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公开(公告)号：CN110656153A
公开(公告)日：2020-01-07
申请号：CN201910892839.3
申请日：2019-09-20
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及与小体重鸡只厌食行为高度关联的肠道微生物标记物。所述标记物分别为Rhodovulum属Rhodovulum bhavnagarense菌种和Terrisporobacter属Terrisporobacter glycolicus菌种。该标记物在小体重鸡只肠道中富集，鸡只表现为厌食瘦小，该标记物的发现为微生物减肥产品的研发提供了参考，另外，可在家禽生产中，用于产蛋鸡体重的控制。
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公开(公告)号：CN110372787A
公开(公告)日：2019-10-25
申请号：CN201910671764.6
申请日：2019-07-24
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一种环颈雉黑素皮质素受体1蛋白及其编码基因与应用，属于生物工程技术领域。环颈雉黑素皮质素受体1蛋白的编码基因，是如下任意一种编码基因：A)所述编码基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；B)所述编码基因的核苷酸序列在高严谨条件下与SEQ ID No.1所示的核苷酸序列杂交，且编码环颈雉黑素皮质素受体1蛋白。环颈雉黑素皮质素受体1蛋白，其是如下的蛋白：A)氨基酸序列如SEQ ID No.2所示的蛋白质；B)SEQ ID No.2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加获得且具有影响环颈雉的羽毛颜色的衍生蛋白质。与现有技术相比，本发明为研究环颈雉乃至其他家禽的羽毛颜色提供了重要参考。
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公开(公告)号：CN110751985B
公开(公告)日：2022-08-19
申请号：CN201910892250.3
申请日：2019-09-20
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及与大体重鸡只高度关联的肠道微生物标记物。所述标记物分别为Barnesiella属中的Barnesiella viscericola菌种和Bacteroides属中的Bacteroides sp.AF14‑46菌种。该标记物在体重高的鸡只肠道中显著富集，参与鸡只能量代谢等功能，为饲料微生态制剂的研发提供了参考，另外也可用于鸡只体重发育潜力的预测。
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公开(公告)号：CN110530827A
公开(公告)日：2019-12-03
申请号：CN201910640964.5
申请日：2019-07-16
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一种粪菌定量的方法，包括以下步骤：(1)粪菌液稀释；(2)将步骤(1)所得粪菌稀释液加入染料；(3)使用流式细胞仪测定步骤(2)所得粪菌稀释液，得到粪菌稀释液中细菌浓度。与现有技术相比，本发明粪菌定量方法操作简易快捷，可同时大批量操作几十个样本，且可测定粪菌总数，结果较为准确。
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公开(公告)号：CN112322714A
公开(公告)日：2021-02-05
申请号：CN202011218400.1
申请日：2020-11-04
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6869 , G16B30/10
Abstract: 本发明涉及一种检测基因编辑效率和基因编辑模式的方法及其应用，属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤：S1，提取样本基因组DNA，对待测区设计引物并扩增；S2，构建文库进行高通量测序，并对数据进行过滤、拆分和拼接，得到待测区序列；S3，将待测区序列与基因组参考序列比对，得到每个样本的基因编辑效率和模式；S4，对处理组样本和对照组样本的基因编辑效率作显著性分析并输出校正后结果。与现有技术相比，本发明简化了基因文库构建过程，加快了数据分析处理的速度，提高了基因编辑效率检测的经济性、敏感性、特异性和准确性，也提供了对基因编辑模式的多维度评估。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110540941A
公开(公告)日：2019-12-06
申请号：CN201910641528.X
申请日：2019-07-16
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12N1/04
Abstract: 本发明涉及一种从粪便中提取保存菌液的方法，包括如下步骤：(1)粪菌液制备；(2)将步骤(1)所得粪菌液加入冻干保护剂后冷冻干燥，得粪菌冻干粉；(3)将步骤(2)所得粪菌冻干粉放入-80℃冰箱保存；(4)取用步骤(3)所得粪菌冻干粉时，恢复至液体取用。与现有技术相比，本发明方法使得菌群较为集中，可于低温中长期保存，且将粪菌保存一周后的存活率达85.24％。粪菌冻干粉形式便于菌群移植，可直接使用口服灌喂方法进行移植。
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公开(公告)号：CN110257495A
公开(公告)日：2019-09-20
申请号：CN201910701834.8
申请日：2019-07-31
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6879 , C12Q1/686
Abstract: 本发明公开了一种基于PCR技术进行环颈雉早期性别鉴定的方法，属于生物监测鉴定技术领域。本发明的PCR鉴定用的两对PCR引物，包括一对CHD1基因片段引物和一对内参基因段引物。PCR鉴定方法为：以待测环颈雉雏鸡的血样基因组DNA为模板，采用环颈雉性别鉴定用PCR引物进行PCR扩增，然后采用琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物，当扩增产物只出现590bp的特异性扩增条带时判定为公环颈雉，当扩增产物出现590bp的特异性扩增条带和442bp的特异性扩增条带时判定为母环颈雉。该方法具有操作简单方便，能够在出雏时进行性别鉴别、鉴别快速、结果准确等优点，避免了采用传统方法耗时长、饲养成本高、易出错等缺点。
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公开(公告)号：CN117947172A
公开(公告)日：2024-04-30
申请号：CN202211348215.3
申请日：2022-10-31
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种骆驼SSR分子标记及其应用，属于基因检测技术领域。该引物用于骆驼遗传多样性检测与亲缘关系分析，包括如下步骤(1)通过骆驼全基因组序列分析，得到249,615个可能的SSR分子标记；通过高通量测序分析得到37,799个可能的SSR分子标记；在其中选择一系列高置信度骆驼SSR引物；(2)对待测骆驼采集其耳样并提取基因组DNA；(3)根据上述筛选得到的SSR引物，针对上述骆驼个体基因组DNA进行PCR扩增。(4)将上述所有PCR产物混合后纯化得到扩增子文库，之后对其进行Novaseq高通量测序，并对下机数据使用AdapterRemoval进行拆分，得到待测区序列；(5)使用MISA分析上述待测区序列，得到骆驼个体SSR模体序列及其重复数(遗传多样性)。
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公开(公告)号：CN110656153B
公开(公告)日：2021-08-20
申请号：CN201910892839.3
申请日：2019-09-20
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及与小体重鸡只厌食行为高度关联的肠道微生物标记物。所述标记物分别为Rhodovulum属Rhodovulum bhavnagarense菌种和Terrisporobacter属Terrisporobacter glycolicus菌种。该标记物在小体重鸡只肠道中富集，鸡只表现为厌食瘦小，该标记物的发现为微生物减肥产品的研发提供了参考，另外，可在家禽生产中，用于产蛋鸡体重的控制。
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公开(公告)号：CN110751985A
公开(公告)日：2020-02-04
申请号：CN201910892250.3
申请日：2019-09-20
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及与大体重鸡只高度关联的肠道微生物标记物。所述标记物分别为Barnesiella属中的Barnesiella viscericola菌种和Bacteroides属中的Bacteroides sp.AF14-46菌种。该标记物在体重高的鸡只肠道中显著富集，参与鸡只能量代谢等功能，为饲料微生态制剂的研发提供了参考，另外也可用于鸡只体重发育潜力的预测。
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