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公开(公告)号：CN104846076B
公开(公告)日：2019-02-05
申请号：CN201510148678.9
申请日：2015-03-31
Applicant: 江汉大学 , 中国农业科学院作物科学研究所
IPC: C12Q1/6895 , G16B40/00
Abstract: 本发明公开了一种测定杂交油菜新品种的特异性、一致性与稳定性的方法。该方法包括：获得变异位点；确定待测油菜品种的测试区域；构建数据库；确定抽样量后，随机抽样混合并提取混合样本的DNA；制备引物；利用引物对混合样本的DNA进行扩增，扩增产物用于构建高通量测序文库；对高通量测序文库进行高通量测序，得到测序片段组；分析测序片段组，获得待测油菜品种基因型和杂株基因型；比较获得近似品种、变异位点和变异位点率；获得杂株品种后，计算杂株率；利用变异位点、变异位点率和杂株率，判断待测油菜品种特异性、一致性和稳定性。所述方法能够准确、完整地判断待测油菜品种的特异性、稳定性与一致性，且测试速度更快。
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公开(公告)号：CN104328185B
公开(公告)日：2017-02-08
申请号：CN201410606600.2
申请日：2014-10-31
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种监控总RNA中线状RNA消除的方法。所述方法包括：人工合成外源线性ERCC-0004-RNA和外源环状ERCC-0013-RNA；对外源环状ERCC-0013-RNA进行质量控制；将外源线性ERCC-0004-RNA和外源环状ERCC-0013-RNA按等摩尔比混合，得到混合外源RNA；向待检样本的总RNA中加入混合外源RNA，得到第一混合物；去除第一混合物中的核糖体RNA，得到第二混合物；去除第二混合物中的线性RNA，线性RNA包括总RNA中的线性RNA和外源线性ERCC-0004-RNA，得到第三混合物；分别检测第一混合物和第三混合物中的外源线性ERCC-0004-RNA和外源环状ERCC-0013-RNA的含量；根据含量计算总RNA中线性RNA的去除比例。所述方法能够有效监控总RNA中线性RNA的去除程度。
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公开(公告)号：CN104846076A
公开(公告)日：2015-08-19
申请号：CN201510148678.9
申请日：2015-03-31
Applicant: 江汉大学 , 中国农业科学院作物科学研究所
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种测定杂交油菜新品种的特异性、一致性与稳定性的方法。该方法包括：获得变异位点；确定待测油菜品种的测试区域；构建数据库；确定抽样量后，随机抽样混合并提取混合样本的DNA；制备引物；利用引物对混合样本的DNA进行扩增，扩增产物用于构建高通量测序文库；对高通量测序文库进行高通量测序，得到测序片段组；分析测序片段组，获得待测油菜品种基因型和杂株基因型；比较获得近似品种、变异位点和变异位点率；获得杂株品种后，计算杂株率；利用变异位点、变异位点率和杂株率，判断待测油菜品种特异性、一致性和稳定性。所述方法能够准确、完整地判断待测油菜品种的特异性、稳定性与一致性，且测试速度更快。
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公开(公告)号：CN104141008B
公开(公告)日：2016-10-05
申请号：CN201410309783.1
申请日：2014-06-30
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了miRNA169h基因预报水稻白叶枯病的方法，属于生物技术领域。所述方法包括以下步骤：选取待测水稻和对照水稻，选取的所述对照水稻为未感染白叶枯病但与待测水稻在相同条件下栽培的水稻；分别分离所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因；分别检测所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因中的miRNA169h基因的表达量，所述miRNA169h基因的序列如序列表中SEQ ID NO:1所示；根据所述待测水稻和所述对照水稻中的miRNA169h基因的表达量，判断实验是否成功，若成功，进一步判定所述待测植株是否感染白叶枯病。本发明提供的预测方法获得了成功，可以在水稻白叶枯病症出现前数天实现准确预报，为早防早治赢得了时间，减少了白叶枯病对水稻造成的损失。
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公开(公告)号：CN104141004B
公开(公告)日：2016-03-09
申请号：CN201410309693.2
申请日：2014-06-30
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种利用miRNA1430基因预报水稻白叶枯病的方法，属于生物技术领域。所述方法包括以下步骤：选取待测水稻和对照水稻，选取的所述对照水稻为未感染白叶枯病但与待测水稻在相同条件下栽培的水稻；分别分离所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因；分别检测所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因中的miRNA1430基因的表达量，所述miRNA1430基因的序列如序列表中SEQ ID NO:1所示；根据所述待测水稻和所述对照水稻中的miRNA1430基因的表达量，判断实验是否成功，若成功，进一步判定所述待测植株是否感染白叶枯病。本发明提供的预测方法获得了成功，可以在水稻白叶枯病症出现前数天实现准确预报，为早防早治赢得了时间，减少了白叶枯病对水稻造成的损失。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN104388455A
