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公开(公告)号：CN117453417B
公开(公告)日：2024-08-20
申请号：CN202311538392.2
申请日：2023-11-17
Applicant: 广东美格基因科技有限公司 , 广州微芯生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于云服务的生信分析加速方法、系统、介质及设备，涉及云计算技术领域。云服务器的数量是根据分析任务的数据量来决定的，实现服务器算力与业务量相匹配，不会出现算力不足或浪费的问题；将分析任务拆分成多个子任务，每个子任务通过一个云服务器来执行，可以提高分析流程的并行化程度，从而对生信分析进行加速；在子任务的数据量相等的前提下，多个子任务可以并发执行，云服务器同时执行结束，进入下一分析阶段，做到无需等待，从而实现极致周期。
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公开(公告)号：CN117844939A
公开(公告)日：2024-04-09
申请号：CN202410033610.5
申请日：2024-01-08
Applicant: 广东美格基因科技有限公司 , 广州微芯生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C40B50/06 , C12N15/11 , G16B20/30 , G16B25/20 , G16B40/00 , G16B30/10
Abstract: 本发明涉及一种微生物种群绝对丰度定量的内参组合物、试剂盒及方法，内参组合物包括SEQ ID No.1‑SEQ ID No.8所示的8条内参序列，SEQ ID No.1‑SEQ ID No.8具有由低到高的浓度梯度，且内参组合物与样本的占比为10％‑30％。通过向环境样本中添加不同浓度梯度的内参DNA，量化不同微生物群落间的绝对含量，在PCR反应过程中，内参DNA分子产生预期大小的扩增子，结合内参DNA的拷贝数和测序输出的reads数，建立内参DNA拷贝数和reads间的标准曲线，进一步可计算出样本中各菌群拷贝数的绝对丰度，可以准确估算单位样品中物种的绝对丰度。本方法一次扩增实验，可以同时得到相对定量和绝对定量结果两份分析结果，节省样品与内参DNA用量，最大程度上节省测序成本。
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公开(公告)号：CN117453417A
公开(公告)日：2024-01-26
申请号：CN202311538392.2
申请日：2023-11-17
Applicant: 广东美格基因科技有限公司 , 广州微芯生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于云服务的生信分析加速方法、系统、介质及设备，涉及云计算技术领域。云服务器的数量是根据分析任务的数据量来决定的，实现服务器算力与业务量相匹配，不会出现算力不足或浪费的问题；将分析任务拆分成多个子任务，每个子任务通过一个云服务器来执行，可以提高分析流程的并行化程度，从而对生信分析进行加速；在子任务的数据量相等的前提下，多个子任务可以并发执行，云服务器同时执行结束，进入下一分析阶段，做到无需等待，从而实现极致周期。
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公开(公告)号：CN111534608A
公开(公告)日：2020-08-14
申请号：CN201911059604.2
申请日：2019-11-01
Applicant: 广州微芯生物科技有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6851 , C12Q1/06 , C12R1/63
Abstract: 本发明公开了一种用于检测产毒创伤弧菌的荧光定量PCR方法及试相应的剂盒。本发明巧妙的应用了特异性的基因检测区分创伤弧菌属与其它弧菌属，以及产毒和非产毒的弧菌属，通过综合判断，得出准确的菌属信息。本发明与现有的主流检测试剂盒相比，本发明用于检测产毒创伤弧菌试剂盒具有灵敏度高、快捷方便、特异型好、判断严谨准确等优势，具有良好的应用前景和市场价值。
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公开(公告)号：CN111534607A
公开(公告)日：2020-08-14
申请号：CN201910824895.3
申请日：2019-09-02
Applicant: 广州微芯生物科技有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6851 , C12Q1/06 , C12R1/63
Abstract: 本发明公开了一种用于检测产毒霍乱弧菌的荧光定量PCR方法及相应的试剂盒。本发明巧妙的应用了特异性的基因检测区分霍乱弧菌与其它弧菌属，以及产毒和非产毒的霍乱弧菌属，通过综合判断，得出准确的菌属信息。本发明与现有的主流检测试剂盒相比，本发明用于检测产毒霍乱弧菌的试剂盒具有灵敏度高、快捷方便、特异型好、判断严谨准确等优势，具有良好的应用前景和市场价值。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN111534609A
公开(公告)日：2020-08-14
申请号：CN201911098045.6
申请日：2019-11-12
