公开(公告)号：CN119332018A

公开(公告)日：2025-01-21

申请号：CN202411729414.8

申请日：2024-11-28

Applicant: 广西壮族自治区农业科学院

Inventor： 王益奎 ,  余楚英 ,  杨其洪 ,  蒋雅琴 ,  甘桂云 ,  李韦柳 ,  蔡梁玉 ,  何小艳 ,  覃春春

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供一种用于辣椒群体结构分析的SNP分子标记组合，所述SNP分子标记组合包含有1068个SNP分子标记，所述1068个SNP位点的物理位置是基于辣椒“Hot1”基因组序列对比确定的，具体SNP分子标记情况如说明书表1所示。该标记组合在辣椒12条染色体上均匀分布，多态性较高。基于该SNP标记的液相探针芯片标记密度高、自动化强、检测通量高等特征，更有利于建立辣椒群体分群体系；该标记组合可以为辣椒新品系鉴定、分子标记辅助选择育种、全基因组选择、群体遗传多样性分析等工作提供理论和数据支撑，具有较为重要的理论价值和应用意义。

公开(公告)号：CN119776564A

公开(公告)日：2025-04-08

申请号：CN202411729419.0

申请日：2024-11-28

Applicant: 广西壮族自治区农业科学院

Inventor： 王益奎 ,  余楚英 ,  蒋雅琴 ,  杨其洪 ,  甘桂云 ,  李韦柳 ,  蔡梁玉 ,  何小艳

IPC: C12Q1/6895 ,  A01H1/04

Abstract: 本发明提供一种用于区分中国辣椒材料的SNP分子标记组合，所述SNP分子标记组合包含有181个SNP分子标记，所述181个SNP位点的物理位置是基于中国辣椒“Hot1”基因组序列对比确定的，具体SNP分子标记情况如说明书表1所示。利用本发明所述的液相探针组获得了181个SNP标记，检出率100%，最小等位基因频率大于0.05，可以区分任意两种中国辣椒材料，经实验验证，利用本发明所述液相探针可以高效、快速的完成中国辣椒材料的鉴别；此外，由于采用了新一代测序的技术，程序简易规范，减少了人为操作的误差，使得批量鉴别分析的单价极低，具有经济高效的特征，特别适合大样本分析鉴别，具有良好的应用前景。

公开(公告)号：CN118497396A

公开(公告)日：2024-08-16

申请号：CN202410612756.5

申请日：2024-05-17

Applicant: 广西壮族自治区农业科学院

Inventor： 王益奎 ,  余楚英 ,  蒋雅琴 ,  李韦柳 ,  杨其洪 ,  甘桂云 ,  李文嘉 ,  蔡梁玉 ,  王鹏 ,  江高飞 ,  王孝芳

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6837 ,  C12N15/11 ,  C40B40/06

Abstract: 本发明提供了一组可准确区分茄子品系的SNP标记组合。基于收集的577份茄子品系全基因组重测序数据，从数百万个SNP中筛选出147个多态性SNP标记组合，成功构建了茄子品系的SNP指纹图谱。该标记组合在茄子12条染色体上均匀分布，多态性较高。本发明筛选的SNP标记组合能成功区分577个品系，且任意两个茄子品系之间差异SNP位点数大于10个。该标记组合可以为茄子品系核心种质的筛选、茄子品系遗传多样性分析、茄子品系SNP指纹图谱构建、茄子品系或纯度鉴定和茄子分子标记辅助育种等工作提供理论和数据支撑，具有较为重要的理论价值和应用意义。

公开(公告)号：CN118374628A

公开(公告)日：2024-07-23

申请号：CN202410612808.9

申请日：2024-05-17

Applicant: 广西壮族自治区农业科学院

Inventor： 王益奎 ,  余楚英 ,  李韦柳 ,  蒋雅琴 ,  甘桂云 ,  杨其洪 ,  李文嘉 ,  何小艳 ,  王鹏 ,  江高飞 ,  王孝芳

