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公开(公告)号：KR100884565B1
公开(公告)日：2009-02-19
申请号：KR1020070031516
申请日：2007-03-30
Applicant: (주)지노믹트리
IPC: C12Q1/68
Abstract: 본 발명은 폐암 특이적인 마커 유전자의 스크리닝 방법, 상기 스크리닝된 유전자를 이용한 폐암 진단용 키트 및 핵산 칩에 관한 것으로, 더욱 자세하게는 폐암 형질전환 세포에서 프로모터 부위가 특이적으로 메틸화되는 폐암 특이적 마커 유전자의 스크리닝 방법, 상기 마커 유전자의 프로모터 메틸화를 확인할 수 있는 폐암 및 폐암 진행단계 진단용 키트 및 핵산 칩에 관한 것이다.
본 발명의 진단용 키트 및 진단용 핵산 칩을 이용하면, 폐암을 초기 형질전환 단계에서 진단할 수 있어, 조기진단이 가능하고, 통상적인 방법보다 정확하고 빠르게 폐암 및 폐암의 진행단계를 진단할 수 있다.
폐암, 메틸화, 메틸화 마커, 폐암진단, 조기진단-
公开(公告)号：KR1020070109811A
公开(公告)日：2007-11-15
申请号：KR1020070031516
申请日：2007-03-30
Applicant: (주)지노믹트리
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q1/6837 , C12Q1/6865 , C12Q2521/301 , C12Q2600/112 , C12Q2600/118 , C12Q2600/154
Abstract: A kit and a nucleic acid chip for diagnosing lung cancer are provided to diagnose the lung cancer at an early transformation step, thereby capable of diagnosing the lung cancer at an early stage and diagnosing the lung cancer and the progressing stages of the lung cancer accurately and rapidly. A method for screening a methylated marker gene capable of identifying the transformation of normal cells into lung cancer cells comprises the steps of: (a) comparing a gene expression list of transformed cells with that of non-transformed cells to identify genes with decreased expression from the transformed cell; (b) treating the transformed cells with a demethylating agent and comparing a gene expression list of the transformed cells with that of transformed cells treated with no a demethylating agent to identify genes with more expressed in the demethylating agent-treated cells; and (c) choosing the genes commonly identified from the steps(a) and (b) as a methylated marker gene. A kit for diagnosing lung cancer or lung cancer progressing stage of a body to be tested comprises a primer for amplifying the screened marker gene and an agent for sensitively cleaving a non-methylated nucleic acid selected from the group consisting of MspI, HpaII, BssHII, BstUI and NotI.
Abstract translation: 提供用于诊断肺癌的试剂盒和核酸芯片，用于在早期转化步骤诊断肺癌，从而能够早期诊断肺癌，并准确诊断肺癌和肺癌进展期， 迅速。 用于筛选能够鉴定正常细胞向肺癌细胞转化的甲基化标记基因的方法包括以下步骤：（a）将转化细胞的基因表达列表与未转化细胞的基因表达列表进行比较，以鉴定来自 转化细胞; （b）用去甲基化试剂处理转化细胞，并比较转化细胞的基因表达列表与用去甲基化试剂处理的转化细胞的基因表达列表，以鉴定在脱甲基化剂处理的细胞中更表达的基因; 和（c）选择通常从步骤（a）和（b）鉴定的基因作为甲基化标记基因。 用于诊断要测试的人体的肺癌或肺癌进展阶段的试剂盒包括用于扩增筛选的标记基因的引物和用于敏感地切割选自MspI，HpaII，BssHII的非甲基化核酸的试剂， BstUI和NotI。
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公开(公告)号：KR1020070107576A
公开(公告)日：2007-11-07
申请号：KR1020070018563
申请日：2007-02-23
Applicant: (주)지노믹트리
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q1/6837 , C12Q2600/112 , C12Q2600/154 , C12Q2600/158 , G01N33/57446
Abstract: A diagnostic kit and chip for gastric cancer are provided to maximize diagnosis accuracy and detect gastric cancer at an initial transformation step by detecting methylation of promoter CpG island by using a gastric cancer-specific methylation marker gene, thereby enabling early diagnosis. A diagnostic kit for gastric cancer comprises primers for amplifying a fragment containing CpG island of a gastric cancer marker gene promoter and endonuclease for digesting unmethylated nucleic acid sensitively, wherein the endonuclease is selected from SmaI, BssHI, HpaII, BSTUI, NotI, SacII and BagI, and the gastric cancer marker gene is screened by (a) comparing gene expressions of transformed cells with those of untransformed cells and confirming genes of which expressions are reduced in the transformed cells, (b) treating the transformed cells with a demethylation agent such as 5 aza 2'-deoxycytidine(DAC), comparing gene expressions of agent-treated transformed cells with those of agent-untreated transformed cells, and confirming genes of which expression are more increased in the agent-treated transformed cells, and (c) selecting the genes commonly confirmed in the steps(a) and (b) as gastric cancer maker genes.
