公开(公告)号：KR100879628B1

公开(公告)日：2009-01-21

申请号：KR1020080044678

申请日：2008-05-14

Applicant: 재단법인서울대학교산학협력재단

Inventor： 김연숙 ,  이석근 ,  박상철 ,  지제근 ,  정수일

IPC: A61K38/16 ,  C07K14/00

Abstract: 본 발명은 사람에서 발현되는 항균, 항암, 면역활성 단백질인 사람의 짧은 나선형 펩티드-1 (human short helical peptide-1, hSHP-1), hSHP-1을 포함하는 항균, 항암, 면역자극 활성용 약학적 조성물, hSHP-1 펩티드를 투여하는 단계를 포함하는 항균, 항암, 면역자극 활성을 위한 치료방법에 관한 것이다.
hSHP, 짧은 나선형 펩티드, 항균 항암 단백질

公开(公告)号：KR1020070116442A

公开(公告)日：2007-12-10

申请号：KR1020060050487

申请日：2006-06-05

Applicant: 재단법인서울대학교산학협력재단

Inventor： 김연숙 ,  이석근 ,  박상철 ,  지제근 ,  정수일

IPC: C07K14/00

CPC classification number: C07K14/4723 ,  A61K38/00

Abstract: A novel human short helical peptide-1(hSHP-1) is provided which is specifically expressed in human and has antimicrobial, antitumor, and immune stimulating activity. And a pharmaceutical composition for antimicrobial, antitumor, and immune stimulating activity and antimicrobial living articles comprising the same peptide are provided. A peptide having anti-microbial, anti-tumor or immune stimulating activity is selected from the group consisting of: (a) an N-terminal of the peptide selected from the group consisting of 12th to 31st amino acid residues of a sequence described in SEQ ID : NO. 2, and a C-terminal of the peptide selected from the group consisting of 45th to 46th amino acid residues of a sequence described in SEQ ID : NO. 2 and having more than 16-mer; and (b) a tandem repeat of the peptide(a). A pharmaceutical composition for treating infectious diseases of oral cavity, eyeball, hair, skin, nasal cavity, gastrointestine, peritoneum, pleura, prostate, bladder, urinary tract, articular capsule, pituitary gland diaphragm, outer ear, inner ear, bone marrow or internal important organs comprises the peptide as an effective ingredient.

Abstract translation: 提供了一种新型人类短螺旋肽-1（hSHP-1），其在人体中特异性表达并具有抗微生物，抗肿瘤和免疫刺激活性。 并且提供了包含相同肽的抗微生物，抗肿瘤和免疫刺激活性的药物组合物和抗微生物生物制品。 具有抗微生物，抗肿瘤或免疫刺激活性的肽选自：（a）肽的N-末端，其选自SEQ ID NO：12所示序列的第12位至第31位氨基酸残基 证件号码。 2和选自SEQ ID NO：1所示序列的第45位至第46位氨基酸残基的肽的C-末端。 2并且具有超过16个词; 和（b）肽（a）的串联重复。 一种用于治疗口腔，眼球，头发，皮肤，鼻腔，胃肠道，腹膜，胸膜，前列腺，膀胱，尿道，关节囊，垂体腺膜，外耳，内耳，骨髓或内部的感染性疾病的药物组合物 重要器官包括肽作为有效成分。

公开(公告)号：KR1020080048016A

公开(公告)日：2008-05-30

申请号：KR1020080044678

申请日：2008-05-14

Applicant: 재단법인서울대학교산학협력재단

Inventor： 김연숙 ,  이석근 ,  박상철 ,  지제근 ,  정수일

IPC: A61K38/16 ,  C07K14/00

Abstract: A human short helical peptide-1(hSHP-1) secreted from human is provided to show strong antimicrobial, anticancer and immunoreaction stimulating activities with no allergic reaction, thereby being used as a pharmaceutical composition for preventing and treating infectious mucosal diseases. A pharmaceutical composition for treating infectious diseases of oral cavity, eyeball, hair, skin, nasal cavity, gastrointestinal tract, peritoneum, pleura, vagina, prostate, bladder, urethra, bursa, hypophysis membrane, outer ear, inner ear, bone marrow or an internal important organs comprises at least one peptide of SEQ ID : NOs. 3, 4, 5, 6, and 7 or a tandem repeat thereof as an effective ingredient, wherein pathogen of the infectious disease is Gram negative or Gram positive bacteria, fungus, encapsulated virus or methicillin-resistant bacteria.

Abstract translation: 提供从人分泌的人类短螺旋肽-1（hSHP-1），以显示强的抗微生物，抗癌和免疫反应刺激活性，无过敏反应，从而用作预防和治疗感染性粘膜疾病的药物组合物。 一种用于治疗口腔，眼球，头发，皮肤，鼻腔，胃肠道，腹膜，胸膜，阴道，前列腺，膀胱，尿道，粘液囊，垂体膜，外耳，内耳，骨髓或骨髓的感染性疾病的药物组合物 内部重要器官包含至少一种SEQ ID NO：的肽。 3,4,5,6和7或其串联重复作为有效成分，其中感染性疾病的病原体是革兰氏阴性或革兰氏阳性菌，真菌，包封的病毒或耐甲氧西林的细菌。

