一种基于CRISPR/Cas9系统敲除猪细胞Y染色体的方法

    公开(公告)号:CN116064541B

    公开(公告)日:2025-03-18

    申请号:CN202211294282.1

    申请日:2022-10-21

    Abstract: 本发明涉及一种基于CRISPR/Cas9系统敲除猪细胞Y染色体的方法,属于生物技术领域,该方法主要包括:(1)根据生物信息学找出位于Y染色体上的特异靶向重复序列并设计相应的gRNA;(2)进行CRISPR/Cas9载体的制备;(3)将构建好的载体电转入公猪胎儿成纤维细胞中,并通过q‑PCR验证其在细胞水平的靶基因表达水平下降情况;(4)选择效率较高的gRNA电转,进行流式分选稀释获取单克隆,并对单克隆进行PCR及核型分析验证。本发明在猪的特定染色体寻找能够被特异sgRNA识别的重复序列,为特定染色体及其携带基因功能的研究提供了一种新的工具,同时也为实现大型家畜性别控制提供一种新的技术方案。

    一种与猪体长相关的SNP分子标记及其应用

    公开(公告)号:CN115851975A

    公开(公告)日:2023-03-28

    申请号:CN202211326080.0

    申请日:2022-10-25

    Abstract: 本发明涉及一种与猪体长相关的SNP分子标记及其应用,属于分子生物学和分子标记技术领域,所述SNP分子标记与位于猪17号染色体上的BMP2基因高度连锁,单核苷酸多态性位点对应国际猪基因组11.1版本参考序列17号染色体上第15,643,342位T>C突变,该位点为GWAS最高点并与BMP2基因内的SNP位点高度连锁,且BMP2基因内SNP位点也是GWAS最显著位点之一,更重要的是,该位点的优势等位基因型比有害等位基因型的体长表型长4.01cm,可解释13.65%的表型方差。在此基础上,通过选择有利基因型个体留种,淘汰不利基因型个体,可显著提高种群体长性状,从而达到加快种猪体长性状遗传进展的目的。

    一种识别基因编辑动物全基因组变异的方法

    公开(公告)号:CN114807333A

    公开(公告)日:2022-07-29

    申请号:CN202210609250.X

    申请日:2022-05-31

    Abstract: 本发明公开了一种识别基因编辑动物全基因组变异的方法。通过分析供体细胞和基因编辑后新生克隆猪的全基因组,使用mutect2、strelka2和/或lofreq分析识别基因编辑造成的全基因组范围内的变异位点。本发明的分析方法用以分析全基因组范围内的所有突变,不以sgRNA同源性预测作为依据,能最大限度地检测所有存在的变异位点;以无偏的方式直接分析基因编辑猪与供体细胞的基因差异,不受遗传学影响,且操作方便,高效处理批量样品;适用于所有克隆动物全基因组比较分析,适用于任何工具和方法对供体细胞造成变异的检测,包括克隆操作自身对克隆动物造成变异的检测。

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