公开(公告)号：KR1020170046315A

公开(公告)日：2017-05-02

申请号：KR1020150146469

申请日：2015-10-21

Applicant: 대한민국(농촌진흥청장)

Inventor： 김창국 ,  설영주 ,  정지웅 ,  박동석 ,  이태호 ,  이동준 ,  김도완 ,  오재현

IPC: G06F19/22 ,  G06F19/28 ,  C12Q1/68

Abstract: 본발명은차세대시퀀싱을이용한분자마커개발방법에관한것으로, 본발명에따른차세대시퀀싱을이용한분자마커개발방법은, 차세대시퀀싱(next generation sequencing)을통해얻은모본과부본의염기서열을생산하거나공개데이터베이스에서상기모본및 부본의염기서열을수집하는단계; 상기모본과부본각각의단일염기서열변이를탐색하기위해상기모본과부본의염기서열을기 알려진참조서열에정렬하여비교하는단계; 상기모본과부본의특이단일염기서열변이를탐색하기위해상기모본과부본의염기서열을비교하는단계; 제한효소에의해상기모본과부본의염기서열이절단여부를확인하는단계; 및상기모본및 부본중 염기서열의절단이있으면, 중합효소연쇄반응을통해시각화하는단계를포함한다. 본발명에따르면, 개체의모본과부본을이용하여각 부모세대의표현형과표현형을나타는유전형을비교하여원하는특정형질에대비되는각 유전자의염기서열에존재하는대립형질이변이되는것을확인할수 있는효과가있다.

Abstract translation: 本发明涉及使用下一代测序，使用下一代测序的分子标记开发方法的分子标记开发方法中，根据本发明，生产或公共数据库mobon由下一代测序获得的对应的核苷酸序列（下一代测序） 收集样品和复制品的核苷酸序列; 设置在一个已知的参考序列和mobon对方来搜索与每个单个碱基序列变异对方mobon的碱基序列的组进行比较; 比较mobon和对应的核苷酸序列，以搜索特定mobon和对应的单个核苷酸的序列变异; 确认样品的碱基序列和拷贝是否被限制酶切断; 而且，如果截断了模板和截短的重链序列，则通过聚合酶链式反应进行可视化。 根据本发明，使用对象的mobon兼副通过比较基因型将显示表型和每个父母的表型是检查的等位基因变异存在于每个基因的DNA序列中，而不是你想要的特定特性 这是有效的。