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公开(公告)号:CN112501343A
公开(公告)日:2021-03-16
申请号:CN202011509639.4
申请日:2020-12-19
Applicant: 中国农业科学院油料作物研究所 , 江汉大学 , 武汉中油科技新产业有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及油菜品种分子鉴定领域,公开了一种与油菜品种鉴定及实质性派生品种判定的核苷酸序列及应用。申请人通过对甘蓝型油菜19份DH纯系,基因组重测序及生物信息学分析,挑选出油菜基因组均匀分布的511对MNP标记引物,对检测材料进行多重扩增、二代高通量测序与数据分析,实现了一次实验检测19*511=9709个标记的检测,从每个品种中平均可检测出484个(95%)MNP标记,检出标记数远超现有SSR标记,且检出率高。对其中5份样品经由不同人、仪器和时间分3次独立检测,实现样品MNP标记基因型差异对数为0,准确性为100%。我们开发的一套油菜MNP标记引物组合,可以有效区分油菜品种及其实质性派生品种。
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公开(公告)号:CN105713967B
公开(公告)日:2020-06-16
申请号:CN201610060835.5
申请日:2016-01-29
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/04 , C12Q1/06
Abstract: 本发明公开了一种水体微生物定性与定量的检测方法,属于生物技术领域。所述方法包括以下步骤:确定待测样品中的目标微生物类群、目标微生物和非目标生物、以及不存在于所述待测样品中的参考微生物;设计目标微生物类群与目标微生物的特征区域;设计特征区域的多重扩增引物;在待测样品中加入参考微生物与外源核酸后,提取待测样品中的微生物的核酸;利用设计的多重引物扩增微生物核酸,扩增获得特征测序片段;利用特征测序片段定性、定量分析待测样品中微生物。本发明不需要对微生物进行预培养与增殖,可以一次性地对待测样品中的多种已知微生物进行高通量、高准确度、高分辨率的检测,检测过程简单、快速且流程规范。
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公开(公告)号:CN106520961B
公开(公告)日:2020-03-27
申请号:CN201611030504.3
申请日:2016-11-16
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了一种玉米微卫星标记位点开发方法与微卫星标记位点内的微卫星标记的长度检测方法。所述开发方法包括:获得混合样本;提取混合样本的基因组;将基因组片段化,获得基因组片段;利用探针组分别与基因组片段进行杂交;纯化多个杂交溶液中成功杂交的基因组片段;将多个所述纯化的杂交基因组片段混合后,利用高通量测序检测所述纯化的基因组片段;获得有效的所述高通量测序片段;将所述有效的高通量测序片段进行分类。所述检测方法包括:选择待检测的微卫星标记位点;利用多重扩增引物扩增所述待检测的微卫星标记位点内的微卫星标记,获得所述微卫星标记位点内的微卫星标记的长度。上述方法简单、快速、全面且准确。
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公开(公告)号:CN105586414B
公开(公告)日:2020-03-17
申请号:CN201610060910.8
申请日:2016-01-29
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种水稻微生物耐药性基因的检测方法。所述方法包括:确定耐药性基因、内源标准基因和外源标准基因;制备多重扩增引物;向待测样品中加入外源核酸,得到混合样品并提取基因组;向基因组中加入外源标准基因,获得混合核酸;扩增混合核酸,利用扩增产物构建高通量测序文库并进行高通量测序,得到测序片段组;分析所述测序片段组,并根据获得的外源标准基因和内源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功;若实验成功,则计算耐药性基因的含量;根据耐药性基因的含量判定待测样品是否含有耐药性基因。所述方法可以一次性定量检测任意微生物中的任意多种希望检测的耐药性基因,且检测不需要培养与纯化微生物,速度快,结果准确可靠。
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公开(公告)号:CN106916818B
公开(公告)日:2020-01-31
申请号:CN201710175384.4
申请日:2017-03-22
Applicant: 江汉大学
IPC: C12N15/113 , C12N15/10 , C12N15/82 , C12N1/21
Abstract: 本发明公开了一种干旱诱导型启动子、其制备方法、重组表达载体及转化子,属于植物基因工程技术领域。所述干旱诱导型启动子的序列如序列表中SEQ ID NO.1所示。所述方法包括:提取植物的基因组DNA;将所述基因组DNA通过如序列表中SEQ ID NO:2所示的上游引物和SEQ ID NO:3所示的下游引物进行PCR扩增,得到PCR扩增产物,即所述干旱诱导型启动子。所述干旱诱导型植物的重组表达载体包括:上述的干旱诱导型启动子。所述转化子包括上述的干旱诱导型启动子。本发明实施例提供的pBdDREB启动子具有高效干旱诱导活性。
