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43.发明公开
公开(公告)号：KR1020110020397A
公开(公告)日：2011-03-03
申请号：KR1020090077995
申请日：2009-08-24
Applicant: 삼성전자주식회사
Inventor： 심형섭
Abstract: PURPOSE: A method for error correction using a reed solomon - convolutional concatenated code and an apparatus is provided to improve the reliability of error correction by increasing an error capacity for one time usage. CONSTITUTION: In a method for error correction using a reed solomon - convolutional concatenated code and an apparatus, an apparatus for error correction comprises a viterbi decoder(200), a reed-Solomon decoder(300), and a CRC processing unit(400). The viterbi decoder outputs the RS(Reed Solomon) coding word. The viterbi decoder outputs the elimination position of 2t symbol length in lower order of the reliability of each frame from a plurality of error candidate frame capable of being generated. The reed-solomon decoder generates an error position polynomial by using the elimination position of 2t symbol length. The reed-solomon decoder corrects the error by using generated polynomial. A CRC processing unit detects an error from data having error correction through a CRC calculation.
Abstract translation: 目的：提供一种使用簧片独奏 - 卷积级联代码和装置进行纠错的方法，通过增加一次使用的误差容量来提高纠错的可靠性。 构成：在使用簧片独奏 - 卷积级联代码和装置的纠错方法中，用于纠错的装置包括维特比解码器（200），簧片所罗门解码器（300）和CRC处理单元（400） 。 维特比解码器输出RS（Reed Solomon）编码字。 维特比解码器从能够生成的多个误差候选帧中输出每帧可靠性的较低阶的2t符号长度的消除位置。 簧片独奏解码器通过使用2t符号长度的消除位置产生错误位置多项式。 簧片独奏解码器通过使用生成的多项式来校正误差。 CRC处理单元通过CRC计算从具有纠错的数据中检测错误。
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44.发明授权분별 프로브와 암플리콘 프로브가 고정화되어 있는 ＤＮＡ칩을 이용하여 유전자형을 판별하는 강건한 방법 및 이에사용되는 ＤＮＡ 칩 失效使用具有鉴别探针和固定在其上的扩增子探针的DNA芯片和其中使用的DNA芯片的鲁棒基因分型方法
公开(公告)号：KR100601937B1
公开(公告)日：2006-07-14
申请号：KR1020030097806
申请日：2003-12-26
Applicant: 삼성전자주식회사
CPC classification number: C12Q1/6827 , C12Q1/6837 , G06F19/20 , C12Q2565/501 , C12Q2545/101 , C12Q2535/131
Abstract: 본 발명은 하나이상의 암플리콘을 포함하는 시료에서 각 암플리콘내의 알려진 하나 이상의 돌연변이 위치별로 정상형 유전자 또는 돌연변이형 유전자 중 어떤 유전자가 존재하는지를 확인하기 위해 돌연변이형 유전자 또는 정상형 유전자에 완전히 일치하는 분별 프로브와 상기 각 암플리콘 내의 돌연변이 위치의 뉴클레오티드 서열을 포함하지 않는 영역에 완전히 일치하고 다른 암플리콘 서열에는 존재하지 않는 서열로 구성된 암플리콘 프로브로 이루어진 최적 프로브 세트만이 배열되어 있는 DNA 칩을 사용하여 유전자형을 판별하는 유전자형 판별 방법을 제공한다.
본 발명에 따르면, 사용되는 프로브의 수를 감소시킬 수 있고, 유전자형 판별 결과의 신뢰도를 높일 수 있다.
DNA 칩, 유전자형 판별, 판별 함수, 로지스틱 회귀분석, 사후 확률, 암플리콘 프로브, 분별 프로브-
公开(公告)号：KR100499142B1
公开(公告)日：2005-07-04
申请号：KR1020030005025
申请日：2003-01-25
Applicant: 삼성전자주식회사
CPC classification number: G06F19/18 , C12Q1/6827 , G06F19/20 , C12Q2565/501
Abstract: 본 발명은 DNA 칩을 이용하여 유전자형을 판별하는 강건한 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 유전자형 판별 방법은 각 돌연변이 위치 별로 정상형 유전자에 완전히 일치하는 프로브와 돌연변이형 유전자에 완전히 일치하는 프로브로 이루어진 최적 프로브 쌍만이 배열되어 있는 DNA 칩을 사용한다. 먼저, 유전자형을 이미 알고 있는 표준 핵산을 DNA 칩에 혼성화시켜 얻어진 데이터로부터 유전자형 판별 함수를 설정한다. 이어서, DNA 칩에 유전자형을 모르는 타겟 핵산을 혼성화시켜 얻어진 데이터로부터 입력 벡터를 계산하고 이를 판별 함수에 입력하여 타겟 핵산의 유전자형을 판별한다.