Applicant: 广州微芯生物科技有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6851 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于检测产毒无乳链球菌的荧光定量PCR方法及相应的试剂盒。本发明巧妙的应用了特异性的基因检测区分无乳链球菌与其它链球菌属，以及产毒和非产毒的无乳链球菌属，通过综合判断，得出准确的菌属信息。本发明与现有的主流检测试剂盒相比，本发明用于检测产毒无乳链球菌的试剂盒具有灵敏度高、快捷方便、特异型好、判断严谨准确等优势，具有良好的应用前景和市场价值。
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公开(公告)号：CN108753923A
公开(公告)日：2018-11-06
申请号：CN201810563270.1
申请日：2018-06-04
Applicant: 广州微芯生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12N15/10 , C40B50/06
CPC classification number: C12Q1/6806 , C12N15/1093 , C12N15/11 , C12Q1/6869 , C40B50/06 , C12Q2525/191
Abstract: 本发明公开了一种构建甲基化测序文库的方法及相应的接头序列和试剂盒。本发明接头序列中的胞嘧啶碱基经过甲基化修饰。本发明用于构建甲基化测序文库的接头序列，巧妙的应用了C3～C21长碳链的化学修饰，应用于单链形成的茎环结构测序接头，与现有的主流建库接头相比，有不易产生接头二聚、无需额外进行双链退火和无需使用酶打开茎环中环状结构的优势，在重亚硫酸盐转化后，在不影响后期PCR扩增的基础上，大大的节省了反应时间和试剂成本。
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公开(公告)号：CN116790779A
公开(公告)日：2023-09-22
申请号：CN202311018065.4
申请日：2023-08-14
Applicant: 广东美格基因科技有限公司 , 广州微芯生物科技有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种微生物种群绝对丰度定量的内参组合物、试剂盒及方法，内参组合物包括SEQ ID No.1‑SEQ ID No.8所示的8条内参序列，SEQ ID No.1‑SEQ ID No.8具有由低到高的浓度梯度，且内参组合物与样本的占比为10%‑30%。通过向环境样本中添加不同浓度梯度的内参DNA，量化不同微生物群落间的绝对含量，在PCR反应过程中，内参DNA分子产生预期大小的扩增子，结合内参DNA的拷贝数和测序输出的reads数，建立内参DNA拷贝数和reads间的标准曲线，进一步可计算出样本中各菌群拷贝数的绝对丰度，可以准确估算单位样品中物种的绝对丰度。本方法一次扩增实验，可以同时得到相对定量和绝对定量结果两份分析结果，节省样品与内参DNA用量，最大程度上节省测序成本。
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公开(公告)号：CN111534611A
公开(公告)日：2020-08-14
申请号：CN201911098238.1
申请日：2019-11-12
Applicant: 广州微芯生物科技有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6851 , C12Q1/04 , C12R1/46
Abstract: 本发明公开了一种用于检测产毒猪链球菌的荧光定量PCR方法及相应的试剂盒。本发明巧妙的应用了特异性的基因检测区分猪链球菌与其它链球菌属，以及产毒和非产毒的链球菌属，通过综合判断，得出准确的菌属信息。本发明与现有的主流检测试剂盒相比，本发明用于检测产毒猪链球菌的试剂盒具有灵敏度高、快捷方便、特异型好、判断严谨准确等优势，具有良好的应用前景和市场价值。
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公开(公告)号：CN108753922A
公开(公告)日：2018-11-06
申请号：CN201810562835.4
申请日：2018-06-04
Applicant: 广州微芯生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C40B50/06 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12N15/10
CPC classification number: C12Q1/6806 , C12N15/1093 , C12Q1/6869 , C40B50/06 , C12Q2521/107 , C12Q2525/191 , C12Q2531/113
Abstract: 本发明公开了一种构建转录组测序文库的方法及相应的接头序列和试剂盒。本发明用于构建转录组测序文库的接头序列，巧妙的应用了以C3～C21长碳链的化学修饰，应用于单链形成的茎环结构测序接头，与现有的主流建库接头相比，有不易产生接头二聚、无需额外进行双链退火和无需使用酶打开茎环中环状结构的优势，在不影响后期PCR扩增的基础上，大大的节省了反应时间和试剂成本。
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