公开(公告)号：WO2014178555A1

公开(公告)日：2014-11-06

申请号：PCT/KR2014/003441

申请日：2014-04-21

Applicant: 숙명여자대학교산학협력단

Inventor： 박종훈 ,  우유미 ,  김영준 ,  배재범 ,  박은영 ,  이선영 ,  신유빈

IPC: A61K31/70 ,  A61K48/00 ,  A61K38/17 ,  A61K38/16

CPC classification number: A61K31/7068 ,  C07K14/47

Abstract: 본 발명자들은 상염색체 우성 다낭신의 후성적 변이와 그들의 기능적 관련성을 결정하기 위해 다낭신 및 비-다낭신 개체를 게놈 전체에서 무작위적으로 메틸화 프로파일링하여 분석하고 그들의 발현 데이타와 비교하였다. 흥미롭게도 이온전달 및 세포접합과 관련된 PKD1 및 다른 유전자들은 유전자 몸체 부분에서 과메틸화되었고, 그들의 발현은 다낭신에서 하향조절되었다. 특히, PKD1 은 다낭신 유전자 몸체 부분에서 과메틸화되었고 이것은 MBD2 (methyl-CpG-binding domain 2) 단백질 결합과 연관되어 있었다. 뿐만 아니라, DNA 메틸화 저해제 처리는 Pkd1 발현의 상향조절을 수반하며 MDCK (Madin-Darby Canine Kidney) 세포의 낭포 형성을 지연시켰다. 따라서, 본 발명은 PKD1 과 낭포형성과 관련된 조절 유전자들의 과메틸화가 낭포 형성에 있어서 결정적인 역할을 수행함을 보여주며, 상염색체 우성 다낭신의 치료용도로 이용할 수 있음을 제시한다.

Abstract translation: 为了确定常染色体显性多囊肾病的表观遗传学变异及其间的功能关联，本发明人已经使患有多囊肾病和无多囊肾病的个体通过基因组作为整体的随机方式通过甲基化分析进行分析。 有趣的是，在PKD1和其他与离子转运和细胞粘附相关的基因中，基因 - 体区域都有高甲基化，这些基因的表达在多囊肾病中下调。 特别地，在PKD1中，多囊肾病基因体区域中存在高甲基化，与MBD2（甲基CpG结合域2）蛋白结合有关。 此外，DNA甲基化抑制剂治疗伴随PKD1表达的上调，并引起MDCK（Madin-Darby犬肾）细胞中囊肿形成的延迟。 因此，这表明在本发明中，PKD1的高甲基化和与囊肿形成相关的调节基因在囊肿形成中起决定性作用，并且表明本发明可用于常染色体显性多囊肾病的治疗应用。

公开(公告)号：KR101667650B1

公开(公告)日：2016-10-20

申请号：KR1020140037758

申请日：2014-03-31

Applicant: 숙명여자대학교산학협력단

Inventor： 박종훈 ,  우유미 ,  이선영 ,  신유빈

IPC: A61K48/00 ,  C12N15/113 ,  C12Q1/68

Abstract: miRNA 마이크로어레이분석을이용하여비 다낭신과다낭신신장조직에서 miRNA 발현패턴을스크리닝한결과, miR-192/215와 miR-194는비 다낭신신장에비하여다낭신신장에서현저히하향조절되었다. 이 miRNA들은중간엽유전자로잘 알려진 ZEB2와 N-카데린의 3'UTR을직접적으로타겟으로하여다낭신에서상피-중간엽전이 (epithelial to mesenchymal transition; EMT) 단계에관여하였다. 뿐만아니라, miR-192/215와 miR-194 과발현은낭포성장저하를유도하는반면, miR-192/215와 miR-194 녹다운은 MDCK 세포 3차원배양시스템내에서낭포성장을촉진하였다. 더흥미로운것은 miR-192/215와 miR-194의하향조절이상염색체우성다낭신에서 DNA 과메틸화에서기인하는것으로보인다는점이다. 실제로, MIRA-seq에의한전체유전체의 DNA 메틸화분석결과, 다낭신에서많은과메틸화 miRNA가관찰되었다.의과메틸화패턴은파이로시퀀싱을통해상염색체우성다낭신신장조직에서입증되었다. CpG 탈메틸화에이용되는 5-aza-dC를처리하면 miR-192/miR-194와 EMT 관련타겟유전자들의발현수준이모두회복되었다. 이데이타들은 miR-192, miR205, miR-194가중간엽마커유전자를타겟으로하여낭포발달을감소시키며,의 DNA 과메틸화가상염색체우성다낭신에서그들의발현수준을감소시킴을말해준다.