Abstract translation: 提供用于胃癌的诊断试剂盒和芯片，以通过使用胃癌特异性甲基化标记基因检测启动子CpG岛的甲基化从而使早期诊断能够在初始转化步骤中最大化诊断准确度并检测胃癌。 用于胃癌的诊断试剂盒包括用于扩增含有胃癌标记基因启动子的CpG岛的片段的引物和用于敏感地消化未甲基化的核酸的内切核酸酶，其中所述内切核酸酶选自SmaI，BssHI，HpaII，BSTUI，NotI，SacII和BagI （a）将转化细胞的基因表达与未转化细胞的基因表达进行比较，并确认转化细胞中表达降低的确认基因，（b）用去甲基化试剂如 5代氮杂2'-脱氧胞苷（DAC），比较试剂处理的转化细胞的基因表达与药物未处理的转化细胞的基因表达，并确认在药剂处理的转化细胞中哪种表达更高的基因，以及（c）选择 在步骤（a）和（b）中通常证实的基因作为胃癌制造者基因。
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公开(公告)号：KR100590621B1
公开(公告)日：2006-06-19
申请号：KR1020040075359
申请日：2004-09-21
Applicant: (주)지노믹트리
CPC classification number: C12Q1/6853 , C12Q2525/155 , C12Q2521/107 , C12Q2565/501
Abstract: 본 발명은 하이힐 프라이머(high-heel primer)를 이용한 RNA의 선형 증폭방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로는 하이힐 프라이머를 이용하여 어닐링과 신장을 동일한 온도에서 수행하는 것을 특징으로 하는 전체(total) RNA의 선형 증폭방법에 관한 것이다.
본 발명에 따르면, RNA 프라이머를 사용하지 않고 DNA 프라이머를 사용하므로 선형 증폭과정이 매우 안정적이고, RNA의 양과 정제방법에 상관없이 같은 기원의 RNA끼리는 높은 상관도를 나타내므로 적은 양의 샘플도 쉽게 증폭할 수 있다. 또한 하나의 하이힐 프라이머만을 사용하여 나노그램 수준의 전체 RNA로부터 한번의 선형 증폭과정을 거쳐서 마이크로어레이 실험에 충분한 양의 타겟(target)을 확보할 수 있을 뿐만 아니라, 종래의 선형 증폭방법에 비해, 저비용으로 단시간에 고효율의 선형증폭을 달성할 수 있다.
RNA, 선형증폭, 하이힐 프라이머, cDNA, 마이크로어레이Abstract translation: 使用高跟踪引物线性扩增RNA的方法，其中使用高跟引物在相同温度下进行退火和延伸。 使用DNA引物而不是RNA引物，以提供高度稳定的线性扩增方法，其可以容易地扩增甚至少量样品，从而可以从纳克级总RNA获得足够量的用于微阵列测试的靶标 一个使用高跟踪引物的线性扩增过程。 无论RNA量和纯化方法如何，本发明的方法显示出相同来源的RNA之间的高度相关性，并且与现有技术相比在低成本的时间内有效地实现了线性扩增。
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公开(公告)号：KR1020060026568A
公开(公告)日：2006-03-24
申请号：KR1020040075359
申请日：2004-09-21
Applicant: (주)지노믹트리
CPC classification number: C12Q1/6853 , C12Q2521/107 , C12Q2525/155 , C12Q2531/101 , C12Q2565/501
Abstract: 본 발명은 하이힐 프라이머(high-heel primer)를 이용한 RNA의 선형 증폭방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로는 하이힐 프라이머를 이용하여 어닐링과 신장을 동일한 온도에서 수행하는 것을 특징으로 하는 전체(total) RNA의 선형 증폭방법에 관한 것이다.
본 발명에 따르면, RNA 프라이머를 사용하지 않고 DNA 프라이머를 사용하므로 선형 증폭과정이 매우 안정적이고, RNA의 양과 정제방법에 상관없이 같은 기원의 RNA끼리는 높은 상관도를 나타내므로 적은 양의 샘플도 쉽게 증폭할 수 있다. 또한 하나의 하이힐 프라이머만을 사용하여 나노그램 수준의 전체 RNA로부터 한번의 선형 증폭과정을 거쳐서 마이크로어레이 실험에 충분한 양의 타겟(target)을 확보할 수 있을 뿐만 아니라, 종래의 선형 증폭방법에 비해, 저비용으로 단시간에 고효율의 선형증폭을 달성할 수 있다.
