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公开(公告)号：KR1020160149619A
公开(公告)日：2016-12-28
申请号：KR1020150086897
申请日：2015-06-18
Applicant: 재단법인 전통천연물기반 유전자동의보감 사업단 , 한국과학기술원
Abstract: 본발명에따른단어공기협력병렬검색방법은, 대상텍스트파일을메인서버의분석파일정보에등록하는 (a)단계, 검색하고자하는단어쌍 리스트의각 단어쌍을상기메인서버에미리작업된단어쌍에서검색하는 (b)단계, 상기 (b)단계에서검색된단어쌍을사용자단말기의결과데이터베이스에저장하는 (c)단계, 상기 (b)단계에서검색되지않은단어쌍을개별적으로상기메인서버에서확인하고, 확인결과에따른작업을수행하는 (d)단계및 상기 (d)단계에서검색된단어쌍을사용자단말기의결과데이터베이스에저장하고, 상기메인서버의미리작업된단어쌍으로저장하는 (e)단계를포함하며, 상기 (d)단계는복수의사용자단말기간의작업분산에의해이루어진다.
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公开(公告)号：KR1020160085960A
公开(公告)日：2016-07-19
申请号：KR1020150002650
申请日：2015-01-08
Applicant: 한국과학기술원
Abstract: 대사조절유전자식별을이용한암 예후마커식별장치및 방법이개시된다. 암환자의대사조절과관련된대사효소와대사센서의정보및 상기대사효소와상기대사센서사이에존재하는분자상호작용(molecular interaction)의정보중 적어도하나의정보를수신하는입력부및 수신된정보를기초로대사조절유전자를식별하는제어부를포함하고, 제어부는, 수신된정보를기초로대사조절네트워크로생성하는대사조절네트워크생성부, 생성된대사조절네트워크의가교성(bridgeness) 점수를이용하여각 유전자별로대사조절에관련된유전자들을식별하는대사조절유전자식별부및 식별된유전자들중 암예후마커로사용될유전자개수를산출하여유전자를선별하는대사조절유전자선별부를포함한다.
Abstract translation: 公开了通过使用代谢调节基因的提取来鉴定癌症预后标志物的装置和方法。 该装置包括输入单元，其接收与癌症患者的代谢调节相关的代谢酶和代谢传感器的信息中的至少一个，以及基于所接收的信息识别代谢调节基因的控制单元。 所述控制单元包括基于所接收的信息生成代谢调节网络的代谢调节网络生成单元，通过使用所生成的代谢调节网络的桥接评分来识别与代谢规则有关的基因的代谢调节基因识别单元，以及 代谢调节基因选择单元，其计算用作选择基因的所鉴定基因的癌症预后标记物的基因数目。 因此，可以产生与代谢异常有关的代谢调节网。
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公开(公告)号：KR1020150050211A
公开(公告)日：2015-05-08
申请号：KR1020130131737
申请日：2013-10-31
Applicant: 한국과학기술원
IPC: G06F19/00
CPC classification number: G06F17/10 , G06F21/6245 , G16H10/60
Abstract: 전자의무기록의정보이론을이용한익명화장치, 방법및 기록매체를개시된다. 전자의무기록(Electronic Medical Record, EMR)의데이터가저장된저장부, 저장된데이터의개별속성들에대한엔트로피(entropy)를산출하는엔트로피산출부, 개별속성들을조합하여속성조합들을생성하는속성조합부, 생성된속성조합들에대한결합엔트로피(joint entropy)를산출하는결합엔트로피산출부, 산출된결합엔트로피의의존도를산출하는의존도산출부, 결합엔트로피및 의존도의속성조합들중 기설정된정보손실량보다적은속성조합을선택하는속성조합선택부및 선택된속성조합을기초로 k-재식별방지기법(k-anonymity)을이용하여데이터를익명화하는 k-재식별방지부를포함한다.
