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公开(公告)号：CN120032716A
公开(公告)日：2025-05-23
申请号：CN202510502870.7
申请日：2025-04-22
Applicant: 厦门大学附属第一医院(厦门市第一医院、厦门市红十字会医院、厦门市糖尿病研究所)
Abstract: 本发明公开一种基于宏基因组测序数据的低丰度病原体检测方法及系统，属于生物信息学技术领域。该系统包括：物种特异性序列筛选模块（BactAlert2SSRs），参考基因组数据库构建模块（BactAlert2Lib），序列比对参考基因组模块（BactAlert2Map），序列比对结果分析模块（BactAlert2ID），SSRs后验概率矫正模块（BactAlert2Rec）。该检测系统实现了对低丰度病原体的高效、准确和可靠的检测，适用于分析三代宏基因组测序数据。
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公开(公告)号：CN119495431B
公开(公告)日：2025-04-15
申请号：CN202510076515.8
申请日：2025-01-17
Applicant: 厦门大学附属第一医院(厦门市第一医院、厦门市红十字会医院、厦门市糖尿病研究所)
Abstract: 本发明提供一种脑部疾病预防信息推送系统，涉及医疗健康信息技术领域，所述系统包括：运动检测设备、通信组件、处理器、云端服务器和信息接收终端，所述处理器用于处理器用于：在预设时间段内的多个时刻获取多个运动检测设备之间的相对位置关系；根据相对位置关系确定待测人员的位姿数据；通过通信组件将位姿数据发送至云端服务器。所述云端服务器用于：接收待测人员的位姿数据；从存储器中调取待测人员的脑部CT图像和脑电数据；根据位姿数据、脑部CT图像和脑电数据，获得待测人员的脑部疾病预防信息；将脑部疾病预防信息推送至信息接收终端。根据本发明，可及时发现早期脑部疾病，并推送至信息接收终端，提示待测人员对脑部疾病进行关注。
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公开(公告)号：CN119495431A
公开(公告)日：2025-02-21
申请号：CN202510076515.8
申请日：2025-01-17
Applicant: 厦门大学附属第一医院(厦门市第一医院、厦门市红十字会医院、厦门市糖尿病研究所)
Abstract: 本发明提供一种脑部疾病预防信息推送系统，涉及医疗健康信息技术领域，所述系统包括：运动检测设备、通信组件、处理器、云端服务器和信息接收终端，所述处理器用于处理器用于：在预设时间段内的多个时刻获取多个运动检测设备之间的相对位置关系；根据相对位置关系确定待测人员的位姿数据；通过通信组件将位姿数据发送至云端服务器。所述云端服务器用于：接收待测人员的位姿数据；从存储器中调取待测人员的脑部CT图像和脑电数据；根据位姿数据、脑部CT图像和脑电数据，获得待测人员的脑部疾病预防信息；将脑部疾病预防信息推送至信息接收终端。根据本发明，可及时发现早期脑部疾病，并推送至信息接收终端，提示待测人员对脑部疾病进行关注。
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公开(公告)号：CN119170103A
公开(公告)日：2024-12-20
申请号：CN202411195964.6
申请日：2024-08-29
Applicant: 厦门大学附属第一医院(厦门市第一医院、厦门市红十字会医院、厦门市糖尿病研究所)
Inventor： 黄丽红
Abstract: 本发明提供了一种病原体物种特异性序列筛选方法、装置、设备及存储介质，通过读取包含目标物种名称的输入文件，获取包含目标物种的基因组序列，并对所述基因组序列进行预处理；接着，提取所述目标物种编号，并对目标物种的基因组序列进行泛基因组分析,获得核心基因组序列；最后，根据所述目标物种编号和核心基因组序列对所述目标物种进行特异性序列筛选，其中，所述特异性序列筛选包括调用BLAST+软件megablast程序进行第一轮筛选以排除与非目标物种基因组存在高相似序列片段，调用BLAST+软件blastn程序进行第二轮筛选以排除被megablast程序忽略掉的核心基因组序列，调用blastn程序进行第三轮筛选获得与属内其他非目标物种存在特异性差异的序列。通过本地版BLAST+构建目标微生物物种特异性序列筛选流程，解决了筛选微生物物种特异性序列时通过NCBI在线提交查询序列大小的限制，以及比对过程频繁意外中断的问题。
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