RNA, 선형증폭, 하이힐 프라이머, cDNA, 마이크로어레이-
Patent Agency Ranking
公开(公告)号：KR1020040036143A
公开(公告)日：2004-04-30
申请号：KR1020020064955
申请日：2002-10-23
Applicant: (주)지노믹트리
IPC: C12Q1/68
Abstract: PURPOSE: A cancer-diagnostic DNA chip which can detect methylation of primer region in many kinds of genes is provided, thereby rapidly and easily detecting cancer by detecting methylation of primer region in the human tissue or various secreted material samples. CONSTITUTION: A cancer-diagnostic DNA chip is provided, wherein cDNAs of methylated primer regions of one or more genes which are derived from one or more cancer cells and easily methylated are micro-arrayed on a substrate uniformly, wherein the easily methylated gene is cancer inhibition associated gene including BRCA1, BRAC2, MGMT, APC, CDH13, FHIT, MTHER, PTGS2, CACCA, AR, S100A2 and/or SRBC; the methylated promoter region is a PCR product by using the genomic DNA of the cancer tissue cell and a pair of primers specific to the promoter region; the promoter region is hMLH and the pair of primers have the nucleotide sequences set forth in SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 2, respectively; and the promoter region is MAGE and the pair of primers have the nucleotide sequences set forth in SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 4, respectively.
Abstract translation: 目的：提供可以检测多种基因的引物区甲基化的癌症诊断型DNA芯片，通过检测人体组织或各种分泌物质样品中的引物区域的甲基化，快速且容易地检测癌症。 构成：提供了一种癌症诊断型DNA芯片，其中衍生自一种或多种癌细胞并易于甲基化的一种或多种基因的甲基化引物区的cDNA被均匀地微阵列，其中容易甲基化的基因是癌症 抑制相关基因包括BRCA1，BRAC2，MGMT，APC，CDH13，FHIT，MTHER，PTGS2，CACCA，AR，S100A2和/或SRBC; 甲基化启动子区域是通过使用癌组织细胞的基因组DNA和对启动子区域特异性的一对引物的PCR产物; 启动子区域是hMLH，该对引物分别具有SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列; 并且启动子区是MAGE，并且该对引物分别具有SEQ ID NO：3和SEQ ID NO：4所示的核苷酸序列。
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公开(公告)号：KR1020020088838A
公开(公告)日：2002-11-29
申请号：KR1020010027817
申请日：2001-05-21
Applicant: (주)지노믹트리
IPC: C12Q1/68
Abstract: PURPOSE: A hybridization chamber for a DNA microarray system is provided, to prevent a sample from being dried. Therefore, reliability of the experimental results can be secured, and a plurality of glass slides can be hybridized at one time. CONSTITUTION: The hybridization chamber for a DNA microarray system comprises a sliding washing rack(10) consisting of a plurality of parallel fixing bars(16), a plurality of supporting bar(18) in both ends of each parallel fixing bar(16), and a plurality of slots(20) for insertion of slides(S) which are positioned in the inner side of the parallel fixing bars(16); a main body(12) having a space where the sliding washing rack is inserted and an opening in its one side; and a cover(14) which covers the opening of the main body, wherein the supporting bar has a projection where a grip is installed in order to easily handle the sliding washing rack(10) when inserted into the main body.
Abstract translation: 目的：提供用于DNA微阵列系统的杂交室，以防止样品干燥。 因此，可以确保实验结果的可靠性，并且可以一次将多个玻璃载片杂交。 构成：用于DNA微阵列系统的杂交室包括由多个平行固定杆（16），每个平行固定杆（16）两端的多个支撑杆（18）组成的滑动洗涤架（10） 以及用于插入位于所述平行固定杆（16）的内侧中的滑块（S）的多个狭槽（20）。 具有滑动洗涤架插入空间的主体（12）和其一侧的开口; 以及覆盖主体的开口的盖（14），其中，当插入主体时，支撑杆具有安装手柄的突起，以便容易地处理滑动洗涤架（10）。
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公开(公告)号：KR102261606B1
公开(公告)日：2021-06-07
申请号：KR1020190141548
申请日：2019-11-07
Applicant: (주)지노믹트리
IPC: C12Q1/6886
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公开(公告)号：KR1020210055281A
公开(公告)日：2021-05-17
申请号：KR1020190141548
申请日：2019-11-07
Applicant: (주)지노믹트리
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 본발명은대장암진단에정보를제공하는방법, 대장암진단용조성물및 이를포함하는키트에관한것으로, 더욱상세하게는메틸화된복수의대장암마커유전자를특이적으로증폭하는프라이머를이용하여, 대장암진단에정보를제공하는방법, 대장암진단용조성물및 이를포함하는키트에관한것이다.
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