一种检测人类胚胎染色体微缺失和微重复的方法

    公开(公告)号:CN104745718B

    公开(公告)日:2018-02-16

    申请号:CN201510198145.1

    申请日:2015-04-23

    Inventor: 冯涛 杨凯 邢丽贤

    Abstract: 本发明涉及一种检测人类胚胎染色体微缺失和微重复的方法,步骤如下:通过对体外培养的细胞进行全基因组扩增,并将DNA分子打断,对DNA片段测序,得到测序读段;与参考序列比对,将其定位于参考序列上;筛选参考序列非重复区域,保留非重复区域;通过正常样本建立窗口内读段数目矩阵,对正常样本数据进行分析,统计非重复区域内各窗口读段数,建立读段数及染色体整倍体的概率矩阵;计算位点的拷贝数即A/B/C状态;将连续m个位点为A状态选择为微重复位点,连续m个位点为C状态选择为微缺失位点;与已有CNV和疾病数据库进行对照,进行基本的基因注释和缺失部分涉及的基因功能分析,标注出微缺失综合征疾病类型。

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