一种个体差异表达蛋白质的识别方法

    公开(公告)号:CN114220484A

    公开(公告)日:2022-03-22

    申请号:CN202111362073.1

    申请日:2021-11-17

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种个体差异表达蛋白质的识别方法,该方法包括以下步骤:S1、对蛋白质丰度数据进行预处理;S2、验证正常队列的蛋白质丰度数据中是否存在高度显著的蛋白质对;S3、选取个体层面差异表达算法中的参考组;S4、基于参考组采用个体层面差异表达算法识别差异表达蛋白质;该发明首先基于蛋白质丰度数据的特征,对蛋白质丰度数据进行预处理,去除变异系数高以及缺失值比例高的蛋白质,减少蛋白质定量误差对个体差异蛋白结果的影响;其次基于蛋白质稳定对选取参考组,并且利用迭代的方法,不断优化参考组中存在差异表达的蛋白质,保证了参考组的稳定性,可在个体水平上有效识别差异表达的蛋白质,识别精度高,应用前景好。

    一种个体差异表达蛋白质的识别方法

    公开(公告)号:CN114220484B

    公开(公告)日:2024-10-22

    申请号:CN202111362073.1

    申请日:2021-11-17

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种个体差异表达蛋白质的识别方法,该方法包括以下步骤:S1、对蛋白质丰度数据进行预处理;S2、验证正常队列的蛋白质丰度数据中是否存在高度显著的蛋白质对;S3、选取个体层面差异表达算法中的参考组;S4、基于参考组采用个体层面差异表达算法识别差异表达蛋白质;该发明首先基于蛋白质丰度数据的特征,对蛋白质丰度数据进行预处理,去除变异系数高以及缺失值比例高的蛋白质,减少蛋白质定量误差对个体差异蛋白结果的影响;其次基于蛋白质稳定对选取参考组,并且利用迭代的方法,不断优化参考组中存在差异表达的蛋白质,保证了参考组的稳定性,可在个体水平上有效识别差异表达的蛋白质,识别精度高,应用前景好。

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