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公开(公告)号：CN113920003A
公开(公告)日：2022-01-11
申请号：CN202111404214.1
申请日：2021-11-24
Applicant: 南京邮电大学
IPC: G06T1/20 , G16B25/00 , G06F30/20 , G06F111/10
Abstract: 本发明公开了一种基于GPU快速优化运算基因共表达网络方法，属于互联网领域，包括以下步骤：步骤一：建立数据读取模块、相关性矩阵系数迭代模块和等级数值迭代模块，并用GPU提供算力，构建基因共表达网络；步骤二：利用数据读取模块进行读取输入文件的相关数据。引入了迭代思想，用旧值递推新值，使其能够适应不同条件下的基因共表达数据，进而构建加权关联网络并获得更具有生物学意义的结果；由于GPU具有多核心，将其运用在基因共表达网络分析上，用来处理基因共表达矩阵，能够大大减少分析周期，缩短分析等待时间。在此之上，需要的硬件和软件环境较简单，安装方便。
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