딥러닝을 이용한 단백질 용매화 자유에너지 예측 장치 및 그 방법

    公开(公告)号:KR102256004B1

    公开(公告)日:2021-05-25

    申请号:KR1020180153612

    申请日:2018-12-03

    Inventor: 함시현 김우현

    Abstract: 본발명은딥러닝을이용한단백질용매화자유에너지예측장치및 방법에대한것이다. 본발명에따르면, JPEG112018120822019-pat00073.jpg52-헬릭스구조를가지는 HP35 단백질과 JPEG112018120822019-pat00074.jpg52-시트구조를가지는 WW도메인단백질에대한데이터를입력받는데이터입력부, 상기입력된 HP35 단백질과 WW도메인단백질에대한데이터를이용하여단백질의 3D구조에대한용매화자유에너지를산출하는단백질용매화자유에너지산출부, 상기단백질데이터에포함된원자좌표를이용하여단백질을구성하는원자간의거리를계산하고, 계산된거리값을이용하여 HP35 단백질과 WW도메인단백질에대한각각의접촉맵을생성하는접촉맵생성부, 특정반경의구체를사용하여분자의표면을조사하는롤링볼 알고리즘(Rolling ball algorithm)을적용하여단백질을구성하는잔기별용제접근가능표면영역(SASA)값을산출하는 SASA산출부, 그리고상기생성된접촉맵과계산된용제접근가능표면영역값을 DNN(Deep Neural Networks) 모델의입력층에입력하여용매화자유에너지를예측하는예측부를포함한다.

    단백질의 아미노산 잔기 주변 환경을 3차원 이미지로 생성하는 장치 및 그 방법

    公开(公告)号:KR102199500B1

    公开(公告)日:2021-01-06

    申请号:KR1020180153613

    申请日:2018-12-03

    Inventor: 함시현 김우현

    Abstract: 본발명은단백질의아미노산잔기주변환경을 3차원이미지로생성하는장치및 그방법에대한것이다. 본발명에따르면, 단백질에대한구조데이터를입력받는단백질데이터입력부, 상기입력된단백질구조데이터를이용하여단백질을구성하는각각의잔기에포함된원자간의거리를계산하고, 계산된거리값을이용하여잔기에대한그룹을형성하는그룹형성부, 상기형성된그룹내에포함되며, 각각의잔기의기본구성이되는 JPEG112018120822154-pat00148.jpg55, N, C의원자를 3차원의공간좌표에표시하는공간좌표표시부, 그리고상기 3차원공간좌표에상기그룹을형성하는모든원자들을표시하는 3차원이미지변환부를포함포함한다. 이와같이본 발명에따르면, 단백질의아미노산잔기와그 주변환경을표현하는 3차원이미지를생성함으로써데이터분석및 인공지능모델을학습할 수있는데이터로사용할수 있으므로인공지능융합의새로운가능성을열어줄원료로제공될수 있는효과를지닌다.

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