公开(公告)号：CN116656676A

公开(公告)日：2023-08-29

申请号：CN202211043562.5

申请日：2020-02-03

Applicant: 上海科技大学

Inventor： 陈佳 ,  杨贝 ,  杨力 ,  黄行许 ,  王丽洁

IPC: C12N15/113 ,  C12N15/85 ,  C12N15/55

Abstract: 本发明提供了一对用于编辑人PCSK9核酸序列的辅助引导RNA/引导RNA。所述引导RNA特异性地靶向PCSK9核酸上的第一位点，以使碱基编辑能够将非终止密码子转化为终止密码子，并且其中所述辅助引导RNA特异性地靶向离第一位点20至100个碱基的PCSK9核酸上的第二位点。所述一对用于编辑人PCSK9核酸序列的辅助引导RNA/引导RNA的编辑效率大大提高。

公开(公告)号：CN109021111B

公开(公告)日：2021-12-07

申请号：CN201810185384.7

申请日：2018-03-07

Applicant: 上海科技大学

Inventor： 陈佳 ,  杨力 ,  黄行许 ,  杨贝 ,  王潇 ,  李佳楠

IPC: C07K19/00 ,  C12P19/30

Abstract: 本发明提供的人源载脂蛋白B信使RNA脱氨酶催化亚基3A(APOBEC3A)、CRISPR相关Cas蛋白以及尿嘧啶糖苷酶抑制剂(UGI)[视情况而定加与不加]的融合表达的蛋白(碱基编辑器)。该碱基编辑器能够在DNA中进行碱基编辑，将胞嘧啶脱氨为尿嘧啶，即使胞嘧啶位于GpC位点或者高甲基化状态下，该碱基编辑器仍然具有较高的编辑效率。

公开(公告)号：CN108822217A

公开(公告)日：2018-11-16

申请号：CN201810647142.5

申请日：2018-06-21

Applicant: 上海科技大学

Inventor： 陈佳 ,  杨力 ,  黄行许 ,  杨贝 ,  王潇 ,  李佳楠

IPC: C07K19/00 ,  C12N15/62 ,  C12N9/22 ,  C12N15/10

Abstract: 本发明提供了一种基因碱基编辑器，具体涉及一种融合蛋白，其特征在于，包含两个片段，第一个片段包含APOBEC3A，第二个片段包含CRISPR相关Cas蛋白。该碱基编辑器能够在DNA中进行碱基编辑，将胞嘧啶脱氨为尿嘧啶，即使胞嘧啶位于GpC位点或者高甲基化状态下，该碱基编辑器仍然具有较高的编辑效率。

公开(公告)号：CN106916852A

公开(公告)日：2017-07-04

申请号：CN201710239348.X

申请日：2017-04-13

Applicant: 上海科技大学

Inventor： 陈佳 ,  杨力 ,  杨贝 ,  薛尉 ,  王丽洁

IPC: C12N15/90 ,  C12N15/113

Abstract: 本发明提供了一种碱基编辑系统及其构建和应用方法。所述的碱基编辑系统，其特征在于，包括UGI表达载体和BE3表达载体，或包括UGI和BE3共表达载体。本发明在国际上首次通过增加CRISPR碱基编辑器产生的C‑T编辑率并降低CRISPR系统本身引起的碱基插入或缺失率，从而增强了CRISPR碱基编辑器的功效，为CRISPR碱基编辑器在各物种的基因组中实施更为准确和安全的碱基编辑提供了新的方法和思路。

公开(公告)号：CN118420784A

公开(公告)日：2024-08-02

申请号：CN202410663572.1

申请日：2018-08-28

Applicant: 上海科技大学

Inventor： 陈佳 ,  黄行许 ,  杨力 ,  杨贝 ,  李潇飒 ,  王滢 ,  刘亚京

IPC: C07K19/00 ,  C12N9/78 ,  C12N9/22 ,  C07K14/32 ,  C12N15/79 ,  C12N15/62 ,  C12N15/113 ,  C12N15/10

Abstract: 本发明提供了包含胞苷和无催化活性形式的毛螺旋菌(Lachnospiraceae bacterium)Cpf1(LbCpf1)的碱基编辑器。与基于Cas9的碱基编辑器相比，该新的碱基编辑器大大提高了编辑效率和保真度，并且具有不同的编辑窗口。