公开(公告)号：KR1020140128657A

公开(公告)日：2014-11-06

申请号：KR1020130047338

申请日：2013-04-29

Applicant: 숙명여자대학교산학협력단

Inventor： 박종훈 ,  우유미 ,  김영준 ,  배재범 ,  박은영 ,  이선영 ,  신유빈

IPC: A61K31/70 ,  A61K48/00 ,  A61K38/17 ,  A61K38/16

CPC classification number: A61K31/7068 ,  C07K14/47

Abstract: 상염색체 우성 다낭신은 양쪽 신장에 액체가 든 여러 개의 낭포가 형성되는 것을 특징으로 하는 흔한 인간 유전병이다. 비록
PKD1 (
polycystic kidney disease 1 )의 변이가 상염색체 우성 다낭신을 일으키는 주요 원인이지만 개별 낭포형성의 국소적이고 산발적인 특성은 후성적 변이와 같은 또 다른 분자 메카니즘을 암시한다. 상염색체 우성 다낭신의 후성적 변이와 그들의 기능적 관련성을 결정하기 위해 다낭신 및 비-다낭신 개체를 게놈 전체에서 무작위적으로 메틸화 프로파일링하여 분석하고 그들의 발현 데이타와 비교하였다. 흥미롭게도 이온전달 및 세포접합과 관련된
PKD1 및 다른 유전자들은 유전자 몸체 부분에서 과메틸화되었고, 그들의 발현은 다낭신에서 하향조절되었는데, 이는 후성적 침묵화가 낭포형성에 관여하는 주요 메카니즘임을 암시하는 것이다. 특히,
PKD1 은 다낭신 유전자 몸체 부분에서 과메틸화되었고 이것은 MBD2 (methyl-CpG-binding domain 2) 단백질 결합과 연관되어 있었다. 뿐만 아니라, DNA 메틸화 저해제 처리는
Pkd1 발현의 상향조절을 수반하며 MDCK (Madin-Darby Canine Kidney) 세포의 낭포 형성을 지연시켰다. 이러한 결과들은
PKD1 녹다운이 낭포형성의 충분조건이라는 선행연구들과도 일치한다. 따라서, 본 발명은
PKD1 과 낭포형성과 관련된 조절 유전자들의 과메틸화가 낭포 형성에 있어서 결정적인 역할을 수행함을 보여주며, 상염색체 우성 다낭신의 치료용도로 이용할 수 있음을 제시한다.

Abstract translation: 常染色体显性多囊肾病是常见的遗传性疾病，其中在两个肾脏上形成多个具有液体的囊肿。 在本发明中，DNA甲基化抑制剂与5-氮杂-2'-脱氧胞苷（5-氮杂-dC）或zebularine的药物组合物有关，用于缓解或治疗常染色体显性多囊肾病。 本发明涉及用于缓解常染色体显性多囊肾病的药物组合物，其包括DNA甲基化抑制剂。

