公开(公告)号：KR1020070105437A

公开(公告)日：2007-10-31

申请号：KR1020060037537

申请日：2006-04-26

Applicant: 한국화학연구원

Inventor： 장현주 ,  공기정 ,  박찬현 ,  올리버와르쉬코우

IPC: G06F17/50

CPC classification number: G06F17/5009 ,  Y10S977/742

Abstract: A system and a method for combining multi-scale simulations are provided to combine/apply QM and MM according to the applied system by developing a general QM/MM combining algorithm irrespective of predetermined QM/MM methodology. An input device receives QM/MM method selection, a molecular structure of whole system, and the molecular structure of a cluster. An operator calculates based on input data of the input device. An output device outputs a position of a molecule in the whole system, and the molecular and electric structure in a cluster area as a calculation result of the operator. The operator comprises a cluster area selector(101), a link molecule generator(103) joining the QM and the MM, a QM/MM energy and power calculator(104), a molecular energy and power calculator(105), and a structure optimizing module(106) finding the molecular structure minimizing whole energy.

Abstract translation: 提供了一种用于组合多尺度模拟的系统和方法，通过开发一般的QM / MM组合算法，与预定的QM / MM方法无关，根据所应用的系统组合/应用QM和MM。 输入设备接收QM / MM方法选择，整个系统的分子结构和簇的分子结构。 操作者根据输入设备的输入数据进行计算。 输出装置输出整个系统中的分子的位置，以及在区域中的分子和电结构作为操作者的计算结果。 运营商包括：集群区域选择器（101），连接QM和MM的链路分子发生器（103），QM / MM能量和功率计算器（104），分子能量和功率计算器（105） 优化模块（106）找到最小化整个能量的分子结构。

公开(公告)号：KR100783331B1

公开(公告)日：2007-12-10

申请号：KR1020060037537

申请日：2006-04-26

Applicant: 한국화학연구원

Inventor： 장현주 ,  공기정 ,  박찬현 ,  올리버와르쉬코우

IPC: G06F17/50

Abstract: 본 발명은 멀티스케일 시뮬레이션 결합을 위한 시스템 및 방법에 관한 것으로서, 더욱 상세하게는 양자모델링과 원자모델링의 서로 다른 스케일을 다루는 시뮬레이션 방법을 결합하는 멀티스케일에 관한 것이다.
이를 위해, 본 발명은 QM 및 MM 프로그램의 선택 단계와; 계산하고자 하는 시스템의 원자의 위치 및 QM을 적용하고자 하는 크러스터 1의 원자 위치를 입력시키는 단계와; QM이 적용되는 크러스터 1의 원자 위치가 주어질 때, QM 영역과 MM 영역을 이어주는 링크 원자 위치를 생성하여 계산에 필요한 크러스터 2의 원자위치를 생성하는 단계와; 생성된 시스템의 원자구조와 상기 크러스터 2에 대한 QM과 MM 프로그램의 입력 파일을 생성하는 단계와; 생성된 QM과 MM 프로그램의 입력 파일을 독자적으로 구동시켜 원자 위치에 따른 에너지 값과 힘 값을 계산하는 단계와; 계산된 에너지 값에서 Subtractive scheme에 의한 전체 에너지를 계산하고 전체 에너지를 최소화하는 원자구조를 찾는 원자구조 최적화 단계; 로 이루어지는 것을 특징으로 하는 멀티스케일 시뮬레이션 결합을 위한 시스템 및 방법을 제공한다.
멀티스케일, QM, MM, 크러스터, 시뮬레이션, 결합 시스템 및 방법, 원자모델링, 양자모델링