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公开(公告)号：WO2018026235A1
公开(公告)日：2018-02-08
申请号：PCT/KR2017/008448
申请日：2017-08-04
Applicant: 충남대학교산학협력단 , (주)글라이칸
IPC: G01N33/68
CPC classification number: G01N33/68
Abstract: 과제: 단백질의 당쇄화는 체내외 환경변화에 매우 민감하여 암을 포함한 다양한 질병에 직접적으로 관련되어 진단시스템에 활용하려는 연구가 진행되고 있다. 당사슬을 이용한 질병진단 방법은 매우 효율적이나, 당사슬을 분리하여 진단에 사용할 경우 시료 전처리, 질량분석 및 데이터 처리에 많은 시간과 노력이 요구되고 원하지 않는 인공조성물이 생성될 수 있다. 해결수단: 이를 최소화하고자 당쇄화된 단백질을 있는 그대로 분석하여 암진단에 적용하는 새로운 암진단 분석방법을 발명하였다. 본 발명에서는 다량체 구조의 햅토글로빈의 이황화 결합을 절단하여 알파 사슬과 베타 사슬로 분리한 후 전분자량을 측정함으로써 베타 사슬의 당쇄화 패턴을 분석하였다. 당사슬을 분리하지 않고 이황화 결합 절단이라는 최소한의 전처리만 수행한 후 10분 이내의 짧은 질량분석시간 소요 및 신속한 데이터 처리를 통해 단백질의 당쇄화 패턴을 인식함으로써 질병진단시 빠르고 정확한 진단방법으로 활용할 수 있다.
Abstract translation: 挑战：蛋白质糖基化对身体环境的变化高度敏感，正在研究将其用于与包括癌症在内的各种疾病直接相关的诊断系统。 使用寡糖来诊断疾病是非常有效的，但是当将寡糖分离并用于诊断时，样品制备，质量分析和数据处理需要很多时间和精力，并且可以产生不希望的人造组合物。 解决方案：为了尽量减少这种情况，我们发明了一种新的癌症诊断分析方法，可以将糖基化蛋白原样分析并应用于癌症诊断。 在本发明中，将多因子结构的二硫键切断，将其分成α链和β链，然后测定总分子量，分析β链的糖链模式。 不通过经由二硫键裂解识别的蛋白的糖基化模式，至少去除寡糖，走短质谱10分钟内后仅进行前处理和快速的数据处理可以作为一个快速和准确的诊断时的疾病的诊断 。
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公开(公告)号：WO2015199282A1
公开(公告)日：2015-12-30
申请号：PCT/KR2014/008882
申请日：2014-09-24
Applicant: 충남대학교산학협력단
IPC: C07H1/06
CPC classification number: C08H1/00 , C08B37/0003 , C08B37/006 , C12P19/12 , C12Y114/18001 , C12Y305/01052
Abstract: 본 발명은 비드 고정화 (Bead Immobiliization) 방법을 이용하여 N-당쇄와 O-당쇄가 동시에 존재하는 당단백질에서 O-당쇄만을 선택적으로 추출 및 분리할 수 있는 방법에 관한 것이다. 좀 더 구체적으로는 N-당쇄와 O-당쇄가 모두 존재하는 당단백질을 비드에 고정시키고 N-당쇄만 선택적으로 분리할 수 있는 특이적 효소인 PNGase F를 이용하여 N-당쇄를 제거한 후 β-제거 (β-elimination)를 통해 O-당쇄만을 선택적으로 분리하는 것이다. 본 발명의 비파괴적인 O-당쇄 분리방법은 다양한 당단백질에서 O-당쇄 분석에 효과적으로 이용될 수 있다.
