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公开(公告)号:CN116904620A
公开(公告)日:2023-10-20
申请号:CN202310292361.7
申请日:2023-03-23
Applicant: 三亚中国检科院生物安全中心 , 中国检验检疫科学研究院 , 江汉大学
IPC: C12Q1/689 , C12N15/11 , C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12R1/01 , C12R1/645
Abstract: 本发明涉及水稻病原菌分子检测技术领域,公开了一种基于MNP快速检测水稻病原菌的引物组及试剂盒和方法,包括引物对A、引物对B、引物对C和引物对D,所述引物对A为xoo1~xoo20中的至少一对,引物对B为xoc1~xoc14中的至少一对,引物对C为Burkholderia_glumae1~Burkholderia_glumae20中的至少一对,引物对D为Pyricularia_oryzae 1~Pyricularia_oryzae 20中的至少一对;每对引物对均包括正向引物和反向引物;所有引物的碱基序列如SEQ ID No.1~148所示。本方案引物组可一次性的对水稻白叶枯病、谷枯病、水稻细菌性条斑病和稻瘟病的病原菌的多个MNP标记中的至少一个进行检测,根据获得的MNP标记的序列进行水稻病害病原物的定性鉴定、水稻病害病原物各亚种间的遗传变异鉴定、病原菌指纹数据库的构建。
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公开(公告)号:CN114807407B
公开(公告)日:2023-09-08
申请号:CN202210224821.8
申请日:2022-03-07
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于生物技术领域,特别涉及一种检测大豆转基因品系的引物对组合、试剂盒及检测方法。所述引物对组合包括核苷酸序列序列如SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.40所示;判断待测样品中的转基因品系;避免了传统基因芯片和数字PCR技术进行扩增和检测成本高,因此本申请的引物在进行检测时,可以通过一次高通量测序和分析,得到转基因作物中多个基因或同时检测多种转基因作物检测结果,节省了成本,便于推广。
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公开(公告)号:CN114277184B
公开(公告)日:2023-09-08
申请号:CN202111309324.X
申请日:2021-11-06
Applicant: 江汉大学
Abstract: 本发明属于分子生物学技术领域,本发明公开了一种人冠状病毒HCoV‑HKU1的MNP标记组合、引物对组合、试剂盒及其应用,所述MNP标记组合包括参考基因组NC_006577.2的15个标记,具体的核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.15所示。所述引物核苷酸序列如SEQ ID NO.16‑SEQ ID NO.45所示。所述MNP标记组合能特异的鉴定人冠状病毒HCoV‑HKU1;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记组合进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏、高精准和免培养的检测优势,可应用于大规模样本的人冠状病毒HCoV‑HKU1的鉴定和遗传变异检测,对人冠状病毒HCoV‑HKU1的科研和防疫监测均具有重要意义。
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公开(公告)号:CN114277187B
公开(公告)日:2023-07-07
申请号:CN202111309414.9
申请日:2021-11-06
Applicant: 江汉大学
Abstract: 本发明属于分子生物学技术领域,本发明公开了一种呼吸道合胞病毒的MNP标记组合、引物对组合、试剂盒及其应用,所述MNP标记组合包括15个标记,具体的核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.15所示;所述引物对组合包括15对引物,具体的引物序列如SEQ ID NO.16‑SEQ ID NO.45所示。所述MNP标记组合能特异的鉴定呼吸道合胞病毒并精细的检测变异;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏、高精准和免培养的检测优势,可应用于大规模样本的呼吸道合胞病毒的鉴定和遗传变异检测,对呼吸道合胞病毒的研究和防疫监测均具有重要意义。
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公开(公告)号:CN114507750B
公开(公告)日:2023-06-20
申请号:CN202210195225.1
申请日:2022-02-28
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本申请涉及生物技术领域,尤其涉及一种检测玉米转基因品系的引物组、试剂盒及检测方法;所述引物组包括29对检测引物对,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.58所示;引物对中引物的长度为18bp~30bp;所述试剂盒包括引物组;所述方法包括:分别得到玉米转基因品系和玉米内参基因的核苷酸序列;根据核苷酸序列,分别设计出引物组;提取待检样品的基因组DNA,得到待测玉米品系的基因组DNA;以基因组DNA为模板,以引物组为扩增引物进行PCR扩增,得到扩增产物;将扩增产物进行高通量测序,得到高通量测序数据;对高通量测序数据进行分析,确定待测玉米样品中是否含有转基因品系;通过设计出引物长度为18bp~30bp的29对检测引物,在同一PCR反应中实现多个靶标分子的同时检测。
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公开(公告)号:CN116162684A