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11 ,  G16B20/20 ,  G16B20/40 ,  G16B25/20 ,  G16B45/00

Abstract: 本发明提供一种用于构建茄子品系分群的SNP分子标记组合。基于收集的577份茄子品系全基因组重测序数据，从数百万个SNP中筛选出1009个多态性SNP标记组合，成功构建了茄子品系分群的SNP标记组合。该标记组合在茄子12条染色体上均匀分布，多态性较高。基于该SNP标记的液相探针芯片标记密度高、自动化强、检测通量高等特征，更有利于建立茄子群体分群体系。该标记组合可以为茄子新品系鉴定、分子标记辅助选择育种、全基因组选择、群体遗传多样性分析等工作提供理论和数据支撑，具有较为重要的理论价值和应用意义。

公开(公告)号：CN119061184A

公开(公告)日：2024-12-03

申请号：CN202411292638.7

申请日：2024-09-14

Applicant: 广西壮族自治区农业科学院

Inventor： 王益奎 ,  余楚英 ,  李韦柳 ,  杨其洪 ,  蒋雅琴 ,  甘桂云 ,  蔡梁玉 ,  李文嘉 ,  何小艳

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6837 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供一种用于茄子基因分型的SNP标记组合，所述SNP分子标记组合包含有49851个SNP分子标记，所述49851个SNP位点的物理位置是基于茄子GUIQIE‑1(S.melongena)基因组序列对比确定的，具体SNP分子标记情况如说明书表1所示。所述SNP标记对应液相探针捕获位点数多、捕获率高，样本捕获SNP位点的比例在992.5‑99.70％之间，样本测序深度在59.25‑80.51之间，可用于茄子各种场景分析。

公开(公告)号：CN119506462A

公开(公告)日：2025-02-25

申请号：CN202411729415.2

申请日：2024-11-28

Applicant: 广西壮族自治区农业科学院

Inventor： 王益奎 ,  余楚英 ,  甘桂云 ,  杨其洪 ,  蒋雅琴 ,  李韦柳 ,  蔡梁玉 ,  何小艳

IPC: C12Q1/6895 ,  A01H1/04

Abstract: 本发明提供一种用于辣椒基因分型的SNP分子标记组合，所述SNP分子标记组合包含有30462个SNP分子标记，所述30462个SNP位点的物理位置是基于辣椒“Hot1”基因组序列对比确定的，具体SNP分子标记情况如说明书表1所示。所述SNP标记对应液相探针捕获位点数多、捕获率高，CC群捕获效率在90％以上，非CC群体CA、CF群在79％以上，CP群在51％左右。CP群与测序群体遗传背景差异较大，但其能捕获15k左右的标记，也能完成遗传背景评估，测序深度在7X以上。整体来看，捕获标记数可以完成遗传背景评估。

公开(公告)号：CN118813867A

公开(公告)日：2024-10-22

申请号：CN202411273397.1

申请日：2024-09-12

Applicant: 广西壮族自治区农业科学院

Inventor： 邓文韬 ,  甘桂云 ,  王益奎 ,  王鹏 ,  李韦柳 ,  蒋雅琴 ,  李文嘉 ,  杨其洪 ,  余楚英 ,  李蝶 ,  何小艳

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/686 ,  C12N15/11

Abstract: 本申请公开了一种鉴定茄子细胞质雄性不育性状的分子标记方法及应用，具体为一种与茄子细胞质雄性不育基因CMS312共显性的分子标记与应用。本申请的分子标记由CMS312‑F所示的DNA分子和CMS312‑R所示的DNA分子组成。通过实验证明：本发明的分子标记CMS312特异性强，可用于茄子分子标记辅助育种，通过苗期筛选即可对不育植株进行选择，可节约成本，提高选择效率，大大加速育种进程，为进一步克隆不育基因奠定了基础。