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公开(公告)号:CN113990385B
公开(公告)日:2025-01-07
申请号:CN202111265124.9
申请日:2021-10-28
Applicant: 安徽大学
Abstract: 本发明公开了一种基于抗寄生虫感染的关键基因的化合物组合筛选方法,包括:1、对生物数据进行预处理后,针对每一个被寄生虫感染的个体构建单层差异相互作用网络,通过将多个单层网络的对应的基因节点连接,构建多层的基因相互作用网络,实现多网络的融合,再利用多层网络的PageRank算法计算基因在每层网络中的评分,利用所有层中对应相同基因的平均评分进行排序甄别关键基因;2、基于关键基因和已知的FDA批准的化合物及每种化合物的靶标基因集合,设计多目标优化函数模型,利用多目标优化算法得到较优的化合物组合。本发明能提高筛选抗寄生虫感染的化合物组合的时间效率,并筛选出较优的化合物组合。
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公开(公告)号:CN113990385A
公开(公告)日:2022-01-28
申请号:CN202111265124.9
申请日:2021-10-28
Applicant: 安徽大学
Abstract: 本发明公开了一种基于抗寄生虫感染的关键基因的化合物组合筛选方法,包括:1、对生物数据进行预处理后,针对每一个被寄生虫感染的个体构建单层差异相互作用网络,通过将多个单层网络的对应的基因节点连接,构建多层的基因相互作用网络,实现多网络的融合,再利用多层网络的PageRank算法计算基因在每层网络中的评分,利用所有层中对应相同基因的平均评分进行排序甄别关键基因;2、基于关键基因和已知的FDA批准的化合物及每种化合物的靶标基因集合,设计多目标优化函数模型,利用多目标优化算法得到较优的化合物组合。本发明能提高筛选抗寄生虫感染的化合物组合的时间效率,并筛选出较优的化合物组合。
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