公开(公告)号：KR101666506B1

公开(公告)日：2016-10-14

申请号：KR1020150052999

申请日：2015-04-15

Applicant: 재단법인대구경북과학기술원

Inventor： 김민수 ,  구재형 ,  김혜린 ,  강나나 ,  전강욱 ,  김선호

IPC: G06F19/20 ,  C12Q1/68

CPC classification number: G06F19/20

Abstract: 본발명은주어진서열데이터베이스에대해사용자에의해주어진여러필터링제약조건들을만족하고그 특이성(Specificity)이검증된유효한모든커버리지(Coverage)의프라이머쌍들을디자인하는방법에관한것으로, 주어진 DNA 서열데이터베이스상에존재하는모든적합한프라이머쌍들을빠짐없이구하며, 커버리지(coverage)가 1인프라이머들뿐만아니라커버리지가 1보다큰 프라이머들도모두구함으로써, 사용자가결과프라이머들중 생물학적실험의성공률이높은프라이머들을쉽게선택할수 있도록프라이머랭킹을부여할수 있도록한 것이다.

公开(公告)号：KR101912555B1

公开(公告)日：2018-10-26

申请号：KR1020180011154

申请日：2018-01-30

Applicant: 재단법인대구경북과학기술원

Inventor： 김민수 ,  김혜린 ,  구재형 ,  강나나 ,  안규현

IPC: G06F19/28 ,  G06F19/20 ,  C12Q1/68

Abstract: 본발명은유전자에관한질의어및 프라이머에관한필터링제약조건들을수신하고, 질의어에기초하여, 미리구비된유전자정보색인으로부터적어도하나의염기서열의식별자를검색하고, 적어도하나의염기서열의식별자에기초하여, 특이성조건을만족하도록미리구비된후보프라이머집합의색인으로부터적어도하나의후보프라이머를검색하고, 필터링제약조건들에기초하여, 적어도하나의후보프라이머를필터링하고, 필터링결과에기초하여, 질의어및 필터링제약조건들을만족하는프라이머쌍에관한정보를제공할수 있다.

公开(公告)号：KR20180015690A

公开(公告)日：2018-02-13

申请号：KR20180011154

申请日：2018-01-30

Applicant: 재단법인대구경북과학기술원

Inventor： 김민수 ,  김혜린 ,  구재형 ,  강나나 ,  안규현

IPC: G06F19/28 ,  C12Q1/68 ,  G06F19/20

CPC classification number: G06F19/28 ,  C12Q1/6811 ,  G06F19/20

Abstract: 본발명은유전자에관한질의어및 프라이머에관한필터링제약조건들을수신하고, 질의어에기초하여, 미리구비된유전자정보색인으로부터적어도하나의염기서열의식별자를검색하고, 적어도하나의염기서열의식별자에기초하여, 특이성조건을만족하도록미리구비된후보프라이머집합의색인으로부터적어도하나의후보프라이머를검색하고, 필터링제약조건들에기초하여, 적어도하나의후보프라이머를필터링하고, 필터링결과에기초하여, 질의어및 필터링제약조건들을만족하는프라이머쌍에관한정보를제공할수 있다.

Abstract translation: 本发明用于接收和过滤器约束条件与查询相关短语和所述基因的引物，以及基于所述查询，并搜索至少一个核苷酸序列的从预先提供的遗传信息索引，基于该至少一个碱基序列的标识符的标识符 为了从预先建立以满足奇异性条件的候选引物组的索引中搜索至少一个候选引物，基于过滤约束条件来过滤至少一个候选引物， 可以提供关于满足过滤约束的引物对的信息。