一种筛选植物高多态性分子标记位点的方法

    公开(公告)号:CN107815489A

    公开(公告)日:2018-03-20

    申请号:CN201711285561.0

    申请日:2017-12-07

    Applicant: 江汉大学

    CPC classification number: C12Q1/6811 C12Q2535/122 C12Q2537/143

    Abstract: 本发明公开了一种筛选植物高多态性分子标记位点的方法,将同一植物的不同子类混合后提取总核酸;构建高通量测序文库;寻找基因组上的变异位点;通过滑动平移筛选高多态性位点;在候选位点两侧设计多重扩增引物;对多重引物的筛选后即获得新的高多态性分子标记位点。理论上本发明可以一次性筛选出基因组上所有可用的高多态性分子标记位点,并且可以直接用于品种的高通量检测;由于开发过程中已经综合了多个品种的基因组信息,因而不需要传统筛选方法中针对每个样品的反复验证过程;在应用上本方法所筛选出的分子标记位点可以批量检测,不需要对每个分子标记位点一个一个的做分子扩增和检测,因而加快了检测速度,并提高了准确性;本发明筛选出的分子标记多态性高、分辨率好,且筛选过程简单、快速且流程规范。

    一种测定杂交玉米新品种的特异性、一致性与稳定性的方法

    公开(公告)号:CN104805190B

    公开(公告)日:2017-12-01

    申请号:CN201510150506.5

    申请日:2015-03-31

    Abstract: 本发明公开了一种测定杂交玉米新品种的特异性、一致性与稳定性的方法。所述方法包括:获得变异位点;确定待测玉米品种的测试区域;构建数据库;确定抽样量后,随机抽样混合并提取混合样本的DNA;制备引物;利用引物对混合样本的DNA进行扩增,扩增产物用于构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;分析测序片段组,获得待测玉米品种基因型和杂株基因型;比较获得近似品种、变异位点和变异位点率;获得杂株品种后,计算杂株率;利用变异位点、变异位点率和杂株率,判断待测玉米品种特异性、一致性和稳定性。所述方法能够准确、完整地判断待测玉米品种的特异性、稳定性与一致性,且测试速度更快。

    马铃薯微卫星标记位点开发方法与微卫星标记位点内的微卫星标记的长度检测方法

    公开(公告)号:CN106755312A

    公开(公告)日:2017-05-31

    申请号:CN201611030366.9

    申请日:2016-11-16

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种马铃薯微卫星标记位点开发方法与微卫星标记位点内的微卫星标记的长度检测方法。所述开发方法包括:获得混合样本;提取混合样本的基因组;将基因组片段化,获得基因组片段;利用探针组分别与基因组片段进行杂交;纯化多个杂交溶液中成功杂交的基因组片段;将多个所述纯化的杂交基因组片段混合后,利用高通量测序检测所述纯化的基因组片段;获得有效的所述高通量测序片段;将所述有效的高通量测序片段进行分类。所述检测方法包括:选择待检测的微卫星标记位点;利用多重扩增引物扩增所述待检测的微卫星标记位点内的微卫星标记,获得所述微卫星标记位点内的微卫星标记的长度。上述方法简单、快速、全面且准确。

    棉花微卫星标记位点开发方法与微卫星标记位点内的微卫星标记的长度检测方法

    公开(公告)号:CN106520954A

    公开(公告)日:2017-03-22

    申请号:CN201611021778.6

    申请日:2016-11-16

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种棉花微卫星标记位点开发方法与微卫星标记位点内的微卫星标记的长度检测方法。所述开发方法包括:获得混合样本;提取混合样本的基因组;将基因组片段化,获得基因组片段;利用探针组分别与基因组片段进行杂交;纯化多个杂交溶液中成功杂交的基因组片段;将多个所述纯化的杂交基因组片段混合后,利用高通量测序检测所述纯化的基因组片段;获得有效的所述高通量测序片段;将所述有效的高通量测序片段进行分类。所述检测方法包括:选择待检测的微卫星标记位点;利用多重扩增引物扩增所述待检测的微卫星标记位点内的微卫星标记,获得所述微卫星标记位点内的微卫星标记的长度。上述方法简单、快速、全面且准确。