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公开(公告)号:CN105603080B
公开(公告)日:2020-01-31
申请号:CN201610061034.0
申请日:2016-01-29
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种非诊断目的的血液微生物耐药性基因的检测方法。所述方法包括:确定耐药性基因、内源标准基因和外源标准基因;制备多重扩增引物;向待测样品中加入外源核酸,得到混合样品并提取基因组;向基因组中加入外源标准基因,获得混合核酸;扩增混合核酸,利用扩增产物构建高通量测序文库并进行高通量测序,得到测序片段组;分析所述测序片段组,并根据获得的外源标准基因和内源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功;若实验成功,则计算耐药性基因的含量;根据耐药性基因的含量判定待测样品是否含有耐药性基因。所述方法可以一次性定量检测任意微生物中的任意多种希望检测的耐药性基因,且检测不需要培养与纯化微生物,速度快,结果准确可靠。
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公开(公告)号:CN105586417B
公开(公告)日:2020-01-31
申请号:CN201610061033.6
申请日:2016-01-29
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种玉米微生物耐药性基因的检测方法。所述方法包括:确定耐药性基因、内源标准基因和外源标准基因;制备多重扩增引物;向待测样品中加入外源核酸,得到混合样品并提取基因组;向基因组中加入外源标准基因,获得混合核酸;扩增混合核酸,利用扩增产物构建高通量测序文库并进行高通量测序,得到测序片段组;分析所述测序片段组,并根据获得的外源标准基因和内源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功;若实验成功,则计算耐药性基因的含量;根据耐药性基因的含量判定待测样品是否含有耐药性基因。所述方法可以一次性定量检测任意微生物中的任意多种希望检测的耐药性基因,且检测不需要培养与纯化微生物,速度快,结果准确可靠。
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公开(公告)号:CN106520954B
公开(公告)日:2019-12-31
申请号:CN201611021778.6
申请日:2016-11-16
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/6874 , C12Q1/6895 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种棉花微卫星标记位点开发方法与微卫星标记位点内的微卫星标记的长度检测方法。所述开发方法包括:获得混合样本;提取混合样本的基因组;将基因组片段化,获得基因组片段;利用探针组分别与基因组片段进行杂交;纯化多个杂交溶液中成功杂交的基因组片段;将多个所述纯化的杂交基因组片段混合后,利用高通量测序检测所述纯化的基因组片段;获得有效的所述高通量测序片段;将所述有效的高通量测序片段进行分类。所述检测方法包括:选择待检测的微卫星标记位点;利用多重扩增引物扩增所述待检测的微卫星标记位点内的微卫星标记,获得所述微卫星标记位点内的微卫星标记的长度。上述方法简单、快速、全面且准确。
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公开(公告)号:CN105567831B
公开(公告)日:2019-07-23
申请号:CN201610061063.7
申请日:2016-01-29
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6851 , C12Q1/04 , C12Q1/06
Abstract: 本发明公开了一种食品微生物定性与定量的检测方法,属于生物技术领域。所述方法包括以下步骤:确定待测样品中的目标微生物类群、目标微生物和非目标生物、以及不存在于所述待测样品中的参考微生物;设计目标微生物类群与目标微生物的特征区域;设计特征区域的多重扩增引物;在待测样品中加入参考微生物与外源核酸后,提取待测样品中的微生物的核酸;利用设计的多重引物扩增微生物核酸,扩增获得特征测序片段;利用特征测序片段定性、定量分析待测样品中微生物。本发明不需要对微生物进行预培养与增殖,可以一次性地对待测样品中的多种已知微生物进行高通量、高准确度、高分辨率的检测,检测过程简单、快速且流程规范。
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公开(公告)号:CN108388766A
公开(公告)日:2018-08-10
申请号:CN201810053014.8
申请日:2018-01-19
Applicant: 江汉大学
Inventor: 彭海
Abstract: 本发明公开了一种品种间分子差异鉴定的方法,属于物种鉴定领域。所述方法包括:所述方法包括:根据公式:计算品种A与品种B为相同品种的概率P,其中,N为检测位点的数目,指在鉴定所述品种A与所述品种B中,采用的分子标记的鉴定标准中规定的需要检测的分子标记位点的数目;x为观察到的差异位点的数目,指在所述检测位点中具有差异基因型的标记位点,且x≤N。该方法可以计算两个品种为相同品种的概率,从而克服了现有的品种分子标记鉴定标准中,品种鉴定结论无概率保障的问题。
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