公开(公告)号：KR1020150114077A

公开(公告)日：2015-10-12

申请号：KR1020140037758

申请日：2014-03-31

Applicant: 숙명여자대학교산학협력단

Inventor： 박종훈 ,  우유미 ,  이선영 ,  신유빈

IPC: A61K48/00 ,  C12N15/113 ,  C12Q1/68

CPC classification number: A61K48/00 ,  C12N15/11

Abstract: miRNA 마이크로어레이분석을이용하여비 다낭신과다낭신신장조직에서 miRNA 발현패턴을스크리닝한결과, miR-192/215와 miR-194는비 다낭신신장에비하여다낭신신장에서현저히하향조절되었다. 이 miRNA들은중간엽유전자로잘 알려진 ZEB2와 N-카데린의 3'UTR을직접적으로타겟으로하여다낭신에서상피-중간엽전이 (epithelial to mesenchymal transition; EMT) 단계에관여하였다. 뿐만아니라, miR-192/215와 miR-194 과발현은낭포성장저하를유도하는반면, miR-192/215와 miR-194 녹다운은 MDCK 세포 3차원배양시스템내에서낭포성장을촉진하였다. 더흥미로운것은 miR-192/215와 miR-194의하향조절이상염색체우성다낭신에서 DNA 과메틸화에서기인하는것으로보인다는점이다. 실제로, MIRA-seq에의한전체유전체의 DNA 메틸화분석결과, 다낭신에서많은과메틸화 miRNA가관찰되었다.의과메틸화패턴은파이로시퀀싱을통해상염색체우성다낭신신장조직에서입증되었다. CpG 탈메틸화에이용되는 5-aza-dC를처리하면 miR-192/miR-194와 EMT 관련타겟유전자들의발현수준이모두회복되었다. 이데이타들은 miR-192, miR205, miR-194가중간엽마커유전자를타겟으로하여낭포발달을감소시키며,의 DNA 과메틸화가상염색체우성다낭신에서그들의발현수준을감소시킴을말해준다.

Abstract translation: 本发明涉及一种用于治疗包含miR-192，miR-215或miR-194的人常染色体显性多囊肾病的药物组合物，更具体地涉及用于治疗人常染色素显性多囊肾病的药物组合物，其包含一个或多个所选择的 来自miR-192，miR-215和miR-194。

公开(公告)号：KR101486248B1

公开(公告)日：2015-01-27

申请号：KR1020130047338

申请日：2013-04-29

Applicant: 숙명여자대학교산학협력단

Inventor： 박종훈 ,  우유미 ,  김영준 ,  배재범 ,  박은영 ,  이선영 ,  신유빈

IPC: A61K31/70 ,  A61K48/00 ,  A61K38/17 ,  A61K38/16

CPC classification number: A61K31/7068 ,  C07K14/47

Abstract: 상염색체 우성 다낭신은 양쪽 신장에 액체가 든 여러 개의 낭포가 형성되는 것을 특징으로 하는 흔한 인간 유전병이다. 비록
PKD1 (
polycystic kidney disease 1 )의 변이가 상염색체 우성 다낭신을 일으키는 주요 원인이지만 개별 낭포형성의 국소적이고 산발적인 특성은 후성적 변이와 같은 또 다른 분자 메카니즘을 암시한다. 상염색체 우성 다낭신의 후성적 변이와 그들의 기능적 관련성을 결정하기 위해 다낭신 및 비-다낭신 개체를 게놈 전체에서 무작위적으로 메틸화 프로파일링하여 분석하고 그들의 발현 데이타와 비교하였다. 흥미롭게도 이온전달 및 세포접합과 관련된
PKD1 및 다른 유전자들은 유전자 몸체 부분에서 과메틸화되었고, 그들의 발현은 다낭신에서 하향조절되었는데, 이는 후성적 침묵화가 낭포형성에 관여하는 주요 메카니즘임을 암시하는 것이다. 특히,
PKD1 은 다낭신 유전자 몸체 부분에서 과메틸화되었고 이것은 MBD2 (methyl-CpG-binding domain 2) 단백질 결합과 연관되어 있었다. 뿐만 아니라, DNA 메틸화 저해제 처리는
Pkd1 발현의 상향조절을 수반하며 MDCK (Madin-Darby Canine Kidney) 세포의 낭포 형성을 지연시켰다. 이러한 결과들은
PKD1 녹다운이 낭포형성의 충분조건이라는 선행연구들과도 일치한다. 따라서, 본 발명은
PKD1 과 낭포형성과 관련된 조절 유전자들의 과메틸화가 낭포 형성에 있어서 결정적인 역할을 수행함을 보여주며, 상염색체 우성 다낭신의 치료용도로 이용할 수 있음을 제시한다.