公开(公告)日：2015-03-04
申请号：CN201410591912.0
申请日：2014-10-29
Applicant: 江汉大学
Abstract: 本发明公开了一种莱茵衣藻相关基因的RNAi载体及其构建方法和应用，所述RNAi载体含有一个莱茵衣藻嵌合组成型表达启动子HSP70A/RBCS2、内含子和3’UTR和潮霉素筛选标记表达框序列，莱茵衣藻嵌合组成型表达启动子HSP70A/RBCS2的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，3’UTR的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示，潮霉素筛选标记表达框序列的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。本发明利用PCR技术把目的基因的部分cDNA片段先构建到中间载体pEASY-T1上，然后再通过两次酶切相继把目标基因的正向和反向片段连接到莱茵衣藻RNAi骨架载体上，简化了载体构建步骤，缩短了载体构建时间，提高了效率，同时可以直接应用到衣藻其它基因的功能研究方面。
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公开(公告)号：CN104805185B
公开(公告)日：2018-02-13
申请号：CN201510148657.7
申请日：2015-03-31
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种测试植物品种实质性派生关系的方法。该方法包括：获得变异位点；确定测试区域；抽样提取并获得抽样样本的DNA；制备引物；利用所述引物分别对两个抽样样本的DNA进行扩增，分别得到两个待测品种在测试区域的扩增产物用于构建两个待测品种的高通量测序文库；对两个高通量测序文库分别进行高通量测序，分别得到两个所述待测品种的测序片段组；分析两个测序片段组，分别获得两个待测品种基因型；比较两个待测品种基因型，获得待测品种间差异基因型的比例；根据待测品种间差异基因型的比例，判断两个待测品种的实质性派生关系。该方法能够准确、快速且简单地判断待测品种间的实质性派生关系。
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公开(公告)号：CN104388455B
公开(公告)日：2018-01-16
申请号：CN201410591912.0
申请日：2014-10-29
Applicant: 江汉大学
Abstract: 本发明公开了一种莱茵衣藻相关基因的RNAi载体及其构建方法和应用，所述RNAi载体含有一个莱茵衣藻嵌合组成型表达启动子HSP70A/RBCS2、内含子和3’UTR和潮霉素筛选标记表达框序列，莱茵衣藻嵌合组成型表达启动子HSP70A/RBCS2的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，3’UTR的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示，潮霉素筛选标记表达框序列的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。本发明利用PCR技术把目的基因的部分cDNA片段先构建到中间载体pEASY‑T1上，然后再通过两次酶切相继把目标基因的正向和反向片段连接到莱茵衣藻RNAi骨架载体上，简化了载体构建步骤，缩短了载体构建时间，提高了效率，同时可以直接应用到衣藻其它基因的功能研究方面。
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公开(公告)号：CN104388548B
公开(公告)日：2017-01-18
申请号：CN201410604748.2
申请日：2014-10-31
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种高通量环状RNA测序的方法，属于分子生物学领域。该方法包括：人工合成外源线性ERCC-0004-RNA和外源环状ERCC-0013-RNA；对外源环状ERCC-0013-RNA进行质量控制；将外源线性ERCC-0004-RNA和外源环状ERCC-0013-RNA按等摩尔比混合，得到混合外源RNA；向待测序样本的总RNA中加入混合外源RNA，得到第一混合物；去除第一混合物中的核糖体RNA，得到第二混合物；对第二混合物进行3’末端生物素标记，并去除标记上生物素的套索RNA及线性RNA，得到第三混合物；去除第三混合物中的线性RNA，得到第四混合物；对第四混合物进行标准的高通量转录组测序并对测序数据进行生物学分析。本发明能够准确反映出生物体内的基因在特定条件下的表达情况，降低了的成本。
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公开(公告)号：CN104141008A
公开(公告)日：2014-11-12
申请号：CN201410309783.1
申请日：2014-06-30
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/158 , C12Q2600/178
Abstract: 本发明公开了miRNA169h基因预报水稻白叶枯病的方法，属于生物技术领域。所述方法包括以下步骤：选取待测水稻和对照水稻，选取的所述对照水稻为未感染白叶枯病但与待测水稻在相同条件下栽培的水稻；分别分离所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因；分别检测所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因中的miRNA169h基因的表达量，所述miRNA169h基因的序列如序列表中SEQ ID NO:1所示；根据所述待测水稻和所述对照水稻中的miRNA169h基因的表达量，判断实验是否成功，若成功，进一步判定所述待测植株是否感染白叶枯病。本发明提供的预测方法获得了成功，可以在水稻白叶枯病症出现前数天实现准确预报，为早防早治赢得了时间，减少了白叶枯病对水稻造成的损失。
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