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公开(公告)号：CN118084996A
公开(公告)日：2024-05-28
申请号：CN202410228897.7
申请日：2024-02-29
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/10 , C12Q1/6869 , C07H19/14 , C07H1/00 , C09K11/06
Abstract: 本发明公开了一种可逆终止核苷酸及其在DNA合成测序及单分子测序中的应用，所述荧光标记核苷酸典型结构#imgabs0#其中Base为U,C,A,G四个不同的碱基；R是将噻唑烷连接单元与核苷酸连接在一起的化学分子基团；Cleavable Linker为噻唑烷连接单元；R1是将噻唑烷连接单元与荧光素连接在一起的化学分子基团；Dye是荧光染料。该可逆终止核苷酸在参与DNA链延伸后，可快速发生断裂。断裂后，残留在碱基上的基团较小，有利于DNA合成测序的顺利进行。在DNA合成测序及单分子测序中，连接单元可快死断裂，反应干净彻底，几乎没有观察到副反应发生；且该类化合物合成简单方便，且可以大量合成，能够极大降低测序成本。
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公开(公告)号：CN115985392A
公开(公告)日：2023-04-18
申请号：CN202310051198.5
申请日：2023-02-02
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种高密度样品基因测序方法，通过分别采集按二维点阵排列的高密度测序样品的A、C、T、G四通道荧光采集图像各一次并确定每个荧光信号的衍射斑中心位置，从而计算得到样品点阵的整体空间位置分布并确定每一个样品点在成像时单独存在信号情况下的荧光信号计算图像，再根据该荧光信号图像对耦合图像进行解耦，得到每个样品点的信号强度，通过对每一样品点在每一次成像时不同波长通道的信号强度分析，确定每一样品点中核酸的碱基排布顺序。本发明在现有测序仪器的基础上，最小可以将样品分布间距减小到成像系统分辨率的0.45倍，且保持读取错误率为万分之一。缩小样品间距到成像系统分辨率的0.36倍，保持错误率为千分之一。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN118239996A
公开(公告)日：2024-06-25
申请号：CN202410334815.7
申请日：2024-03-22
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/10 , C07H19/23 , C07H1/00 , C09K11/06 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种荧光标记核苷酸在DNA合成测序及单分子测序中的应用，所述荧光标记核苷酸典型结构#imgabs0#其中Base为U,C,A,G四个不同的碱基；R为苯环；Cleavable Linker为偶氮连接单元；R1是将偶氮连接单元与荧光素连接在一起的化学分子基团，Dye是荧光染料。该结构式通过可裂解连接单元使荧光素与含有芳环的碱基相连。该类荧光标记核苷酸参与DNA延伸、断裂后，残留在碱基上的基团只有苯胺基。本发明在DNA合成测序及单分子测序中，荧光标记核苷酸在参与延伸并断裂反应后，在DNA链上的残基只有苯胺基，在单分子测序中的实验结果表明，有望发展为长读长DNA测序方法，且保持低错误率。
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公开(公告)号：CN115058494A
公开(公告)日：2022-09-16
申请号：CN202210789003.2
申请日：2022-07-06
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6837 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12M1/34 , C12M1/00 , C12M1/38 , G02B21/00 , G02B21/06 , G01J5/48
Abstract: 本发明提供一种全内反射单分子基因测序系统，涉及基因测序技术领域，包括：全内反射测序芯片、成像测温装置、照明装置以及精密位移台；全内反射测序芯片，包含棱镜基板、盖板、固定架以及多片流道板；其中，棱镜基板的上表面与下表面分别与一片流道板贴合，流道板又与一片盖板贴合，所述流道板的中间加工有贯穿上下表面的流道；成像测温装置，包含显微物镜、成像模块、对焦测温模块；照明装置，包含照明镜头、照明镜头位移器以及照明光偏折镜。本发明能够不依赖镜油进行单分子成像的全内反射单分子基因测序，可靠性高，且维护成本低。
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公开(公告)号：CN106500743A
公开(公告)日：2017-03-15
申请号：CN201610936245.4
申请日：2016-11-01
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01D11/00
CPC classification number: G01D11/00
Abstract: 本发明提供了一种高精度电动扫描台及控制方法，包括：支撑底板、运动下板、运动上板、直线电机、光栅尺、限位开关、电缆接插件、控制驱动器，通过两个直线电机带动运动上板和运动下板进行XY扫描运动，并利用光栅尺进行精确定位。高精度电动扫描台仅依靠I/O引脚的脉冲信号输入和高低电平输出实现电动扫描台的回零操作、加减速及匀速运动和插补联动等操作控制以及指令执行状态反馈。本发明提供的高精度电动扫描台响应速度快、定位精度高，低速性能好，控制方便，可用于工业视觉检测扫描台、显微镜扫描载物台等自动控制，尤其适用于高分辨率全自动数字显微镜。
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公开(公告)号：CN206321258U
公开(公告)日：2017-07-11
申请号：CN201621159778.8
申请日：2016-11-01
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01D11/00
Abstract: 本实用新型提供了一种高精度电动扫描台，包括：支撑底板、运动下板、运动上板、直线电机、光栅尺、限位开关、电缆接插件、控制驱动器，通过两个直线电机带动运动上板和运动下板进行XY扫描运动，并利用光栅尺进行精确定位。本实用新型提供的高精度电动扫描台响应速度快、定位精度高，低速性能好，可用于工业视觉检测扫描台、显微镜扫描载物台等自动控制，尤其适用于高分辨率全自动数字显微镜。
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公开(公告)号：CN217910484U
公开(公告)日：2022-11-29
申请号：CN202221389905.9
申请日：2022-06-06
Applicant: 上海交通大学
IPC: B01L3/00
Abstract: 本实用新型提供了一种用于基因测序芯片的基底表面修饰装置,涉及化学反应装置领域，包括：上压板、基因测序芯片基底、下压板以及固定夹具；所述基因测序芯片基底夹设在所述上压板和所述下压板之间；所述基因测序芯片基底与所述上压板密封连接，且二者之间形成有流道；所述基因测序芯片基底、所述上压板以及所述下压板均固定在所述固定夹具内；所述固定夹具内设置有通道，所述通道与外界连通，且所述通道与所述流道连通。本实用新型通过上压板、基因测序芯片基底以及下压板三者配合形成封闭流道，有助于隔绝空气污染，有助于操作方便、拆分便利，从而有助于提高实验的效率。
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