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公开(公告)号：CN116836300A
公开(公告)日：2023-10-03
申请号：CN202310711517.0
申请日：2019-01-21
Applicant: 上海科技大学
IPC: C07K19/00 , C12N15/62 , C12N15/113 , C12N5/10
Abstract: 本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一种融合蛋白及其用途。本发明提供一种融合蛋白，包括hA3A片段、dCas12a片段和UGI片段。本发明克服了现有碱基编辑器无法在A/T富集区域内进行精准高效碱基编辑的问题，利用可识别A/T富集PAM序列的CRISPR/Cas蛋白Cas12a(Cpf1)和人胞嘧啶脱氨酶3A(human APOBEC3A,hA3A)发展出新型碱基编辑器，在A/T富集区域内实现了高效率和高精准度的定向碱基编辑，有助于在各物种基因组更为广泛的位点实现精准高效的碱基编辑，并极大地扩充我们对于碱基编辑器的应用，特别是在医疗领域对相关疾病进行精准基因治疗方面。
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公开(公告)号：CN115161305B
公开(公告)日：2023-05-12
申请号：CN202110361630.1
申请日：2021-04-02
Applicant: 上海科技大学
Abstract: 本发明公开了一种包括双碱基编辑器的融合蛋白及其制备方法和应用。所述融合蛋白自5’端至3’端依次包括hA3A(Y130F)片段、TadA8e(V106W)片段以及SpRY(D10A)片段；所述hA3A(Y130F)片段的氨基酸序列如SEQ IDNO:1所示，所述TadA8e(V106W)片段的氨基酸序列如SEQ ID NO:3所示，所述SpRY(D10A)片段的氨基酸序列如SEQ ID NO:5所示。本发明的融合蛋白(CABE‑RY)可以靶向全基因组，拓宽了基因编辑范围；可实现A和C的同时突变，可应用于MNVs的模拟；能模拟70种氨基酸替换，其中包括6种独特的氨基酸转换形式，该转换形式无法通过单碱基编辑器来实现。
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公开(公告)号：CN115161305A
公开(公告)日：2022-10-11
申请号：CN202110361630.1
申请日：2021-04-02
Applicant: 上海科技大学
Abstract: 本发明公开了一种包括双碱基编辑器的融合蛋白及其制备方法和应用。所述融合蛋白自5’端至3’端依次包括hA3A(Y130F)片段、TadA8e(V106W)片段以及SpRY(D10A)片段；所述hA3A(Y130F)片段的氨基酸序列如SEQ IDNO:1所示，所述TadA8e(V106W)片段的氨基酸序列如SEQ ID NO:3所示，所述SpRY(D10A)片段的氨基酸序列如SEQ ID NO:5所示。本发明的融合蛋白(CABE‑RY)可以靶向全基因组，拓宽了基因编辑范围；可实现A和C的同时突变，可应用于MNVs的模拟；能模拟70种氨基酸替换，其中包括6种独特的氨基酸转换形式，该转换形式无法通过单碱基编辑器来实现。
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公开(公告)号：CN108949831B
公开(公告)日：2022-06-21
申请号：CN201810914416.2
申请日：2018-08-10
Applicant: 上海科技大学
IPC: C12N15/89 , C12N15/85 , C12N5/10 , A01K67/027
Abstract: 本发明提供了一种构建自闭症谱系障碍的小鼠模型的方法，其特征在于，包括：在小鼠受精卵时期利用胚胎显微注射技术胞浆注射甲基化载体以及靶向MeCP2基因TSS区的gRNA载体，得到自闭症谱系障碍的小鼠模型；其中，所述的甲基化载体含有dCas9片段以及人源DNMT3L和DNMT3A催化功能域。本发明的定点甲基化载体，可以有效实现细胞中的位点特异的甲基化。
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公开(公告)号：CN111065647A
公开(公告)日：2020-04-24
申请号：CN201880056915.0
申请日：2018-08-28
Applicant: 上海科技大学
IPC: C07K14/32 , C12N9/22 , C12N15/113
Abstract: 本发明提供了包含胞苷和无催化活性形式的毛螺旋菌(Lachnospiraceae bacterium)Cpf1(LbCpf1)的碱基编辑器。与基于Cas9的碱基编辑器相比，该新的碱基编辑器大大提高了编辑效率和保真度，并且具有不同的编辑窗口。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN108949831A
公开(公告)日：2018-12-07
申请号：CN201810914416.2