본 발명에 따르면, 각 돌연변이 위치 당 최적의 프로브 쌍을 이용하여 타겟 샘플의 유전자형을 강건하게 통계적으로 판별할 수 있다.-
Patent Agency Ranking46.发明公开분별 프로브와 암플리콘 프로브가 고정화되어 있는 ＤＮＡ칩을 이용하여 유전자형을 판별하는 강건한 방법 및 이에사용되는 ＤＮＡ 칩 失效使用具有鉴定性探针的DNA芯片和使用其的AMPLICON探针的DNA芯片进行稳健基因分型的方法
公开(公告)号：KR1020050066509A
公开(公告)日：2005-06-30
申请号：KR1020030097806
申请日：2003-12-26
Applicant: 삼성전자주식회사
CPC classification number: C12Q1/6827 , C12Q1/6837 , G06F19/20 , C12Q2565/501 , C12Q2545/101 , C12Q2535/131
Abstract: 본 발명은 하나이상의 암플리콘을 포함하는 시료에서 각 암플리콘내의 알려진 하나 이상의 돌연변이 위치별로 정상형 유전자 또는 돌연변이형 유전자 중 어떤 유전자가 존재하는지를 확인하기 위해 돌연변이형 유전자 또는 정상형 유전자에 완전히 일치하는 분별 프로브와 상기 각 암플리콘 내의 돌연변이 위치의 뉴클레오티드 서열을 포함하지 않는 영역에 완전히 일치하고 다른 암플리콘 서열에는 존재하지 않는 서열로 구성된 암플리콘 프로브로 이루어진 최적 프로브 세트만이 배열되어 있는 DNA 칩을 사용하여 유전자형을 판별하는 유전자형 판별 방법을 제공한다.
본 발명에 따르면, 사용되는 프로브의 수를 감소시킬 수 있고, 유전자형 판별 결과의 신뢰도를 높일 수 있다.-
公开(公告)号：KR1020040068396A
公开(公告)日：2004-07-31
申请号：KR1020030005025
申请日：2003-01-25
Applicant: 삼성전자주식회사
CPC classification number: G06F19/18 , C12Q1/6827 , G06F19/20 , C12Q2565/501
Abstract: PURPOSE: A robust genotyping method using DNA chip and DNA chip used therein are provided, thereby robustly detecting genotype of a target sample using selected optimal probe pairs, and improving accuracy of genotyping. CONSTITUTION: The robust genotyping method comprises using DNA chip containing optimal probe pairs consisting of a probe which completely corresponds to the normal gene and a probe which completely corresponds to the mutated gene in each mutation site, wherein two or more of the probe pairs are arrayed in the DNA chip; the optimal probe pairs are selected by the steps of: designing a plurality of different probe pairs consisting of a probe which completely corresponds to the normal gene and a probe which completely corresponds to the mutated gene by using an in-silico method, fixing the different probe pairs on a substrate, hybridizing a standard nucleic acid with the substrate, collecting hybridization intensity data, and selecting one probe pair having the highest value calculated by using an equation using the hybridization intensity data.
Abstract translation: 目的：提供使用DNA芯片和DNA芯片的强大的基因分型方法，从而通过选择的最佳探针对，强化检测目标样本的基因型，提高基因分型的准确性。 构成：强大的基因分型方法包括使用包含完全对应于正常基因的探针的最佳探针对的DNA芯片和完全对应于每个突变位点中的突变基因的探针，其中两个或更多个探针对被排列 在DNA芯片中; 通过以下步骤选择最佳探针对：通过使用计算机方法来设计由完全对应于正常基因的探针组成的多个不同探针对和完全对应于突变基因的探针，固定不同的 探针对，将标准核酸与底物杂交，收集杂交强度数据，并选择使用杂交强度数据通过使用方程式计算的具有最高值的一个探针对。
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公开(公告)号：KR1020030072709A
公开(公告)日：2003-09-19
申请号：KR1020020011871
申请日：2002-03-06
Applicant: 삼성전자주식회사
Inventor： 심형섭
Abstract: PURPOSE: Provided is a method of selecting a genotyping probe set which identifies the difference between the normal target nucleic acid and the mutation target nucleic acid, and even in the case of insertion/deletion, makes the genotyping with a few probes. CONSTITUTION: A method of selecting a genotyping probe set comprises the steps of: hybridizing the normal target nucleic acid and the mutation target nucleic acid, and collecting the hybridization intensity data of the probes thereof; testing the average differences of the probes based on the data, and excepting the probe with no significant difference; computing the false positive error rate where the normal target nucleic acid is falsely classified to be the mutation target one or the false negative error rate where the mutation target nucleic acid is falsely classified to be the normal target one by making a cross validation to the probes; and selecting the probe passing the standard of the false positive or negative error rate.
Abstract translation: 目的：提供一种识别正常靶核酸和突变靶核酸之间的差异的基因分型探针组的方法，即使在插入/缺失的情况下，也用几个探针进行基因分型。 构成：选择基因分型探针组的方法包括以下步骤：将正常靶核酸和突变靶核酸杂交，并收集其探针的杂交强度数据; 基于数据测试探针的平均差异，除探针无显着差异外; 计算正常目标核酸被错误地分类为突变目标核苷酸的假阳性错误率，或通过对探针进行交叉验证将突变靶核酸错误地分类为正常目标核酸的假阴性错误率 ; 并选择通过标准误差误差率的探针。
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