Abstract translation: 本发明涉及一种能够通过使用珠固定方法从N-糖苷和O-聚糖共存的糖蛋白中仅选择性提取和分离O-聚糖的方法。 更具体地，其中N-聚糖和O-聚糖共存的糖蛋白固定在珠粒上; 使用能够选择性分离N-聚糖的特异性酶PNGase F来除去N-聚糖; 然后仅通过β-消除选择性地分离O-聚糖。 本发明的O-聚糖分离的非破坏性方法可以有效地用于各种糖蛋白中的O-聚糖分析。
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公开(公告)号：KR101748588B1
公开(公告)日：2017-06-19
申请号：KR1020150190775
申请日：2015-12-31
Applicant: 충남대학교산학협력단
Abstract: 본발명은난소암진단용 N-당사슬마커에관한것으로서, 혈청, 혈액, 복수등을포함한체액및 조직에서유래된당단백질시료가대용량일경우높은재현성을보장하면서기존의방법보다고속으로당사슬을추출하는자동화시스템을이용하고고감도고분해능질량분석기를이용하여대량의시료로부터난소암진단용 N-당사슬마커를탐지하는방법및 탐지한난소암진단용 N-당사슬빈도마커(frequency marker) 및정량마커(abundance marker)에관한것이다.
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公开(公告)号：KR101712368B1
公开(公告)日：2017-03-06
申请号：KR1020160099406
申请日：2016-08-04
Applicant: 충남대학교산학협력단 , (주)글라이칸
IPC: G01N33/68
CPC classification number: G01N33/68 , G01N33/6893 , G01N33/6848 , G01N2560/00 , G01N2800/50
Abstract: 과제: 단백질의당쇄화는체내외환경변화에매우민감하여암을포함한다양한질병에직접적으로관련되어진단시스템에활용하려는연구가진행되고있다. 당사슬을이용한질병진단방법은매우효율적이나, 당사슬을분리하여진단에사용할경우시료전처리, 질량분석및 데이터처리에많은시간과노력이요구되고원하지않는인공조성물이생성될수 있다. 해결수단: 이를최소화하고자당쇄화된단백질을있는그대로분석하여암진단에적용하는새로운암진단분석방법을발명하였다. 본발명에서는다량체구조의햅토글로빈의이황화결합을절단하여알파사슬과베타사슬로분리한후 전분자량을측정함으로써베타사슬의당쇄화패턴을분석하였다. 당사슬을분리하지않고이황화결합절단이라는최소한의전처리만수행한후 10분이내의짧은질량분석시간소요및 신속한데이터처리를통해단백질의당쇄화패턴을인식함으로써질병진단시빠르고정확한진단방법으로활용할수 있다.
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公开(公告)号：KR101479622B1
公开(公告)日：2015-01-06
申请号：KR1020140076237
申请日：2014-06-23
Applicant: 충남대학교산학협력단
IPC: C07H1/06
CPC classification number: C08H1/00 , C08B37/0003 , C08B37/006 , C12P19/12 , C12Y114/18001 , C12Y305/01052
Abstract: 본 발명은 비드 고정화 (Bead Immobiliization) 방법을 이용하여 N-당쇄와 O-당쇄가 동시에 존재하는 당단백질에서 O-당쇄만을 선택적으로 추출 및 분리할 수 있는 방법에 관한 것이다. 좀 더 구체적으로는 N-당쇄와 O-당쇄가 모두 존재하는 당단백질을 비드에 고정시키고 N-당쇄만 선택적으로 분리할 수 있는 특이적 효소인 PNGase F를 이용하여 N-당쇄를 제거한 후 β-제거 (β-elimination)를 통해 O-당쇄만을 선택적으로 분리하는 것이다. 본 발명의 비파괴적인 O-당쇄 분리방법은 다양한 당단백질에서 O-당쇄 분석에 효과적으로 이용될 수 있다.
Abstract translation: 本发明涉及一种使用珠固定技术从N-糖苷和O-聚糖同时存在的糖蛋白中仅选择性提取和分离O-聚糖的方法。 更具体地说，通过使用能够将N-聚糖和O-聚糖同时存在的糖蛋白固定在珠粒上并能够选择性分离N-聚糖的特异性酶的PNGase F，除去N-聚糖，仅将O-聚糖 通过β-消除选择性分离。 用于分离本发明的O-聚糖的非破坏性方法可以有效地用于分析各种糖蛋白中的O-聚糖。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：KR1020160112457A
公开(公告)日：2016-09-28
申请号：KR1020150038222
申请日：2015-03-19
Applicant: 충남대학교산학협력단
CPC classification number: G01N33/6848 , C07K1/12 , C07K1/34 , G01N33/15
Abstract: 본발명은당단백질에서당사슬다양성을포함한당자리위치를확인하고분석하는방법에관한것으로서, 좀더 자세히는바이오의약품등으로이용되는당단백질을단백질분해효소를이용하여 N-당펩타이드와 O-당펩타이드로분리할수 있는분석법에관한것이다. 본발명의방법은다중화분해효소를처리하고및 특정분자량추출법(Molecular Weight Cut Off filtration)을이용하여당펩타이드를생성하고, 이를분리하여 N-당펩타이드와 O-당펩타이드의동시분석이가능하며, 인접한당자리도완벽히분리하여확인할수 있다. 본발명의분석방법에따라얻어진결과를이용하여당단백질의약품에서당자리에따른당사슬의조성및 정량정보를나타내는당단백질의약품의 2D 도식도를제작할수 있다.
