(公告)号:KR1020120088097A

    公开(公告)日:2012-08-08

    申请号:KR1020110009193

    申请日:2011-01-31

    CPC classification number: G06F19/12 C07K19/00 G06F19/16

    Abstract: PURPOSE: A method for designing an LRR(Leucine Rich Repeat) fusion protein is provided to design an LRR fusion protein by using the degree of sequence similarity of a connected repetition module included in respectively different LRR proteins. CONSTITUTION: A pair of successive repetition modules is selected from LRR family protein based on the calculated similarity value. A pair of successive repetition modules indicates the highest similarity value. A structure of the LRR family protein is arranged in the successive repetition modules of the LRR family protein. The structure of the fusion protein is expected. A sequence is optimized based on the expected fusion protein structure.

    Abstract translation: 目的:提供一种设计LRR(亮氨酸重复)融合蛋白的方法,通过使用分别包含在不同LRR蛋白中的连接重复模块的序列相似度来设计LRR融合蛋白。 构成:根据计算的相似度值,从LRR家族蛋白中选择一对连续的重复模块。 一对连续的重复模块表示最高相似度值。 LRR家族蛋白的结构排列在LRR家族蛋白的连续重复模块中。 预期融合蛋白的结构。 基于预期的融合蛋白结构优化序列。

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