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公开(公告)号:CN114032321A
公开(公告)日:2022-02-11
申请号:CN202111277001.7
申请日:2021-10-29
Applicant: 海南大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明提出了一种用于检测蚕豆抗豆象品种的SSR标记及其应用。采用PacBio三代全长测序技术结合RNA‑seq的方法,对蚕豆品种进行全基因组测序,结合软件MISA对转录组的Unigene搜索,获得含有SSR核心基序的特异蚕豆基因组序列,根据SSR核心基序设计引物,该引物对用于对SSR标记进行扩增,其核苷酸序列为:上游引物:核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;下游引物:核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。SSR标记引物对用于扩增蚕豆基因组模板,PCR扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,检测PCR产物的带型,用于鉴定检测的蚕豆材料为抗豆象材料。本发明所提供的检测蚕豆对豆象抗性的方法可靠、简便、实用,在蚕豆种质资源鉴定和分子标记辅助育种选择中具有重要应用前景。
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公开(公告)号:CN114032321B
公开(公告)日:2023-08-18
申请号:CN202111277001.7
申请日:2021-10-29
Applicant: 海南大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明提出了一种用于检测蚕豆抗豆象品种的SSR标记及其应用。采用PacBio三代全长测序技术结合RNA‑seq的方法,对蚕豆品种进行全基因组测序,结合软件MISA对转录组的Unigene搜索,获得含有SSR核心基序的特异蚕豆基因组序列,根据SSR核心基序设计引物,该引物对用于对SSR标记进行扩增,其核苷酸序列为:上游引物:核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;下游引物:核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。SSR标记引物对用于扩增蚕豆基因组模板,PCR扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,检测PCR产物的带型,用于鉴定检测的蚕豆材料为抗豆象材料。本发明所提供的检测蚕豆对豆象抗性的方法可靠、简便、实用,在蚕豆种质资源鉴定和分子标记辅助育种选择中具有重要应用前景。
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