公开(公告)号：CN112941180A

公开(公告)日：2021-06-11

申请号：CN202110213621.8

申请日：2021-02-25

Applicant: 浙江大学医学院附属妇产科医院

Inventor： 陆燕 ,  孙喜伟 ,  周莉媛 ,  刘鹏渊 ,  陈恩国

IPC: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6809 ,  G16B25/20 ,  G16B20/30 ,  G16B5/00 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一组肺癌的DNA甲基化分子标志物及其在制备用于肺癌早期诊断试剂盒中的应用。所述标志物是20个基因CDO1，SOX17，TCF21，TRIM58，ITGA9，CYYR1，CLEC14A，SLIT2，ZNF677，IRX2，ACVRL1，OSR1，ADCY8，GALNT13，HSPB6，IRX1，ITGA5，PCDH17，TBX5和TCTEX1D1序列的甲基化。其中8个是在肺癌中新发现的甲基化指纹基因，包括ADCY8，GALNT13，HSPB6，IRX1，ITGA5，PCDH17，TBX5和TCTEX1D1。以本发明标志物为基础，构建肺癌诊断的数学模型；该模型灵敏度高，特异性好，AUC可高达0.998，诊断效果良好。本发明还公开了检测所述DNA甲基化标志物的方法。本发明公开的DNA甲基化分子标志物具有良好的诊断指标特性，可以有效用于肺癌诊断，具有较高的临床使用和推广价值。

公开(公告)号：CN108796048A

公开(公告)日：2018-11-13

申请号：CN201810663764.7

申请日：2018-06-25

Applicant: 浙江大学医学院附属妇产科医院

Inventor： 陆燕 ,  余梦倩 ,  刘鹏渊 ,  周莉媛

IPC: C12Q1/6851

CPC classification number: C12Q1/6851 ,  C12Q2561/101 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2525/191

Abstract: 本发明公开了一种精确分辨tRNA来源片段末端单个核苷酸差异的检测方法，包括以下步骤：(1)特异性接头序列、特异性逆转录引物与检测探针和引物序列的设计；(2)接头连接：在RNA中加入步骤(1)中设计的特异性接头序列，经过变性、退火、连接三步形成特异性末端环状发夹结构；(3)步骤(2)所述接头RNA与步骤(1)所述特异性逆转录引物混合进行逆转录；(4)TaqMan qPCR检测。本发明基于TaqMan qPCR方法，为生物体内tRF的研究提供了一种有效且便捷的可精确分辨不同tRF变体的方法，分辨率可精确至单个核苷酸差异，这对于全面深入研究tRF的生物学功能和作用机制具有有重要意义。