公开(公告)日:2023-05-26
申请号:CN202310128111.X
申请日:2023-02-17
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q1/70 , C12R1/93
Abstract: 本申请涉及基因测序技术领域,尤其涉及一种去除扩增子测序中扩增产物残余污染的方法及其应用,所述方法包括:在构建待测样本的测序文库的第一步PCR反应体系中加入DNA Spike‑ins,后以第一多重扩增引物进行第一步PCR扩增,得到第一扩增产物;向所述第一扩增产物中加入第二步PCR反应体系和第二PCR扩增引物,并进行第二步PCR扩增,得到测序文库;DNA Spike‑ins依据待测样本中目标生物的基因组标记位点的序列设计并合成;第一步PCR反应体系包括dUTP和UDG;第二步PCR反应体系包括dUTP;通过在第一步PCR反应体系中加入DNA Spike‑ins,减少扩增产物残余污染的扩增,再在每步PCR反应体系中加入dUTP,并在第一步PCR反应体系中加入UDG,能降解含尿嘧啶的PCR产物,去除扩增产物残余污染。
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公开(公告)号:CN114107525B
公开(公告)日:2023-05-05
申请号:CN202111329184.2
申请日:2021-11-10
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6858 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , G16B20/30 , G16B50/00 , C12R1/385
Abstract: 本发明公开了一种铜绿假单胞菌的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在铜绿假单胞菌基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑17的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.34所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定铜绿假单胞菌并精细的区分不同的菌株;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析;所述试剂盒对铜绿假单胞菌具有高通量、多靶点、高灵敏、高准确和监测变异的检测优势,可应用于大规模样本的检测,对铜绿假单胞菌的科研和防疫监测均具有重要意义。
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公开(公告)号:CN114369678B
公开(公告)日:2023-04-25
申请号:CN202210001518.1
申请日:2022-01-04
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种检测甜菜转基因成分和转基因品系的引物组合、试剂盒、检测方法及应用。所述的检测甜菜常用的转基因元件及转基因品系的引物对组合包括以扩增13种常用甜菜转基因元件、2种转基因品系特异性序列以及1种甜菜内参基因Bv_GLuA3(glutamine synthetase leaf isozyme gene)的引物组。本发明还涉及检测甜菜转基因元件、转基因品系的试剂盒与检测方法。本发明技术方案操作简单,检测效率高;检验对象全面,具有较高的检测特异性、准确度和灵敏性;可用于转基因甜菜及其制品的大规模检测,具有较好的应用前景。
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公开(公告)号:CN115044704A
公开(公告)日:2022-09-13
申请号:CN202111387316.7
申请日:2021-11-22
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种人冠状病毒HCoV‑229E的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点包括参考基因组NC_002645.1的8个标记,所述引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.16所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定人冠状病毒HCoV‑229E;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏、高精准和免培养的检测优势,可应用于大规模样本的人冠状病毒HCoV‑229E的鉴定和遗传变异检测,对人冠状病毒HCoV‑229E的科研和防疫监测均具有重要意义。
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公开(公告)号:CN115029477A
公开(公告)日:2022-09-09
申请号:CN202111354809.0
申请日:2021-11-16
Applicant: 江汉大学
Abstract: 本发明公开了一种人鼻病毒的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在人鼻病毒基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑5的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQID NO.10所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定人鼻病毒并精细的区分不同的亚型;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、免培养的检测优势,可应用于大规模样本的人鼻病毒的鉴定和遗传变异检测,对人鼻病毒的科研、医学监测具有重要意义。
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