公开(公告)号：CN117373542A

公开(公告)日：2024-01-09

申请号：CN202311374297.3

申请日：2023-10-23

Applicant: 哈尔滨工程大学

Inventor： 徐丽 ,  朱亚隆 ,  李振鹏 ,  王莉雯 ,  任佳旭

IPC: G16B40/00 ,  G16B30/00 ,  G06N3/0455 ,  G06N3/08 ,  G06F18/23 ,  G06F17/16

Abstract: 一种基于非负矩阵分解的scRNA‑seq数据补值方法，它属于深度学习和数据补值方法技术领域。本发明解决了利用现有方法对单细胞RNA测序数据中缺失值进行补值的准确率低的问题。本发明采取的主要技术方案为：步骤1、根据基因数据对细胞进行过滤，获得过滤后剩余细胞的RNA测序数据；对过滤后剩余细胞的RNA测序数据进行归一化、基因筛选和对数转换生成矩阵X；步骤2、对矩阵X进行分解，得到特征矩阵和系数矩阵；步骤3、根据特征矩阵构造自编码器的输入矩阵，将输入矩阵作为自编码器的输入，通过自编码器输出填补后的特征矩阵；步骤四4、对填补后的特征矩阵依次进行分解还原、对数还原和反归一化，得到补值结果。本发明方法可以应用于RNA测序数据补值。