公开(公告)号：CN113284559B

公开(公告)日：2021-10-15

申请号：CN202110822106.X

申请日：2021-07-21

Applicant: 暨南大学

Inventor： 李宏业 ,  李达伟 ,  黄小龙 ,  黄丹 ,  杨维东

IPC: G16B30/10 ,  G06F16/245

Abstract: 本发明涉及一种物种基因组的启动子查询方法、系统及设备，该方法包括获取物种的基因组文件、基因组注释文件和fastq文件；依据基因组注释文件，对基因组文件中的所有基因进行排序处理，得到物种启动子文件；采用hisat2或Trinity软件将fastq文件转换为含有高表达基因的FPKM文件；采用步骤S1至步骤S3得到若干物种的物种启动子文件和FPKM文件，并通过若干物种的物种启动子文件和FPKM文件构建启动子数据库。该物种基因组的启动子查询方法可以在启动子数据库查询所需要的基因的启动子，不限制任意物种的基因启动子的查询，不需要额外借助辅助工具，且查询得到的启动子的准确率高。

公开(公告)号：CN116504313A

公开(公告)日：2023-07-28

申请号：CN202310511302.4

申请日：2023-05-08

Applicant: 暨南大学

Inventor： 李达伟 ,  李宏业 ,  黄小龙 ,  杨维东 ,  黄丹 ,  赖浩强

IPC: G16B30/00 ,  G16B40/00 ,  G16B50/00

Abstract: 本申请提供一种基因终止子查询方法、装置、设备及可读存储介质，当需要确定任意一个物种的高效终止子序列时，本申请可获取目标生物的基因组文件、基因组注释文件或目标生物的高通量数据文件，这几个文件均可以反馈目标生物的高效终止子序列，因此，在获取这几个文件之后，可依据基因组文件以及基因组注释文件或依据目标生物的高通量数据文件，生成所述目标生物的终止子序列；并基于目标生物的终止子序列，确定目标生物的高效终止子序列。由此，本申请可针对任一物种的基因组文件以及基因组注释文件或物种的高通量数据文件来精准查找对应的物种的高效终止子序列，适应性较强，且查询效率和准确度较高，可以适应不同物种改造载体的需求。

公开(公告)号：CN115992052A

公开(公告)日：2023-04-21

申请号：CN202211444531.0

申请日：2022-11-18

Applicant: 暨南大学

Inventor： 李达伟 ,  李宏业 ,  黄丹 ,  黄小龙 ,  杨维东 ,  吴思伟 ,  龙金思 ,  付耀武

IPC: C12N1/12 ,  A61K47/46 ,  A61K8/9706 ,  A61Q19/00 ,  C12R1/89

Abstract: 本发明涉及生物技术领域，尤其涉及一种微藻类外泌体、其制备方法和应用。本发明利用超速离心法从微拟球藻中提取获得微藻类外泌体，经检测，该微藻类外泌体能够运载色素蛋白和miRNA，不含任何与人来源或者动物来源外泌体同源的CD蛋白，其使用更加安全，在化妆品和药物、疫苗的制备和应用中具有广阔的前景。

公开(公告)号：CN113284559A

公开(公告)日：2021-08-20

申请号：CN202110822106.X

申请日：2021-07-21

Applicant: 暨南大学

Inventor： 李宏业 ,  李达伟 ,  黄小龙 ,  黄丹 ,  杨维东

IPC: G16B30/10 ,  G06F16/245

Abstract: 本发明涉及一种物种基因组的启动子查询方法、系统及设备，该方法包括获取物种的基因组文件、基因组注释文件和fastq文件；依据基因组注释文件，对基因组文件中的所有基因进行排序处理，得到物种启动子文件；采用hisat2或Trinity软件将fastq文件转换为含有高表达基因的FPKM文件；采用步骤S1至步骤S3得到若干物种的物种启动子文件和FPKM文件，并通过若干物种的物种启动子文件和FPKM文件构建启动子数据库。该物种基因组的启动子查询方法可以在启动子数据库查询所需要的基因的启动子，不限制任意物种的基因启动子的查询，不需要额外借助辅助工具，且查询得到的启动子的准确率高。