公开(公告)号：CN111370055B

公开(公告)日：2023-05-23

申请号：CN202010146731.2

申请日：2020-03-05

Applicant: 中南大学

Inventor： 李洪东 ,  郑剑涛 ,  林翠香

IPC: G16B20/00 ,  G16B5/00 ,  G06N3/0464

Abstract: 本发明公开了一种内含子保留预测模型建立方法，包括收集内含子保留相关的模拟数据和真实数据；定义基因组中所有独立内含子集合并作为标准模板；获取得到的模拟数据中所设定的内含子序列读数分布模式图片数据集并处理得到处理后的数据集；将处理后的数据集按照设定比例划分为训练集和测试集；采用训练集训练神经网络模型得到最终建立的神经网络内含子保留预测模型。本发明还公开了包括所述内含子保留预测模型建立方法的预测方法。本发明能够基于内含子保留读数分布模式对内含子进行可视化以及预测，而且可靠性高，准确性好。

公开(公告)号：CN111370055A

公开(公告)日：2020-07-03

申请号：CN202010146731.2

申请日：2020-03-05

Applicant: 中南大学

Inventor： 李洪东 ,  郑剑涛 ,  林翠香

IPC: G16B20/00 ,  G16B5/00 ,  G06N3/04

Abstract: 本发明公开了一种内含子保留预测模型建立方法，包括收集内含子保留相关的模拟数据和真实数据；定义基因组中所有独立内含子集合并作为标准模板；获取得到的模拟数据中所设定的内含子序列读数分布模式图片数据集并处理得到处理后的数据集；将处理后的数据集按照设定比例划分为训练集和测试集；采用训练集训练神经网络模型得到最终建立的神经网络内含子保留预测模型。本发明还公开了包括所述内含子保留预测模型建立方法的预测方法。本发明能够基于内含子保留读数分布模式对内含子进行可视化以及预测，而且可靠性高，准确性好。