公开(公告)号：CN113661248B

公开(公告)日：2022-09-16

申请号：CN202080026986.3

申请日：2020-02-03

Applicant: 上海科技大学

Inventor： 陈佳 ,  杨贝 ,  杨力 ,  黄行许 ,  王丽洁

IPC: C12N15/90 ,  C12N9/22

Abstract: 本发明提供了用于进行碱基编辑的融合蛋白和相关分子，其特征在于可减少或避免脱靶突变。所述融合蛋白可以包括：含有核碱基脱氨酶或其催化结构域的第一片段、含有核碱基脱氨酶抑制剂的第二片段以及所述第一片段和第二片段之间的蛋白酶切割位点。还提供了改进的主要编辑系统，包括具有改进了稳定性的主要编辑引导RNA。

公开(公告)号：CN116836300A

公开(公告)日：2023-10-03

申请号：CN202310711517.0

申请日：2019-01-21

Applicant: 上海科技大学

Inventor： 陈佳 ,  杨力 ,  黄行许 ,  杨贝 ,  王潇 ,  于文霞 ,  丁诚峰

IPC: C07K19/00 ,  C12N15/62 ,  C12N15/113 ,  C12N5/10

Abstract: 本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一种融合蛋白及其用途。本发明提供一种融合蛋白，包括hA3A片段、dCas12a片段和UGI片段。本发明克服了现有碱基编辑器无法在A/T富集区域内进行精准高效碱基编辑的问题，利用可识别A/T富集PAM序列的CRISPR/Cas蛋白Cas12a(Cpf1)和人胞嘧啶脱氨酶3A(human APOBEC3A,hA3A)发展出新型碱基编辑器，在A/T富集区域内实现了高效率和高精准度的定向碱基编辑，有助于在各物种基因组更为广泛的位点实现精准高效的碱基编辑，并极大地扩充我们对于碱基编辑器的应用，特别是在医疗领域对相关疾病进行精准基因治疗方面。

公开(公告)号：CN111065647A

公开(公告)日：2020-04-24

申请号：CN201880056915.0

申请日：2018-08-28

Applicant: 上海科技大学

Inventor： 陈佳 ,  黄行许 ,  杨力 ,  杨贝 ,  李潇飒 ,  王滢 ,  刘亚京

IPC: C07K14/32 ,  C12N9/22 ,  C12N15/113

Abstract: 本发明提供了包含胞苷和无催化活性形式的毛螺旋菌(Lachnospiraceae bacterium)Cpf1(LbCpf1)的碱基编辑器。与基于Cas9的碱基编辑器相比，该新的碱基编辑器大大提高了编辑效率和保真度，并且具有不同的编辑窗口。

公开(公告)号：CN117120622A

公开(公告)日：2023-11-24

申请号：CN202280026418.2

申请日：2022-04-02

Applicant: 上海科技大学

Inventor： 陈佳 ,  杨贝 ,  杨力 ,  韩炆艳 ,  孙尚武 ,  张楹

IPC: C12N15/90

Abstract: 提供了基因疗法技术，包括专门设计和测试的用于改进碱基编辑器的指导RNA序列，可用于增加γ‑珠蛋白基因的表达。这些指导RNA序列可以靶向BCL11A红系增强子或γ‑珠蛋白启动子，或同时靶向两者。这些碱基编辑器可以包括核碱基脱氨酶抑制剂，其抑制这些碱基编辑器的编辑活性，直到它们与靶位点结合。这些基因疗法技术可用于治疗包括β‑地中海贫血和镰状细胞贫血等的疾病。

公开(公告)号：CN117120621A

公开(公告)日：2023-11-24

申请号：CN202180090431.X

申请日：2021-11-11

Applicant: 上海科技大学

Inventor： 陈佳 ,  杨贝 ,  杨力 ,  李潇飒 ,  王潇 ,  赵文文 ,  周丽娜 ,  李吉方

IPC: C12N15/90

Abstract: 本发明提供了用于增强先导编辑的组合物和方法，其包括编码靶蛋白中的靶突变的pegRNA，以及一个或多个附近沉默或保守突变。这些沉默突变可以提高编辑效率，且不会引起靶蛋白序列的改变。本发明还提供了使用改进的先导编辑来预防或治疗SARS‑CoV或SARS‑CoV‑2感染的组合物和方法。