公开(公告)号：CN106845699A

公开(公告)日：2017-06-13

申请号：CN201710005896.6

申请日：2017-01-05

Applicant: 南昌大学

Inventor： 戎俊 ,  崔相艳 ,  王文娟 ,  杨小强 ,  李述 ,  秦声远

IPC: G06Q10/04 ,  G06Q50/02

CPC classification number: G06Q10/04 ,  G06Q50/02

Abstract: 本发明公开了一种预测油茶适生区的方法，该方法包括：步骤一、获取油茶分布点数据；步骤二、获取分布点的环境数据；步骤三、选择最大熵模型构建生态位模型，根据生态位模型预测的分布概率值,对油茶的潜在分布区划分适生等级；步骤四、预测结果的可靠性分析。本发明利用已有的油茶分布数据和环境数据，采用最大熵模型来构建生态位模型,预测油茶的适生区，预测结果准确，有助于了解油茶的分布规律，对于指导油茶生产和寻找野生油茶资源具有较高的参考价值。

公开(公告)号：CN108441538A

公开(公告)日：2018-08-24

申请号：CN201810345293.5

申请日：2018-04-17

Applicant: 南昌大学

Inventor： 戎俊 ,  杨小强 ,  崔相艳 ,  黄小毛 ,  陈家铭

IPC: C12Q1/6811

Abstract: 本发明提供了基于多样本高通量测序开发多态性微卫星分子标记的方法，该方法首先获取待测物种多个样本基因组或转录组的高通量测序数据，从中筛选潜在可扩增微卫星位点，而后筛选其引物对在单个样本潜在可扩增微卫星位点所有测序reads中只出现1次的微卫星位点，再筛选那些在多个样本中有出现，且在所有样本中等位基因数目大于2的标记；最后通过建立参考序列数据库，筛选那些在参考基因组或转录组中只出现一次的标记，同时排除那些扩增同一个片段的重复标记。本发明能利用高通量测序数据有效筛选具有多态性的微卫星标记，能去除其中非特异性的、重复的标记，同时还能预测相应微卫星位点PCR扩增产物的长度，显著提升了微卫星分子标记开发的效率。