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公开(公告)号：CN117523014A
公开(公告)日：2024-02-06
申请号：CN202311315296.1
申请日：2023-10-11
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: G06T11/00 , G06N3/0455 , G06N3/0464 , G06N3/08
Abstract: 本发明涉及一种内窥SS‑OCT图像分层方法、设备及存储介质，该方法包括以下步骤：获取采集的结直肠内窥OCT图像；对结直肠内窥OCT图像进行预处理；裁剪结直肠内窥OCT图像提取感兴趣区域；将处理后的结直肠内窥OCT图像作为多级上下文信息聚合网络模型的输入，实现结直肠内窥OCT图像粘膜层、固有肌层、混合组织层次区域和肿瘤区域的分层。本发明在Unet编码器阶段采用双分支并行结构，在解码器中采用多级输出结构，在解码器的最底层引入改进的通道注意力机制，不仅提高了内窥扫频光学相干层析图像的分层精确性，还有助于临床医生更有效地观察和诊断病变组织区域，具有重要的应用价值和意义，降低了早期诊断的漏诊率。
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公开(公告)号：CN113655026A
公开(公告)日：2021-11-16
申请号：CN202110897601.7
申请日：2021-08-05
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: G01N21/359 , G01N21/19 , G01N21/64 , G02B21/00 , G02B21/04
Abstract: 本发明公开了一种椭半球曲面大视野高通量双光子显微镜，包括：近红外飞秒脉冲激光器联组、分束延时模块联组、扫描单元联组、合束拼接模块、椭球曲面大视野反射式物镜、二向色片和光电倍增管探测阵列。本发明通过反射式物镜的设计来实现椭圆曲面大视野，能将平面矩形的激光扫描场转换成椭圆半球面的激光扫描场；通过采用多路激光并行扫描和多路荧光并行的探测方式能实现高通量扫描，利用四色原理，将不相邻区域划分为一组，利用区域间隙和合并式半波片最大化多次偏振合束的能量效率；不组激光之间引入延时，通过同时点的区域不相邻、相邻的区域不同时的方案，在时间和空间上能有效区分荧光信号的来源区域，极大程度地避免荧光散射带来的信号串扰。
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公开(公告)号：CN113643396A
公开(公告)日：2021-11-12
申请号：CN202110897589.X
申请日：2021-08-05
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明公开了一种扫频OCT图像处理方法及装置，该方法包括以下步骤：S1、干涉数据处理：对扫频OCT系统得到的干涉数据进行加窗处理以抑制噪声信号，然后再进行傅里叶变换，得到样品图像P0；S2、去除背景信息：对样品图像P0每行取平均提取条纹背景信息，然后对提取到的背景信息进行膨化操作得到背景图像，最后将样品图像P0减去背景图像，得到去除了图像条纹状伪影的OCT图像。本发明的方法能够对扫频OCT图像出现的散斑噪声、扫频光源噪声和光路条状伪影进行有效去除，从而可对OCT图像进行优化，提高OCT图像质量，应用于医学图像处理中时，能够便于医生从图像中准确、快速获取对诊断和观察病人病情有参考价值的信息。
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公开(公告)号：CN110734854B
公开(公告)日：2021-08-24
申请号：CN201910911821.3
申请日：2019-09-25
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: C12M1/38 , C12M1/34 , C12M1/00 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种超高通量单细胞核酸分子实时荧光定量分析一体化快速检测系统，包括：微流控芯片、自动加样装置、温控热循环装置、荧光成像系统以及数据存储分析系统；所述自动加样装置具有X轴、Y轴和Z轴方向的自由度，用于将样品和试剂自动加入所述微流控芯片内；所述数据存储分析系统对采集的样品的荧光信号进行分析，识别阳性样本，并绘制出阳性样本的实时荧光定量分析曲线。本发明的超高通量单细胞核酸分子实时荧光定量分析一体化快速检测系统，集成微流控芯片、自动加样装置、温控热循环装置、荧光成像系统以及数据存储分析系统，可实现样品的自动化检测处理，能十万量级、百万量级的单细胞捕获核酸扩增以及实时荧光定量曲线分析。
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公开(公告)号：CN111938602A
公开(公告)日：2020-11-17
申请号：CN202010897559.4
申请日：2020-08-31
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: A61B5/00
Abstract: 本发明提供用于OCT成像系统的信号处理方法，包括如下步骤：高速扫频光源模块输出高频激光至主光学系统的同时输出第一脉冲信号至逻辑控制模块；高频激光经过主光学系统后分成两束激光，按原路返回的两束干涉光进入高速平衡探测器探测模块中，逻辑控制模块对第一脉冲信号进行判断处理后输出第三脉冲信号至高速采集集成模块，第三脉冲信号用以触发高速采集集成模块进行数据采集。本发明还涉及OCT成像系统、存储介质。本发明从硬件上准确控制每帧图像的开始位置，上位机提取的图像数据是经过硬件准确对准并经过FPGA硬件进行FFT变换的图像数据，不需要在上位机进行数据校正，不仅提高获取的图像数据的准确性而且降低了工作量。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113796832B
