利用miRNA827基因预报水稻白叶枯病的方法

    公开(公告)号:CN104141005B

    公开(公告)日:2016-03-09

    申请号:CN201410309695.1

    申请日:2014-06-30

    Applicant: 江汉大学

    Inventor: 王沁 张继 彭海

    Abstract: 本发明公开了利用miRNA827基因预报水稻白叶枯病的方法,属于生物技术领域。所述方法包括以下步骤:选取待测水稻和对照水稻,选取的所述对照水稻为未感染白叶枯病但与待测水稻在相同条件下栽培的水稻;分别分离所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因;分别检测所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因中的miRNA827基因的表达量,所述miRNA827基因的序列如序列表中SEQ ID NO:1所示;根据所述待测水稻和所述对照水稻中的miRNA827基因的表达量,判断实验是否成功,若成功,进一步判定所述待测植株是否感染白叶枯病。本发明提供的预测方法获得了成功,可以在水稻白叶枯病症出现前数天实现准确预报,为早防早治赢得了时间,减少了白叶枯病对水稻造成的损失。

    利用miRNA162b基因早期精确预报水稻白叶枯病的方法

    公开(公告)号:CN104131083B

    公开(公告)日:2016-02-17

    申请号:CN201410307328.8

    申请日:2014-06-30

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了利用miRNA162b基因早期精确预报水稻白叶枯病的方法,属于生物技术领域。所述方法包括以下步骤:选取待测水稻和对照水稻,选取的所述对照水稻为未感染白叶枯病但与待测水稻在相同条件下栽培的水稻;分别分离所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因;分别检测所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因中的miRNA162b基因的表达量,所述miRNA162b基因的序列如序列表中SEQ ID NO:1所示;根据所述待测水稻和所述对照水稻中的miRNA162b基因的表达量,判断实验是否成功,若成功,进一步判定所述待测植株是否感染白叶枯病。本发明提供的预测方法获得了成功,可以在水稻白叶枯病症出现前数天实现准确预报,为早防早治赢得了时间,减少了白叶枯病对水稻造成的损失。

    一种测试植物品种实质性派生关系的方法

    公开(公告)号:CN104805185A

    公开(公告)日:2015-07-29

    申请号:CN201510148657.7

    申请日:2015-03-31

    Abstract: 本发明公开了一种测试植物品种实质性派生关系的方法。该方法包括:获得变异位点;确定测试区域;抽样提取并获得抽样样本的DNA;制备引物;利用所述引物分别对两个抽样样本的DNA进行扩增,分别得到两个待测品种在测试区域的扩增产物用于构建两个待测品种的高通量测序文库;对两个高通量测序文库分别进行高通量测序,分别得到两个所述待测品种的测序片段组;分析两个测序片段组,分别获得两个待测品种基因型;比较两个待测品种基因型,获得待测品种间差异基因型的比例;根据待测品种间差异基因型的比例,判断两个待测品种的实质性派生关系。该方法能够准确、快速且简单地判断待测品种间的实质性派生关系。

    一种监控总RNA中线状RNA消除的方法

    公开(公告)号:CN104328185A

    公开(公告)日:2015-02-04

    申请号:CN201410606600.2

    申请日:2014-10-31

    Applicant: 江汉大学

    CPC classification number: C12Q1/6844 C12Q2561/101

    Abstract: 本发明公开了一种监控总RNA中线状RNA消除的方法。所述方法包括:人工合成外源线性ERCC-0004-RNA和外源环状ERCC-0013-RNA;对外源环状ERCC-0013-RNA进行质量控制;将外源线性ERCC-0004-RNA和外源环状ERCC-0013-RNA按等摩尔比混合,得到混合外源RNA;向待检样本的总RNA中加入混合外源RNA,得到第一混合物;去除第一混合物中的核糖体RNA,得到第二混合物;去除第二混合物中的线性RNA,线性RNA包括总RNA中的线性RNA和外源线性ERCC-0004-RNA,得到第三混合物;分别检测第一混合物和第三混合物中的外源线性ERCC-0004-RNA和外源环状ERCC-0013-RNA的含量;根据含量计算总RNA中线性RNA的去除比例。所述方法能够有效监控总RNA中线性RNA的去除程度。

