公开(公告)号：CN107868843B

公开(公告)日：2021-06-29

申请号：CN201711288256.7

申请日：2017-12-07

Applicant: 江汉大学

Inventor： 李伦 ,  方治伟 ,  周俊飞 ,  刘致浩 ,  彭海 ,  高丽芬 ,  李丽丽 ,  陈丽红

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种筛选绿豆高多态性分子标记位点的方法，将不同品种的绿豆种子等量混合后抽提总核酸；构建高通量测序文库；寻找基因组上的变异位点；通过滑动平移筛选高多态性位点；在候选位点两侧设计多重扩增引物；对多重引物的筛选后即获得新的高多态性分子标记位点。理论上本发明可以一次性筛选出基因组上所有可用的高多态性分子标记位点，并且可以直接用于品种的高通量检测；由于开发过程中已经综合了多个品种的基因组信息，因而不需要传统筛选方法中针对每个样品的反复验证过程；在应用上本方法所筛选出的分子标记位点可以批量检测，不需要对每个分子标记位点一个一个的做分子扩增和检测，因而加快了检测速度，并提高了准确性；本发明筛选出的分子标记多态性高、分辨率好，且筛选过程简单、快速且流程规范。

公开(公告)号：CN108004335A

公开(公告)日：2018-05-08

申请号：CN201711294441.7

申请日：2017-12-08

Applicant: 江汉大学

Inventor： 方治伟 ,  方光明 ,  李伦 ,  周俊飞 ,  刘致浩 ,  彭海 ,  高丽芬 ,  李丽丽 ,  陈丽红

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种白叶枯菌小种分离鉴定方法，属于小种鉴定技术领域。提取样品中的微生物的总核酸并构建高通量测序文库；寻找基因组上的变异位点；通过滑动平移筛选高多态性位点，并在候选位点两侧设计多重扩增引物；利用固体培养基分离样品中的单菌落并做进一步纯化，以获得单克隆菌落；提取菌落的基因组DNA后利用上述步骤设计的引物进行扩增并测序；基于测序结果单克隆菌落进行分型，具有不同基因型的菌落作为不同的小种进行后续研究。本方法不需要预先知道样品中的小种数量以及丰度等信息，也无需传统的筛选过程中所需要生理生化鉴定试验，只需通过高通量测序和扩增即可分离培养出样品中的全部小种，过程简单、快速且流程规范。

公开(公告)号：CN107868843A

公开(公告)日：2018-04-03

申请号：CN201711288256.7

申请日：2017-12-07

Applicant: 江汉大学

Inventor： 李伦 ,  方治伟 ,  周俊飞 ,  刘致浩 ,  彭海 ,  高丽芬 ,  李丽丽 ,  陈丽红

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2535/122

Abstract: 本发明公开了一种筛选绿豆高多态性分子标记位点的方法，将不同品种的绿豆种子等量混合后抽提总核酸；构建高通量测序文库；寻找基因组上的变异位点；通过滑动平移筛选高多态性位点；在候选位点两侧设计多重扩增引物；对多重引物的筛选后即获得新的高多态性分子标记位点。理论上本发明可以一次性筛选出基因组上所有可用的高多态性分子标记位点，并且可以直接用于品种的高通量检测；由于开发过程中已经综合了多个品种的基因组信息，因而不需要传统筛选方法中针对每个样品的反复验证过程；在应用上本方法所筛选出的分子标记位点可以批量检测，不需要对每个分子标记位点一个一个的做分子扩增和检测，因而加快了检测速度，并提高了准确性；本发明筛选出的分子标记多态性高、分辨率好，且筛选过程简单、快速且流程规范。