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公开(公告)号：CN117708569A
公开(公告)日：2024-03-15
申请号：CN202410160852.0
申请日：2024-02-05
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
IPC: G06F18/213 , G06F18/10 , G06F18/214 , G06F18/24 , G06N3/04 , G06N3/08
Abstract: 本发明涉及物种识别与数据处理技术领域，提供一种病原微生物信息的识别方法、装置、终端及存储介质，该方法包括：获取检测报告；对检测报告进行特征提取，获得初始特征数据；对初始特征数据进行处理，生成标准化特征向量；将标准化特征向量作为输入，利用训练好的识别模型进行识别，获得物种信息识别结果；识别模型包括至少一个泛化识别模型和至少一个高危识别模型，高危识别模型基于第一训练集训练得到，泛化识别模型基于第二训练集得到，第一训练集中的训练数据为第二训练集中经泛化识别模型识别后输出结果为指定类别的训练数据，本发明能够提高病原微生物信息的识别效率。
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公开(公告)号：CN115938478B
公开(公告)日：2023-06-02
申请号：CN202310065146.3
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对阿米卡星敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括：计算单元；计算单元包括：计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算：S1：按下述公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；C1‑C5分别为arr‑2、acrB、armA、oqxB、rmtB基因在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对阿米卡星敏感性的预测的准确率约98.8%。
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公开(公告)号：CN114898800B
公开(公告)日：2022-09-16
申请号：CN202210823391.1
申请日：2022-07-14
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明“一种预测肺炎克雷伯菌对头孢曲松敏感性的方法及系统”属于分子生物技术领域。所述方法的特征是，按下述公式I计算h(x)值：公式I：；其中，C1‑C6分别为sul1基因、tet(A)基因、QnrS1基因、AAC(6')‑Ib‑cr6基因、KPC‑1基因、TEM‑1基因分别在待预测的肺炎克雷伯菌菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行肺炎克雷伯菌对头孢曲松敏感性的预测的准确率约90%。
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公开(公告)号：CN117708569B
公开(公告)日：2024-04-05
申请号：CN202410160852.0
申请日：2024-02-05
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
IPC: G06F18/213 , G06F18/10 , G06F18/214 , G06F18/24 , G06N3/04 , G06N3/08
Abstract: 本发明涉及物种识别与数据处理技术领域，提供一种病原微生物信息的识别方法、装置、终端及存储介质，该方法包括：获取检测报告；对检测报告进行特征提取，获得初始特征数据；对初始特征数据进行处理，生成标准化特征向量；将标准化特征向量作为输入，利用训练好的识别模型进行识别，获得物种信息识别结果；识别模型包括至少一个泛化识别模型和至少一个高危识别模型，高危识别模型基于第一训练集训练得到，泛化识别模型基于第二训练集得到，第一训练集中的训练数据为第二训练集中经泛化识别模型识别后输出结果为指定类别的训练数据，本发明能够提高病原微生物信息的识别效率。
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公开(公告)号：CN115881213B
公开(公告)日：2023-06-02
申请号：CN202310065171.1
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对哌拉西林‑他唑巴坦敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；其被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；按下述计算步骤计算：S1：按公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；其中，C1‑C5分别为dfrA12、KPC‑1、determinant of bleomycin resistance、mphA、sul2基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对哌拉西林‑他唑巴坦敏感性的预测的准确率约98.3%。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN115798575B
公开(公告)日：2023-06-02
申请号：CN202310065212.7
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对头孢他啶敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括：计算单元；计算单元包括：计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算：S1：按下述公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；其中，C1‑C5分别为KPC‑1、sul1、CTX‑M‑55、CTX‑M‑15、TEM‑1基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对头孢他啶敏感性的预测的准确率约90.6%。
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公开(公告)号：CN115938478A
公开(公告)日：2023-04-07
申请号：CN202310065146.3
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对阿米卡星敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括：计算单元；计算单元包括：计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算：S1：按下述公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；C1‑C5分别为arr‑2、acrB、armA、oqxB、rmtB基因在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对阿米卡星敏感性的预测的准确率约98.8%。
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公开(公告)号：CN115862730A
公开(公告)日：2023-03-28
申请号：CN202310065401.4
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对头孢西丁敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算：S1：按下述公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；其中，C1‑C5分别为ramA、sul1、KPC‑1、DHA‑1、bleomycin resistance determinant基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对头孢西丁敏感性的预测的准确率约94.7%。
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公开(公告)号：CN115798577A
公开(公告)日：2023-03-14
申请号：CN202310065354.3
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对左氧氟沙星敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算：S1：按下述公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；其中，C1‑C5分别为TEM‑1、OmpA、AAC(6')‑Ib‑cr6、KPC‑1、QnrS1基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对左氧氟沙星敏感性的预测的准确率约89.5%。
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公开(公告)号：CN115798576A
公开(公告)日：2023-03-14
申请号：CN202310065262.5
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对亚胺培南敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算：S1：按下述公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；其中，C1‑C5分别为bleomycin resistance determinant、ramA、mphA、KPC‑1、catI基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对亚胺培南敏感性的预测的准确率约99.4%。
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