公开(公告)号：KR101468446B1

公开(公告)日：2014-12-22

申请号：KR1020130047336

申请日：2013-04-29

Applicant: 숙명여자대학교산학협력단

Inventor： 박종훈 ,  우유미 ,  이선영 ,  신유빈

IPC: A61K38/16 ,  A61K48/00 ,  A61K38/17

Abstract: 상염색체우성다낭신은흔한인간유전병이고, 액체가찬 낭포가다수개 형성되는것을특징으로하며, 말기신장질환으로진행된다. 그러나, 아직까지도조기진단및 치료가어려운상황이다. 본발명자들은게놈전체의무작위적메틸화프로파일링분석결과로부터, 비다낭신과비교하여다낭신환자신장조직에서는 MUPCDH (mucin-like protocadherin) 유전자의프로모터부위가과메틸화됨을밝혔다. MUPCDH 프로모터부위의 CpG 다이뉴클레오타이드에서메틸화상태는중아황산염 (bisulfite) 처리후 MS-HRM 분석및 EpiTYPER로확인하였다. 다낭신신장조직에서는 MUPCDH 발현수준이현저히감소하였고, 이것은불멸화한인간다낭신신장상피세포에 DNA 메틸화저해제를처리하였을때 회복되었다. 또한, MUPCDH 유전자하향조절은세포증식증대와관련되었고, 이는다낭신낭포형성에핵심적인특징중 하나이다. 결론적으로, 본발명의결과들은 MUPCDH 프로모터 CpG 아일랜드의잘못된메틸화상태가발현수준감소와음의상관관계를이루어다낭신에서비정상적인세포증식에기여할수 있음을말해준다.

公开(公告)号：KR1020140128655A

公开(公告)日：2014-11-06

申请号：KR1020130047336

申请日：2013-04-29

Applicant: 숙명여자대학교산학협력단

Inventor： 박종훈 ,  우유미 ,  이선영 ,  신유빈

IPC: A61K38/16 ,  A61K48/00 ,  A61K38/17

CPC classification number: A61K38/1709 ,  A61K48/0008

Abstract: 상염색체 우성 다낭신은 흔한 인간 유전병이고, 액체가 찬 낭포가 다수 개 형성되는 것을 특징으로 하며, 말기 신장질환으로 진행된다. 그러나, 아직까지도 조기 진단 및 치료가 어려운 상황이다. 본 발명자들은 게놈 전체의 무작위적 메틸화 프로파일링 분석 결과로부터, 비다낭신과 비교하여 다낭신 환자 신장조직에서는 MUPCDH (mucin-like protocadherin) 유전자의 프로모터 부위가 과메틸화됨을 밝혔다. MUPCDH 프로모터 부위의 CpG 다이뉴클레오타이드에서 메틸화 상태는 중아황산염 (bisulfite) 처리후 MS-HRM 분석 및 EpiTYPER로 확인하였다. 다낭신 신장조직에서는 MUPCDH 발현수준이 현저히 감소하였고, 이것은 불멸화한 인간 다낭신 신장상피세포에 DNA 메틸화 저해제를 처리하였을 때 회복되었다. 또한, MUPCDH 유전자 하향조절은 세포증식 증대와 관련되었고, 이는 다낭신 낭포형성에 핵심적인 특징 중 하나이다. 결론적으로, 본 발명의 결과들은 MUPCDH 프로모터 CpG 아일랜드의 잘못된 메틸화 상태가 발현수준 감소와 음의 상관관계를 이루어 다낭신에서 비정상적인 세포증식에 기여할 수 있음을 말해준다.

Abstract translation: 常染色体显性多囊肾病（ADPKD）是一种常见的人类遗传疾病，其特征在于在两个肾脏中形成多个充满液体的囊肿，并可进展至终末期肾脏疾病。 然而，ADPKD的早期诊断和治疗仍然难以做出。 从全基因组甲基化谱分析结果可以看出，ADPKD患者肾组织中粘蛋白样原螯合素（MUPCDH）基因启动子区域高度高度甲基化，与ADPKD组相比差异无统计学意义。 在亚硫酸氢盐处理后，通过甲基化敏感高分辨率熔解（MS-HRM）分析和EpiTYPER验证了MUPCDH启动子区CpG二核苷酸甲基化状态的增加。 ADPKD组织中MUPCDH表达水平显着降低，但通过用永生化人ADPKD囊性上皮细胞中的DNA去甲基化试剂进行恢复。 此外，MUPCDH基因的下调与增加的细胞增殖有关，这是ADPKD中囊肿形成的关键特征之一。 因此，本发明的结果表明，MUPCDH启动子CpG岛的异常甲基化状态与MUPCDH基因的表达水平降低呈负相关，并且有助于ADPKD中的异常细胞增殖。