公开(公告)号：KR100592086B1

公开(公告)日：2006-06-21

申请号：KR1020040055685

申请日：2004-07-16

Applicant: 아주대학교산학협력단

Inventor： 김재훈 ,  이수진 ,  이원태 ,  김민준 ,  박상민 ,  이성준 ,  이민지

IPC: G06F17/00 ,  G06F9/44

Abstract: 본 발명은 적응적인 가중치 보팅 알고리즘을 적용한 단백질 이차 구조 예측 방법에 관한 것으로서, 다수의 단백질 이차 구조 예측 프로그램을 통해 단백질의 이차 구조가 알려진 단백질의 서열을 입력값으로 하여 단백질의 이차 구조를 예측하되, 각각의 프로그램별로 예측된 단백질의 이차 구조가 알려진 단백질의 이차 구조에 일치하는 비율에 따라 산출된 정확도를 바탕으로 예측되는 결과에 대한 신뢰 정도를 나타내는 신뢰도를 산출하여 저장하는 학습 프로세스 과정과, 특정 단백질의 서열에 대한 단백질의 이차 구조 요청시 다수의 프로그램을 이용하여 단백질의 이차 구조를 예측하되, 저장된 각각의 프로그램별 신뢰도에 따른 가중치를 예측된 결과치에 적용하여 보팅하는 가중치 보팅 프로세스 과정을 포함한 것을 특징으로 한다.
본 발명에 따르면, 미리 학습되어 구축된 다수 모듈의 신뢰도에 대한 로그 파일을 이용하되 모듈별로 예측된 결과치에 대해 신뢰도에 따른 가중치를 다르게 적용하여 보팅을 행함으로써 단백질의 이차 구조를 보다 정확하게 예측할 수 있다.
모듈, 로그 파일, 가중치 보팅, 단백질 서열, 단백질 이차 구조, 예측

Abstract translation: 但是，本发明能够预测自适应权重的二级结构涉及应用所述表决算法的蛋白质二级结构预测方法，用于蛋白质蛋白质二级结构预测程序以通过蛋白质已知蛋白质作为通过输入的二级结构的序列的数目， 学习过程而通过计算指示是基于根据与对应于已知的蛋白质的二级结构的比例的计算精度预测每个程序的预测的蛋白的二级结构的结果的置信水平的可靠性节省，特异性蛋白 但使用大量的蛋白与蛋白的预测的二级结构的序列的需求二级结构的程序，作为对结果的应用程序的预测根据存储其特征在于每个节目信誉包括加权投票过程，投票的过程的重 它应。

公开(公告)号：KR100489955B1

公开(公告)日：2005-05-16

申请号：KR1020020060678

申请日：2002-10-04

Applicant: 아주대학교산학협력단

Inventor： 김재훈 ,  김민준 ,  이성준 ,  임성화 ,  박상민 ,  이수진

IPC: G06F17/30 ,  G06F19/28

Abstract: 본 발명은 사용자 그룹핑을 이용한 생물정보학에서의 데이터베이스 처리 방법에 관한 것으로서, 생물정보학 관련 서열정보를 저장하는 데이터베이스와 연동하고 일정 통신 네트워크를 통해 각 사용자 단말과 접속하는 서버에서 상기 데이터베이스를 처리하는 방법에 관한 것이다.
이러한 본 발명은, 사용자 단말로부터 서비스 요청된 서열을 수신하여 큐에 저장하고, 일정 주기 D마다 현재 큐에 저장되어 있는 사용자 요청을 전달한 후 큐를 초기화함으로써 사용자 요청을 그룹핑하는 사용자 요청 접수단계; 및 사용자 요청 접수단계에서 전달되는 사용자 요청을 수신하면 데이터베이스를 한번 액세스한 후, 수신한 각 사용자 요청의 서열을 데이터베이스에서 액세스한 서열과 비교/분석하는 서열 비교/분석 단계를 포함하는 것을 특징으로 한다.
본 발명을 사용하면, 한 주기 동안 모아진 사용자 요청을 다음 주기에 일괄적으로 처리하되, 주기마다 단 한번만 데이터베이스를 액세스하므로 생물정보학 관련 정보를 제공하는 시스템의 비용을 줄일 수 있다. 이에 따라 종래의 방식에 비해서 많은 사용자 요청을 처리할 수 있게 되는 효과가 있다.

公开(公告)号：KR1020060006584A

公开(公告)日：2006-01-19

申请号：KR1020040055685

申请日：2004-07-16

Applicant: 아주대학교산학협력단

Inventor： 김재훈 ,  이수진 ,  이원태 ,  김민준 ,  박상민 ,  이성준 ,  이민지

IPC: G06F17/00 ,  G06F9/44

CPC classification number: G06F19/10 ,  G06F17/10 ,  G06F19/16

Abstract: 본 발명은 적응적인 가중치 보팅 알고리즘을 적용한 단백질 이차 구조 예측 방법에 관한 것으로서, 다수의 단백질 이차 구조 예측 프로그램을 통해 단백질의 이차 구조가 알려진 단백질의 서열을 입력값으로 하여 단백질의 이차 구조를 예측하되, 각각의 프로그램별로 예측된 단백질의 이차 구조가 알려진 단백질의 이차 구조에 일치하는 비율에 따라 산출된 정확도를 바탕으로 예측되는 결과에 대한 신뢰 정도를 나타내는 신뢰도를 산출하여 저장하는 학습 프로세스 과정과, 특정 단백질의 서열에 대한 단백질의 이차 구조 요청시 다수의 프로그램을 이용하여 단백질의 이차 구조를 예측하되, 저장된 각각의 프로그램별 신뢰도에 따른 가중치를 예측된 결과치에 적용하여 보팅하는 가중치 보팅 프로세스 과정을 포함한 것을 특징으로 한다.
본 발명에 따르면, 미리 학습되어 구축된 다수 모듈의 신뢰도에 대한 로그 파일을 이용하되 모듈별로 예측된 결과치에 대해 신뢰도에 따른 가중치를 다르게 적용하여 보팅을 행함으로써 단백질의 이차 구조를 보다 정확하게 예측할 수 있다.
모듈, 로그 파일, 가중치 보팅, 단백질 서열, 단백질 이차 구조, 예측

公开(公告)号：KR1020040031291A

公开(公告)日：2004-04-13

申请号：KR1020020060678

申请日：2002-10-04

Applicant: 아주대학교산학협력단

Inventor： 김재훈 ,  김민준 ,  이성준 ,  임성화 ,  박상민 ,  이수진

IPC: G06F17/30 ,  G06F19/28

Abstract: PURPOSE: A method for processing a database on bioinformatics using user grouping is provided to reduce a response time and system expense by reducing access frequency of the data as collectively processing user's requests gathered in each access cycle. CONSTITUTION: The users requests are grouped by storing a service requested sequence received from a user terminal in a queue, transferring the service requested sequences stored in the queue for each cycle, and initializing the queue(S10). If the service requested sequences are received, respective service requested sequences are analyzed/compared with the sequence accessed at the database after accessing the database once(S20).

Abstract translation: 目的：提供一种使用用户分组处理生物信息学数据库的方法，以通过减少数据的访问频率来缩小响应时间和系统开销，以集体处理在每个访问周期内收集的用户请求。 构成：通过将从用户终端接收到的服务请求序列存储在队列中，对每个周期传送存储在队列中的服务请求序列，并初始化队列，对用户请求进行分组（S10）。 如果接收到服务请求的序列，则在访问数据库一次之后，将各服务请求的序列与数据库上访问的序列进行分析/比较（S20）。