    一种大豆油转基因成分的检测方法

    公开(公告)号:CN105603079A

    公开(公告)日:2016-05-25

    申请号:CN201610061019.6

    申请日:2016-01-29

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种大豆油转基因成分的检测方法,属于生物技术领域。所述方法包括:确定转基因成分、内源标准基因和外源标准基因;制备多重扩增引物;进行抽样并混合,得到混合样品;提取混合样品的基因组并加入外源标准基因,得到混合核酸;构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;获得待测样品中转基因成分的测序片段的数量、内源标准基因的测序片段的数量和外源标准基因的测序片段的数量;根据外源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功并计算待测样品种中转基因成分的含量;根据转基因成分的含量判断待测样品中是否含有转基因成分。该方法能够同时定量检测待测样品中的任意多种转基因成分。

    一种土壤微生物定性与定量的检测方法

    公开(公告)号:CN105603076A

    公开(公告)日:2016-05-25

    申请号:CN201610060991.1

    申请日:2016-01-29

    Applicant: 江汉大学

    Inventor: 李论 彭海

    CPC classification number: C12Q1/6869 C12Q2531/113 C12Q2537/143 C12Q2535/122

    Abstract: 本发明公开了一种土壤微生物定性与定量的检测方法,属于生物技术领域。所述方法包括以下步骤:确定待测样品中的目标微生物类群、目标微生物和非目标生物、以及不存在于所述待测样品中的参考微生物;设计目标微生物类群与目标微生物的特征区域;设计特征区域的多重扩增引物;在待测样品中加入参考微生物与外源核酸后,提取待测样品中的微生物的核酸;利用设计的多重引物扩增微生物核酸,扩增获得特征测序片段;利用特征测序片段定性、定量分析待测样品中微生物。本发明不需要对微生物进行预培养与增殖,可以一次性地对待测样品中的多种已知微生物进行高通量、高准确度、高分辨率的检测,检测过程简单、快速且流程规范。

    一种痰液微生物耐药性基因的检测方法

    公开(公告)号:CN105603073A

    公开(公告)日:2016-05-25

    申请号:CN201610060833.6

    申请日:2016-01-29

    Applicant: 江汉大学

    Inventor: 李论 高利芬 彭海

    Abstract: 本发明公开了一种痰液微生物耐药性基因的检测方法。所述方法包括:确定耐药性基因、内源标准基因和外源标准基因;制备多重扩增引物;向待测样品中加入外源核酸,得到混合样品并提取基因组;向基因组中加入外源标准基因,获得混合核酸;扩增混合核酸,利用扩增产物构建高通量测序文库并进行高通量测序,得到测序片段组;分析所述测序片段组,并根据获得的外源标准基因和内源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功;若实验成功,则计算耐药性基因的含量;根据耐药性基因的含量判定待测样品是否含有耐药性基因。所述方法可以一次性定量检测任意微生物中的任意多种希望检测的耐药性基因,且检测不需要培养与纯化微生物,速度快,结果准确可靠。

    一种玉米微生物耐药性基因的检测方法

    公开(公告)号:CN105586417A

    公开(公告)日:2016-05-18

    申请号:CN201610061033.6

    申请日:2016-01-29

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种玉米微生物耐药性基因的检测方法。所述方法包括:确定耐药性基因、内源标准基因和外源标准基因;制备多重扩增引物;向待测样品中加入外源核酸,得到混合样品并提取基因组;向基因组中加入外源标准基因,获得混合核酸;扩增混合核酸,利用扩增产物构建高通量测序文库并进行高通量测序,得到测序片段组;分析所述测序片段组,并根据获得的外源标准基因和内源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功;若实验成功,则计算耐药性基因的含量;根据耐药性基因的含量判定待测样品是否含有耐药性基因。所述方法可以一次性定量检测任意微生物中的任意多种希望检测的耐药性基因,且检测不需要培养与纯化微生物,速度快,结果准确可靠。

    一种食品微生物定性与定量的检测方法

    公开(公告)号:CN105567831A

    公开(公告)日:2016-05-11

    申请号:CN201610061063.7

    申请日:2016-01-29

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种食品微生物定性与定量的检测方法,属于生物技术领域。所述方法包括以下步骤:确定待测样品中的目标微生物类群、目标微生物和非目标生物、以及不存在于所述待测样品中的参考微生物;设计目标微生物类群与目标微生物的特征区域;设计特征区域的多重扩增引物;在待测样品中加入参考微生物与外源核酸后,提取待测样品中的微生物的核酸;利用设计的多重引物扩增微生物核酸,扩增获得特征测序片段;利用特征测序片段定性、定量分析待测样品中微生物。本发明不需要对微生物进行预培养与增殖,可以一次性地对待测样品中的多种已知微生物进行高通量、高准确度、高分辨率的检测,检测过程简单、快速且流程规范。

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