公开(公告)号：KR100847287B1

公开(公告)日：2008-07-21

申请号：KR1020060050487

申请日：2006-06-05

Applicant: 재단법인서울대학교산학협력재단

Inventor： 김연숙 ,  이석근 ,  박상철 ,  지제근 ,  정수일

IPC: C07K14/00

CPC classification number: C07K14/4723 ,  A61K38/00

Abstract: 본 발명은 사람에서 발현되는 항균, 항암, 면역활성 단백질인 사람의 짧은 나선형 펩티드-1 (human short helical peptide-1, hSHP-1), hSHP-1을 포함하는 항균, 항암, 면역자극 활성용 약학적 조성물, hSHP-1 펩티드를 투여하는 단계를 포함하는 항균, 항암, 면역자극 활성을 위한 치료방법에 관한 것이다.
hSHP, 짧은 나선형 펩티드, 항균 항암 단백질

公开(公告)号：KR101287040B1

公开(公告)日：2013-07-17

申请号：KR1020070011753

申请日：2007-02-05

Applicant: 재단법인서울대학교산학협력재단

Inventor： 이석근 ,  김연숙 ,  이윤우 ,  지제근 ,  박상철 ,  이대성 ,  이대관

IPC: C12Q1/68

Abstract: 본원 발명은 뉴클레오타이드 염기의 극성을 이용한 뉴클레오타이드의 시각화 및 극성구조 분석 방법, 그리고 이를 이용한 유전자 코드 분석 프로그램 및 유전자 코드 분석 장치에 관한 것이다.
본원 발명은 특히 (i) 유전자의 염기서열에서 A, G, T 또는 U, 그리고 C의 뉴클레오타이드 염기들을 수평선을 중심으로 A는 위쪽 빈 반원, G는 위쪽 찬 반원, T 또는 U는 아래쪽 빈 반원, 그리고 C는 아래쪽 찬 반원의 기호로 시각화하는 단계; (ⅱ) 상기의 기호로 표시된 뉴클레오타이드의 염기서열의 배열에서 피리미딘(들)-퓨린(들)의 연속 배열을 묶어서 뉴클레오타이드 마디(segment)로 구분하는 단계; 및 (ⅲ) 상기 구분된 뉴클레오타이드 마디(segments)들에 대하여 뉴클레오타이드 내부의 전자의 이동 패턴을 이용하여 뉴클레오타이드 총 염기쌍 결합 에너지(total DHE/DS), 뉴클레오타이드 마디 평균 염기쌍 결합 에너지(average DHE/DS) 및 뉴클레오타이드 마디 극성 염기쌍 결합 에너지(polarity DHE/DS)를 계산하는 단계를 포함하는 뉴클레오타이드 염기의 극성을 이용한 뉴클레오타이드의 시각화 및 극성구조 분석 방법을 제공한다.
이러한 뉴클레오타이드 염기의 극성 분석은 PCR 프라이머나 DNA 프로브를 위한 DNA 염기서열의 선택, DNA에서 제한효소 절단 부위 검색, 지노믹 DNA (gDNA)에서 프로모터 부위 또는 엑손과 인트론 염기서열 구분, 유전자 변이 탐색 등에 활용할 수 있으며, DNA 코드의 정전기적 구조를 통하여 DNA 복제 또는 RNA 전사를 위한 DNA 코드 암호를 해독하는 데에 효과적으로 사용할 수 있다.
뉴클레오타이드, 염기, 극성, 시각화, 극성구조

公开(公告)号：KR1020080073130A

公开(公告)日：2008-08-08

申请号：KR1020070011753

申请日：2007-02-05

Applicant: 재단법인서울대학교산학협력재단

Inventor： 이석근 ,  김연숙 ,  이윤우 ,  지제근 ,  박상철 ,  이대성 ,  이대관

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: G06F19/26 ,  C12Q1/6811 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2563/116

Abstract: A method for visualizing nucleotide and analyzing polarity thereof is provided to be applied to select a DNA sequence for a PCR primer or a DNA probe, search a restriction site from DNA, differentiate a promoter region from exon and intron from a genomic DNA(gDNA), and search for genetic mutation and be effectively used to decipher a DNA code cipher through an electrostatic structure of the DNA code. A method for visualizing nucleotide and analyzing polarity thereof comprises the steps of: (a) visualizing nucleotide bases of A, G, T or U, and C in a sequence to mark A as an upper empty semicircle, G as an upper full semicircle, T or U as a lower empty semicircle, and C as a lower full semicircle based on the horizon; (b) putting together a continuous arrangement of pyrimidine(s)-purine(s) from an arrangement of a sequence proceeding from 5' end to 3' end of the marked nucleotide and dividing it into a nucleotide segment; and (c) calculating a nucleotide total base pair binding energy(total DHE/DS), a nucleotide segment average base pair binding energy(average DHE/DS), and a nucleotide segment polarity base pair binding energy(polarity DHE/DS) regarding the divided nucleotide segments using a migration pattern of electrons inside of the nucleotide.

Abstract translation: 为了选择PCR引物或DNA探针的DNA序列，提供了核苷酸可视化和极性分析的方法，从DNA的限制位点搜索，从基因组DNA（gDNA）区分启动子区域与外显子和内含子， 并寻找遗传突变，并通过DNA代码的静电结构有效地用于破译DNA密码。 可视化核苷酸和分析其极性的方法包括以下步骤：（a）将A，G，T或U和C的核苷酸碱基以序列形式显现，将A标记为上空半圆，G作为上半圆， T或U作为下半空半圆，C为基于水平线的较低全半圆; （b）从标记核苷酸的5'末端到3'末端的序列排列组合一个或多个嘧啶连续排列，并将其分成核苷酸区段; 和（c）计算核苷酸总碱基对结合能（总DHE / DS），核苷酸区段平均碱基对结合能（平均DHE / DS）和核苷酸区段极性碱基对结合能（极性DHE / DS） 分割的核苷酸片段使用核苷酸内部的电子迁移模式。