公开(公告)号：CN119229958A

公开(公告)日：2024-12-31

申请号：CN202411316427.2

申请日：2024-09-20

Applicant: 安徽大学

Inventor： 魏丕静 ,  丁正 ,  丁云 ,  曹瑞芬 ,  郑春厚

IPC: G16B20/00 ,  G06F17/16 ,  G16B40/00 ,  G06N3/042 ,  G06N3/0464

Abstract: 本发明公开了一种基于深层有向图卷积的基因网络调控关系的重构方法，包括：1、使用Node2Vec方法获取酿酒酵母菌基因调控网络的拓扑信息；2、对于酿酒酵母菌因调控网络使用图数据增强手段，获得更高效的信息表达；3、对于酿酒酵母菌基因调控网络的调控方向问题，使用有向图神经网络的预测调控关系方向信息；4、构建深层有向图卷积模型，获取基因高阶的邻居信息；5、将酿酒酵母菌基因的表达特征和步骤1、2中得到的特征进行拼接后输入到模型中得到酿酒酵母菌调控网络预测分数矩阵，根据预测分数矩阵和阈值之间的关系，判断基因间是否存在调控关系。本发明能准确预测酿酒酵母菌基因间的调控关系，有助于更高效地研究生物体生化反应的本质。