    利用miRNA827基因预报水稻白叶枯病的方法

    公开(公告)号:CN104141005A

    公开(公告)日:2014-11-12

    申请号:CN201410309695.1

    申请日:2014-06-30

    Applicant: 江汉大学

    Inventor: 王沁 张继 彭海

    CPC classification number: C12Q1/6895 C12Q2600/158 C12Q2600/178

    Abstract: 本发明公开了利用miRNA827基因预报水稻白叶枯病的方法,属于生物技术领域。所述方法包括以下步骤:选取待测水稻和对照水稻,选取的所述对照水稻为未感染白叶枯病但与待测水稻在相同条件下栽培的水稻;分别分离所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因;分别检测所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因中的miRNA827基因的表达量,所述miRNA827基因的序列如序列表中SEQ ID NO:1所示;根据所述待测水稻和所述对照水稻中的miRNA827基因的表达量,判断实验是否成功,若成功,进一步判定所述待测植株是否感染白叶枯病。本发明提供的预测方法获得了成功,可以在水稻白叶枯病症出现前数天实现准确预报,为早防早治赢得了时间,减少了白叶枯病对水稻造成的损失。

    一种利用miRNA1430基因预报水稻白叶枯病的方法

    公开(公告)号:CN104141004A

    公开(公告)日:2014-11-12

    申请号:CN201410309693.2

    申请日:2014-06-30

    Applicant: 江汉大学

    Inventor: 王沁 张继 彭海

    CPC classification number: C12Q1/6895 C12Q2600/158 C12Q2600/178

    Abstract: 本发明公开了一种利用miRNA1430基因预报水稻白叶枯病的方法,属于生物技术领域。所述方法包括以下步骤:选取待测水稻和对照水稻,选取的所述对照水稻为未感染白叶枯病但与待测水稻在相同条件下栽培的水稻;分别分离所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因;分别检测所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因中的miRNA1430基因的表达量,所述miRNA1430基因的序列如序列表中SEQ ID NO:1所示;根据所述待测水稻和所述对照水稻中的miRNA1430基因的表达量,判断实验是否成功,若成功,进一步判定所述待测植株是否感染白叶枯病。本发明提供的预测方法获得了成功,可以在水稻白叶枯病症出现前数天实现准确预报,为早防早治赢得了时间,减少了白叶枯病对水稻造成的损失。

    一种油菜亲本来源真实性及其比例测试新方法

    公开(公告)号:CN104878085A

    公开(公告)日:2015-09-02

    申请号:CN201510162194.X

    申请日:2015-04-08

    Abstract: 本发明公开了一种油菜亲本来源真实性及其比例测试新方法,属于生物技术领域。所述方法包括:获得不同油菜品种间的变异位点;根据所述变异位点确定测试区域;提取抽样样本的DNA;制备测试区域PCR引物;构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,获得测序片段组;分析测序片段组,获得待测油菜品种基因型和亲本基因型;根据待测油菜品种基因型和亲本基因型,判断待测油菜品种的亲本来源的真实性并计算亲本来源的比例。所述方法能够准确、快速且简单地判断亲本来源真实性及其比例。

    一种高通量环状RNA测序的方法

    公开(公告)号:CN104388548A

    公开(公告)日:2015-03-04

    申请号:CN201410604748.2

    申请日:2014-10-31

    Applicant: 江汉大学

    CPC classification number: C12Q1/6806 C12Q1/6869 C12Q2521/327 C12Q2523/308

    Abstract: 本发明公开了一种高通量环状RNA测序的方法,属于分子生物学领域。该方法包括:人工合成外源线性ERCC-0004-RNA和外源环状ERCC-0013-RNA;对外源环状ERCC-0013-RNA进行质量控制;将外源线性ERCC-0004-RNA和外源环状ERCC-0013-RNA按等摩尔比混合,得到混合外源RNA;向待测序样本的总RNA中加入混合外源RNA,得到第一混合物;去除第一混合物中的核糖体RNA,得到第二混合物;对第二混合物进行3’末端生物素标记,并去除标记上生物素的套索RNA及线性RNA,得到第三混合物;去除第三混合物中的线性RNA,得到第四混合物;对第四混合物进行标准的高通量转录组测序并对测序数据进行生物学分析。本发明能够准确反映出生物体内的基因在特定条件下的表达情况,降低了的成本。

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