公开(公告)号：CN108363904B

公开(公告)日：2019-06-28

申请号：CN201810123433.4

申请日：2018-02-07

Applicant: 南京林业大学

Inventor： 续晨 ,  诸葛强 ,  宫新栋 ,  魏辉 ,  王立科 ,  尹佟明

IPC: G16B25/00

Abstract: 本发明公开了一种用于木本植物遗传密码子优化的CodonNX系统及其优化方法，该系统包括输入模块、处理模块、输出模块；其中，输入模块用于用户输入基因序列和密码子使用频率排序表，并选定具体处理模式；处理模块用于接收输入的密码子信息内容、密码子使用频率排序表信息内容，并依据用户选择的处理模式，进行有效处理，并通过输出模块，输出对应的结果。本CodonNX系统提供了完备的可发展的全系统基因优化功能，提高工作效率，节省成本，系统的参数可选择，尤其是最优密码子可选择，几乎所有参数都公开、透明、可选择，并且可以由用户自己进行设置。该系统适合植物表达载体平台，针对性较强，经试验验证，在转基因植株中能得到高表达蛋白。

公开(公告)号：CN108363904A

公开(公告)日：2018-08-03

申请号：CN201810123433.4

申请日：2018-02-07

Applicant: 南京林业大学

Inventor： 续晨 ,  诸葛强 ,  宫新栋 ,  魏辉 ,  王立科 ,  尹佟明

IPC: G06F19/20

CPC classification number: G16B25/00

Abstract: 本发明公开了一种用于木本植物遗传密码子优化的CodonNX系统及其优化方法，该系统包括输入模块、处理模块、输出模块；其中，输入模块用于用户输入基因序列和密码子使用频率排序表，并选定具体处理模式；处理模块用于接收输入的密码子信息内容、密码子使用频率排序表信息内容，并依据用户选择的处理模式，进行有效处理，并通过输出模块，输出对应的结果。本CodonNX系统提供了完备的可发展的全系统基因优化功能，提高工作效率，节省成本，系统的参数可选择，尤其是最优密码子可选择，几乎所有参数都公开、透明、可选择，并且可以由用户自己进行设置。该系统适合植物表达载体平台，针对性较强，经试验验证，在转基因植株中能得到高表达蛋白。