Abstract translation: 公开了一种使用电子医疗记录的信息理论的解除识别装置，方法和记录介质。 本发明包括：存储电子医疗记录（EMR）数据的存储部分; 熵计算部分，对所存储的数据的每个属性计算熵; 属性组合部分，其合并每个属性以生成属性组合; 联合熵计算部分，对所生成的属性组合计算联合熵; 依赖计算部分，计算所计算的联合熵的相关性; 属性组合选择部分，在联合熵和依赖性的属性组合之间选择属性组合与信息丢失量小于预设量; 以及使用基于所选择的属性组合的k匿名方法去识别数据的k匿名部分。
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公开(公告)号：KR101171384B1
公开(公告)日：2012-08-10
申请号：KR1020060054869
申请日：2006-06-19
Applicant: 한국과학기술원
Abstract: 본 발명은 유전자의 단계적 발현 네트워크 및 이를 이용한 세포 표식방법에 관한 것으로, 구체적으로 전사조절인자나 유전자에 상보적인 RNA를 이용하여 유전자가 순차적으로 발현되게 하는 유전자의 단계적 발현 네트워크 및 이를 이용하여 형광 단백질을 발현시켜 시간에 따라 발현되는 단백질의 종류를 달리함으로써 세포를 표식하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 발현 네트워크는 유전자 발현의 조절을 시간에 따라 가능케 하여 특정 시간에 단백질이 발현되게 하거나, 시간차를 두고 서로 다른 단백질이 발현되게 함으로써 유전자 치료나, 생물 공학 분야에 이용될 수 있고 세포 표식방법은 세포칩 및 제반기기 없이 대량의 세포 실험(high-throughput cell-based assay)을 수행하는데 이용될 수 있다.
유전자 네트워크, 세포 표식, 순차적 단백질 발현, 유전자 치료, 생물공학, 세포칩-
公开(公告)号：KR100984644B1
公开(公告)日：2010-10-01
申请号：KR1020080006138
申请日：2008-01-21
Applicant: 한국과학기술원
Abstract: 본 발명은 세포 내 목적 단백질의 유도 진화가 가능한 방법에 관한 것으로, 구체적으로 파지 복제기점 및 목적 단백질을 암호화하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 운반체 플라스미드 및 상기 목적 단백질에 의해 작동이 조절되는 프로모터 및 리포터 유전자를 포함하는 선택 플라스미드가 도입된 대장균에 돌연변이 유발물질을 처리하여 목적 단백질의 유전자 서열에 돌연변이를 유도한 후, 하이브리드 헬퍼 파지를 감염시켜 돌연변이 운반체 파지를 수득하고 이를 선택 플라스미드로 형질전환된 대장균에 다시 형질 전환시킨 후 유도 진화된 목적 단백질을 생산하는 형질전환체를 선별하고, 다시 돌연변이 유발물질 처리 후, 배양 및 선별 과정을 반복하는 것을 특징으로 하는 재조합 대장균 세포 내 목적 단백질의 유도 진화 시스템에 관한 것이다. 본 발명의 시스템은 상기 형질전환된 대장균에 반복적으로 돌연변이 유발물질 처리, 배양 및 선별에 의해 신속하고 간단하게 목적 단백질의 유도 진화를 수행할 수 있다.
목적 단백질 유도 진화, 자동화, 헬퍼 파지, 돌연변이, 선별-
Patent Agency Ranking
公开(公告)号：KR1020100102321A
公开(公告)日：2010-09-24
申请号：KR1020090020639
申请日：2009-03-11
Applicant: 한국과학기술원
CPC classification number: G06F19/28 , C12Q1/6869
Abstract: PURPOSE: A system for making customized gene sequence based on gene translation efficiency is provided to quantitatively predict expression level. CONSTITUTION: A system for making customized gene sequence based on gene translation efficiency comprises: an information input unit(110) for receiving gene sequence and information; a gene sequence generator(120) for generating gene sequence based on efficiency level at translation initiation stage; as reasoning unit(130) for efficiency at translation initiation stage; an information output unit(140) which outputs efficiency at translation initiation stage; and a verification unit(150) for checking real expression level of the gene sequence through the information output unit.
Abstract translation: 目的：提供基于基因翻译效率制作定制基因序列的系统，以定量预测表达水平。 构成：基于基因翻译效率制作定制基因序列的系统包括：用于接收基因序列和信息的信息输入单元（110） 用于基于翻译起始阶段的效率水平产生基因序列的基因序列发生器（120）; 作为推理单元（130），用于翻译起始阶段的效率; 在翻译起始阶段输出效率的信息输出单元（140） 以及用于通过信息输出单元检查基因序列的实际表达水平的验证单元（150）。
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公开(公告)号：KR1020090080266A
公开(公告)日：2009-07-24
申请号：KR1020080006138
申请日：2008-01-21
Applicant: 한국과학기술원
Abstract: A method for directed evolution of target protein in a cell is provided to perform treatment, culture and screening of repetitive mutant-inducing agent. A hybrid helper phage has a fusion genome which comprises: a genome DNA of the first phage of which origin of replication is removed; and a genome DNA of the second phage having an origin of replication which is different from the first phage. A directed evolution method of target protein in a cell comprises: a step of preparing carrier plasmid which contains the origin of replication and polynucleotide encoding target protein; a step of selection plasmid containing an antibiotics-resistance gene and promoter; a step of preparing a first transformant and a second transformant; a step of infecting a hybrid helper phage into the second transformant; a step of producing mutant carrier phage; a step of collecting the mutant carrier phage; a step of preparing a third transformant; a step of infecting the mutant carrier phage in the third transformant; a step of culturing the third transformant; and a step of screening single colony.