申请日：2018-08-10
Applicant: 上海科技大学
IPC: C12N15/89 , C12N15/85 , C12N5/10 , A01K67/027
CPC classification number: C12N15/89 , A01K67/0275 , A01K2207/15 , A01K2217/07 , A01K2227/105 , A01K2267/0318 , C12N15/85
Abstract: 本发明提供了一种构建自闭症谱系障碍的小鼠模型的方法，其特征在于，包括：在小鼠受精卵时期利用胚胎显微注射技术胞浆注射甲基化载体以及靶向MeCP2基因TSS区的gRNA载体，得到自闭症谱系障碍的小鼠模型；其中，所述的甲基化载体含有dCas9片段以及人源DNMT3L和DNMT3A催化功能域。本发明的定点甲基化载体，可以有效实现细胞中的位点特异的甲基化。
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公开(公告)号：CN111065647B
公开(公告)日：2024-06-11
申请号：CN201880056915.0
申请日：2018-08-28
Applicant: 上海科技大学
IPC: C07K14/32 , C12N9/22 , C12N15/113
Abstract: 本发明提供了包含胞苷和无催化活性形式的毛螺旋菌(Lachnospiraceae bacterium)Cpf1(LbCpf1)的碱基编辑器。与基于Cas9的碱基编辑器相比，该新的碱基编辑器大大提高了编辑效率和保真度，并且具有不同的编辑窗口。
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公开(公告)号：CN111471665B
公开(公告)日：2023-07-04
申请号：CN201910063623.6
申请日：2019-01-23
Applicant: 上海科技大学
IPC: C12N9/22 , C12N15/62 , C12N15/113 , C12N15/85
Abstract: 本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一种融合蛋白及其用途。本发明提供一种融合蛋白，包括同源二聚体片段和dCas9蛋白片段，所述同源二聚体片段包括LDB1蛋白片段或LDB1蛋白的Dimer domain片段。本发明将LDB1与spdCas9形成一种新的融合蛋白LDB1‑dCas9，通过染色质三维结构改变达到，无需改变基因组序列信息或者表观遗传修饰，且具有操作简单，实验准备周期短，大幅降低了时间和工作成本，不需要添加任何小分子来诱导形成二聚体，且由于同源二聚体单体的存在，因此只需要一种CRISPR‑Cas9就能同时靶向两个位点成环，大幅降低了时间和工作成本，且当增加基因的靶向位点时，能提高DNA成环的效率。
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公开(公告)号：CN110029096B
公开(公告)日：2023-05-12
申请号：CN201910382569.1
申请日：2019-05-09
Applicant: 上海科技大学
Abstract: 本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一种腺嘌呤碱基编辑工具及其用途。本发明提供一种融合蛋白，包括ecTadA‑ecTadA*二聚体片段和SpCas9‑NG D10A nickase片段，所述ecTadA‑ecTadA*二聚体片段包括ecTad片段和ecTadA*片段。本发明所提供的融合蛋白可以以NG为PAM序列，将sgRNA 5’端4‑7位的A突变为G，可以增加碱基编辑的靶向位点，此外，所述融合蛋白还具有编辑精准性高、邻近脱靶低等优点，具有良好的产业化前景。
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公开(公告)号：CN114058604B
公开(公告)日：2023-05-05
申请号：CN202111413824.8
申请日：2020-03-10
Applicant: 上海科技大学
Abstract: 本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一种碱基编辑工具及其用途。本发明提供一种融合蛋白，所述融合蛋白可以是自N端至C端依次包括第一nCas9片段、嵌合插入片段、第二nCas9片段和两个UGI片段，所述嵌合插入片段选自APOBEC1片段或APOBEC3A片段，用于目标位点胞嘧啶脱氨作用；所述融合蛋白还可以是自N端至C端依次包括第一nCas9片段、嵌合插入片段和第二nCas9片段，所述嵌合插入片段选自TadA‑TadA*，用于目标位点腺嘌呤脱氨作用。本发明提供了一种新的碱基编辑工具，其通过在nCas9上可嵌合位点能够兼容多种脱氨酶的嵌入，相较于nCas9末端融合碱基编辑器，在维持特定的靶向碱基编辑效率的同时，在DNA和RNA上的脱靶情况都极大降低，具有更高的特异性，具有良好的产业化前景。
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