Abstract translation: 本发明涉及一种用于确认和分析包含糖蛋白中的糖链多糖的糖位置的方法。 更具体地，本发明涉及通过使用蛋白酶将用作生物医药产品等的糖蛋白分离成N-糖肽和O-糖肽的分析方法。 根据本发明的方法，处理多重分解酶，并通过使用特定的分子量截留过滤方案产生糖肽。 相同的分离，可以同时分析N-糖肽和O-糖肽。 另外，相邻的糖坐下可以完美地分别确认。 通过使用根据本发明的分析方法获得的结果，可以制备出显示根据糖蛋白医用产品中的糖位点的糖链的组成和定量信息的糖蛋白医用产品的2D图。
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公开(公告)号：KR101484969B1
公开(公告)日：2015-01-22
申请号：KR1020140035062
申请日：2014-03-26
Applicant: 충남대학교산학협력단 , 한국과학기술원
IPC: C07K1/14 , G01N33/574 , G01N33/68 , G01N33/58
Abstract: 본 발명은 바이오마커로서 부위 특이적으로 Ｎ-당쇄화된 당펩타이드를 이용하여 바이오마커의 N-당쇄변화를 탐지하는 방법에 관한 것이다. 좀 더 구체적으로, 본 발명에서는 비특이적 단백질 분해효소를 이용하여 혈액의 햅토글로빈을 펩타이드와 당펩타이드로 분해하였으며, 207번과 211번 등 총 4개의 N-당쇄화 부위를 가진 당펩타이드만을 분리하였다. 본 발명자들은 이렇게 얻은 4개의 N-당쇄화 부위에 결합된 당펩타이드를 이용하여 종양 특이적 바이오마커를 발굴함으로써 고특이적이고 고감도인 종양의 N-당쇄변화를 탐지하는 방법을 발명하기에 이르렀다.
Abstract translation: 本发明涉及通过使用位点直接N-糖基化糖肽作为生物标志物来检测生物标志物的N-聚糖的变化的方法。 具体地说，在本发明中，通过使用非特异性蛋白酶将血液的触珠蛋白分解为肽和糖肽，分离出具有总共4个N-糖基化位点的糖肽，例如No.207，No.211等。 本发明人通过使用与同样获得的四个N-糖基化位点结合的糖肽发现了肿瘤特异性生物标志物，从而开发了以高特异性和高灵敏度检测肿瘤N-聚糖变化的方法。
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公开(公告)号：KR102222002B1
公开(公告)日：2021-03-02
申请号：KR1020190112926
申请日：2019-09-11
Applicant: 충남대학교산학협력단
IPC: G01N33/574 , G01N33/68 , G16B40/10
Abstract: 표적당단백질의부위특이적당쇄화정보는질병진단에고민감도바이오마커를제공할수 있다. 일반적으로부위특이적당쇄화분석은두 가지다른방법, 즉트립신소화를이용한프로테옴접근과탠덤 MS를이용한프로테옴접근또는프로네이즈소화를이용한글리코믹스접근방식으로수행되었다. 그러나기존의두 가지접근방식의데이터처리와해석은어렵고지루하며시간이많이소요되었다. 따라서다량의임상시료세트에대해높은고민감도와고특이성을나타내는용이하고직접적인방법이요구되어왔다. 본발명에서는표적혈청합토글로빈(Hp)을위한중간-상하향글라이코프로테옴방법을발명하여비교적간단한시료준비와데이터처리및 해석방법으로임상시료를분석하여위암바이오마커를발견하였다. 트립신이생성하는 Hp의글라이코폼은펩타이드순서에따라 3개의당펩타이드군으로분류할수 있으며, 각각 3개군에서 10, 15, 14개의잠재적바이오마커(p
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公开(公告)号：KR101825647B1
公开(公告)日：2018-02-09
申请号：KR1020170008409