公开(公告)日：2024-11-19
申请号：CN202111047059.2
申请日：2021-09-07
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明公开了一种全景旋转内窥双光子显微成像系统，包括：近红外飞秒脉冲激光器、主机、成像探头组件和轴向扫描装置，所述成像探头组件包括旋转输出单元以及旋转驱动单元；所述旋转输出单元植入到动物的脑组织中，用于将飞秒脉冲激光导入脑组织，并收集脑组织被激发而产生的荧光。本发明将高速旋转扫描与微型内窥双光子成像系统结合，提出了一种能特别适用于灵长类较大型动物的全景内窥双光子显微成像系统，通过将成像探头组件的旋转输出单元置入到脑组织，藉由360度环形柱面扫描能实现所观察脑区内360度全景成像，藉由轴向扫描进行不同深度的探测，能实现从深脑区到脑皮层管道所覆盖连续多个脑功能区的神经活动观测。
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公开(公告)号：CN113655026B
公开(公告)日：2024-01-23
申请号：CN202110897601.7
申请日：2021-08-05
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: G01N21/359 , G01N21/19 , G01N21/64 , G02B21/00 , G02B21/04
Abstract: 本发明公开了一种椭半球曲面大视野高通量双光子显微镜，包括：近红外飞秒脉冲激光器联组、分束延时模块联组、扫描单元联组、合束拼接模块、椭球曲面大视野反射式物镜、二向色片和光电倍增管探测阵列。本发明通过反射式物镜的设计来实现椭圆曲面大视野，能将平面矩形的激光扫描场转换成椭圆半球面的激光扫描场；通过采用多路激光并行扫描和多路荧光并行的探测方式能实现高通量扫描，利用四色原理，将不相邻区域划分为一组，利用区域间隙和合并式半波片最大化多次偏振合束的能量效率；不组激光之间引入延时，通过同时点的区域不相邻、相邻的区域不同时的方案，在时间和空间上能有效区(56)对比文件ANDRES FLORES VALLE等.Two-photonBessel beam tomography for fast volumeimaging.optics express.2019,1-16.
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公开(公告)号：CN117395223A
公开(公告)日：2024-01-12
申请号：CN202311505002.1
申请日：2023-11-13
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: H04L61/103 , H04L61/5007 , H04L69/16
Abstract: 本发明提供基于RDMA的多通道高通量双光子显微镜数据传输方法及系统，针对多通道高通量双光子显微镜数据实时传输，在显微镜子服务器与主服务器上分别安装RDMA板卡，子服务器与主服务器的RDMA板卡通过万兆交换机进行互联，并分配RDMA网卡的I P地址，设置子服务器为发送端，主服务器为接收端；在各路服务器上利用新数据值引用/置入元素结构实现数据的远端直接内存访问，无需经过CPU拷贝等操作，提升了数据传输效率，同时在每组数据传输前加载子服务器机箱板卡编号用于解析具体拼接的通道位置，避免通道串扰；主服务器通过TCP/I P协议对各路子服务器实现指令同步操控，最终实现不低于128个通道数据实时采集与显示。
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公开(公告)号：CN113643396B
公开(公告)日：2023-05-12
申请号：CN202110897589.X
申请日：2021-08-05
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明公开了一种扫频OCT图像处理方法及装置，该方法包括以下步骤：S1、干涉数据处理：对扫频OCT系统得到的干涉数据进行加窗处理以抑制噪声信号，然后再进行傅里叶变换，得到样品图像P0；S2、去除背景信息：对样品图像P0每行取平均提取条纹背景信息，然后对提取到的背景信息进行膨化操作得到背景图像，最后将样品图像P0减去背景图像，得到去除了图像条纹状伪影的OCT图像。本发明的方法能够对扫频OCT图像出现的散斑噪声、扫频光源噪声和光路条状伪影进行有效去除，从而可对OCT图像进行优化，提高OCT图像质量，应用于医学图像处理中时，能够便于医生从图像中准确、快速获取对诊断和观察病人病情有参考价值的信息。
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公开(公告)号：CN115343264A
公开(公告)日：2022-11-15
申请号：CN202210950547.2
申请日：2022-08-09
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明公开了一种非平行光轴耦合的多位点双光子成像刺激装置，包括：飞秒激光器、激光扫描装置以及至少两路光学支路；光学支路包括第一聚焦光学元件、反射镜和第二聚焦光学元件；飞秒激光器发出的飞秒激光进入激光扫描装置，激光扫描装置使得飞秒激光在多个扫描区间之间反复扫描，每个扫描区间的飞秒激光经过一对应的光学支路后到达一个对应的目标位点；进入光学支路的飞秒激光经第一聚焦光学元件进行第一次聚焦后被反射至第二聚焦光学元件，进行第二次聚焦后到达对应的目标位点视野平面。本发明提供的非平行光轴耦合的多位点双光子成像刺激装置适合于对位于曲面样品上的多个存在空间夹角的平面视野区域进行双光子成像或光刺激。
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