Abstract translation: 提供了一种靶细胞定向进化的方法，用于进行重复突变诱导剂的治疗，培养和筛选。 混合辅助噬菌体具有融合基因组，其包含：去除其起始点的第一噬菌体的基因组DNA; 和具有不同于第一噬菌体的复制起点的第二噬菌体的基因组DNA。 靶蛋白在细胞中的定向进化方法包括：制备含有复制起点的载体质粒和编码靶蛋白的多核苷酸的步骤; 含有抗生素抗性基因和启动子的选择质粒的步骤; 制备第一转化体和第二转化体的步骤; 将混合辅助噬菌体感染入第二转化体的步骤; 生产突变体载体噬菌体的步骤; 收集突变载体噬菌体的步骤; 制备第三转化体的步骤; 在第三转化体中感染突变载体噬菌体的步骤; 培养第三转化子的步骤; 并筛选单个殖民地的步骤。
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公开(公告)号：KR101842681B1
公开(公告)日：2018-03-28
申请号：KR1020150086904
申请日：2015-06-18
Applicant: 재단법인 전통천연물기반 유전자동의보감 사업단 , 한국과학기술원
IPC: G06F19/26
Abstract: 본발명은대규모생물학적네트워크를자동적으로시각화하는방법및 장치에관한것이다. 구체적으로는복수개의노드및 각노드를연결하는복수개의에지를포함하는생물학적네트워크의시각화방법및 장치에있어서, 사용자가입력한에지목록정보에기초하여상기노드의연결상태를파악하는단계(S100), 사용자가입력한노드목록정보에기초하여상기노드의생물학적특성을파악하는단계(S200), 상기노드의생물학적특성에기초하여상기노드간의생물학적유사성을계산하는단계(S300), 상기노드의연결상태및 상기노드간의생물학적유사성에기초하여상기노드의좌표정보를산출하는단계(S400) 및상기좌표정보에기초하여생물학적네트워크를시각화하는단계(S500)를포함한다.
Abstract translation: 本发明涉及用于自动显现大规模生物网络的方法和设备。 的特别是在多个节点和多个生物网络的可视化的方法和装置的包括是否连接每个节点，边缘列表的基础上，由用户输入的信息了解的节点的连接状态（S100）euroneun的步骤中， （S200），基于用户输入的节点列表信息来识别节点的生物学特性，基于节点的生物学特性计算（S300）节点之间的生物学相似性（S300） 基于节点之间的生物相似性计算节点的坐标信息（S400），并且基于坐标信息使生物网络可视化（S500）。
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公开(公告)号：KR1020170141317A
公开(公告)日：2017-12-26
申请号：KR1020160073969
申请日：2016-06-14
Applicant: 재단법인 전통천연물기반 유전자동의보감 사업단 , 한국과학기술원
Abstract: 본발명의일 실시예에따른신약재창출방법은복수개의유전자정보를포함하는생물학적네트워크를이용한신약재창출방법에관한것으로써, 상기생물학적네트워크에검증하고자하는약물의정보를입력하는단계; 상기생물학적네트워크상에서상기약물의작용유전자및 목표질병과관련된질병유전자사이의최단경로를추출하는단계; 공개된유전체데이터를이용하여상기작용유전자의질병에서의변화상태를측정하는단계; 상기작용유전자, 상기최단경로상에배열된적어도하나의중간유전자및 상기질병유전자의상기약물의전달에따른활성/억제여부를파악하는단계; 및상기최단경로및 상기활성/억제여부에기초하여상기약물및 상기목표질병유전자와의상관관계를수치화하여스코어를산출하는단계;를포함한다.
Abstract translation: 根据本发明实施例的生成新药物的方法涉及使用包括多个基因信息的生物网络生成药物的方法，所述方法包括：输入要在生物网络中验证的药物的信息; 在生物网络上提取药物的作用基因和与目标疾病相关的疾病基因之间的最短路径; 使用公开的基因组数据测量疾病中功能基因的变化状态; 确定活性基因，至少一个排列在最短路径上的中间基因，以及疾病基因是否通过转移药物而被激活/抑制; 并且通过基于最短路径和活性/抑制来量化药物与目标疾病基因之间的相关性来计算分数。
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