申请日：2017-01-18
Applicant: 충남대학교산학협력단 , (주)글라이칸
IPC: G01N33/68
CPC classification number: G01N33/6893 , G01N33/6848 , G01N2560/00 , G01N2800/50
Abstract: 과제: 단백질의당쇄화는체내외환경변화에매우민감하여암을포함한다양한질병에직접적으로관련되어진단시스템에활용하려는연구가진행되고있다. 당사슬을이용한질병진단방법은매우효율적이나, 당사슬을분리하여진단에사용할경우시료전처리, 질량분석및 데이터처리에많은시간과노력이요구되고원하지않는인공조성물이생성될수 있다. 해결수단: 이를최소화하고자당쇄화된단백질을있는그대로분석하여암진단에적용하는새로운암진단분석방법을발명하였다. 본발명에서는다량체구조의햅토글로빈의이황화결합을절단하여알파사슬과베타사슬로분리한후 전분자량을측정함으로써베타사슬의당쇄화패턴을분석하였다. 당사슬을분리하지않고이황화결합절단이라는최소한의전처리만수행한후 10분이내의짧은질량분석시간소요및 신속한데이터처리를통해단백질의당쇄화패턴을인식함으로써질병진단시빠르고정확한진단방법으로활용할수 있다.
Abstract translation: 挑战：蛋白质糖基化对人体环境的变化非常敏感，正在进行的研究将其直接用于诊断系统中的各种疾病，包括癌症。 使用寡糖来诊断疾病是非常有效的，但是当分离寡糖并用于诊断时，样品制备，质量分析和数据处理需要很多时间和精力，并且可以生产不需要的人造组合物。 解决方案：为了尽量减少这种情况，我们发明了一种新的癌症诊断分析方法，可以将糖基化蛋白原样分析并应用于癌症诊断。 在本发明中，糖基化的β链的分析模式被切断，由α链和由前测定分子量的一对触觉循环赛切换块状体组合物中的β链二硫键分离。 不通过执行切割的仅有最小预处理之后识别通过二硫键的蛋白质的糖基化模式中删除该低聚糖需要10分钟或更少的短质谱时间和快速的数据处理可以作为一个快速和准确的诊断时的疾病的诊断。
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公开(公告)号：KR101754752B1
公开(公告)日：2017-07-06
申请号：KR1020150038222
申请日：2015-03-19
Applicant: 충남대학교산학협력단
Abstract: 본발명은당단백질에서당사슬다양성을포함한당자리위치를확인하고분석하는방법에관한것으로서, 좀더 자세히는바이오의약품등으로이용되는당단백질을단백질분해효소를이용하여 N-당펩타이드와 O-당펩타이드로분리할수 있는분석법에관한것이다. 본발명의방법은다중화분해효소를처리하고및 특정분자량추출법(Molecular Weight Cut Off filtration)을이용하여당펩타이드를생성하고, 이를분리하여 N-당펩타이드와 O-당펩타이드의동시분석이가능하며, 인접한당자리도완벽히분리하여확인할수 있다. 본발명의분석방법에따라얻어진결과를이용하여당단백질의약품에서당자리에따른당사슬의조성및 정량정보를나타내는당단백질의약품의 2D 도식도를제작할수 있다.
Abstract translation: 使用每N-蛋白酶蛋白生物制药肽和每个糖肽O-用作这种本发明中，更详细地涉及一种方法，以确定和分析的数位位置的糖包括糖蛋白糖链的多样性 以及分离它们的方法。 本发明的复用处理和降解酶的方法，和通过使用特定的提取方法（分子量截留过滤）产生每分子量的肽，以及以分离它允许肽和同时分析的肽的每O- N-和糖， 相邻的派对座位也可以完全隔离。 可以产生每表示的糖链组合物，并根据通过使用根据本发明的分析方法得到的结果在糖蛋白药物每个数字的信息量的蛋白质药物图二维示意图。
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