精确序列信息及修饰碱基位置确定的方法

    公开(公告)号:CN103484560B

    公开(公告)日:2014-11-05

    申请号:CN201310494873.8

    申请日:2009-11-06

    CPC classification number: G06F19/22 C12Q1/6869 C12Q2531/125 C12Q2537/165

    Abstract: 本发明公开确认核酸样本的序列和/或核酸样本中修饰碱基的位置的方法,该核酸样本以具有已知序列的核酸插入物的环状分子呈现,该方法包含获取至少两个插入样本单元的序列信息。在一些实施例中,本发明方法包括使用环状配对互锁分子获取序列信息。在一些实施例中,本发明方法包括通过比较核酸样本序列与核酸插入物的已知序列,计算核酸插入物序列的分数,及根据紧邻于核酸样本序列的重复序列上游或下游之一个或两个插入物的序列分数,接受或拒绝该核酸样本序列的重复序列。

    用于扩增靶核酸的方法

    公开(公告)号:CN102639718A

    公开(公告)日:2012-08-15

    申请号:CN201080055136.2

    申请日:2010-12-03

    Abstract: 本发明提供了用于扩增核酸样品中的至少一种靶核酸的方法,其包括:(a)使核酸样品片段化,以产生至少一种的靶片段,靶片段包含靶核酸并包含两个探针互补部分,其中两个探针互补部分的至少一个位于靶片段的末端;(b)使片段化的核酸样品与至少一种探针接触,探针提供有固定化部件并任选地通过部件的方式固定在固相上,探针包含与靶片段的探针互补部分在序列上互补的两个靶片段互补部分,其中探针的部分可以是相邻的,或可被居间非靶片段互补部分分开;(c)使片段化的核酸样品成为单链的,其中该步骤在步骤(b)之前或与步骤(b)同时或在步骤(b)之后发生;(d)允许靶片段的探针互补部分与探针的靶片段互补部分杂交;(e)如果在步骤(b)中提供的探针未被固定化,通过固定部件的方式使探针-靶片段杂交体在固相上固定;(f)将未固定的核酸片段与固相分开;(g)使固相与连接酶连接以直接或间接连接靶片段的5’和3’端,由此环化靶片段,其中如果靶片段的探针互补部分之一没有位于靶片段的末端,通过瓣状内切核酸酶或外切核酸酶的作用形成除了探针互补部分所位于的末端之外的另一可连接末端;和(h)扩增所述环化的靶片段。还提供了在本发明的方法中使用的试剂盒。

    精确序列信息及修饰碱基位置确定的方法

    公开(公告)号:CN102076871A

    公开(公告)日:2011-05-25

    申请号:CN200980125207.9

    申请日:2009-11-06

    CPC classification number: G06F19/22 C12Q1/6869 C12Q2531/125 C12Q2537/165

    Abstract: 本发明公开确认核酸样本的序列和/或核酸样本中修饰碱基的位置的方法,该核酸样本以具有已知序列的核酸插入物的环状分子呈现,该方法包含获取至少两个插入样本单元的序列信息。在一些实施例中,本发明方法包括使用环状配对互锁分子获取序列信息。在一些实施例中,本发明方法包括通过比较核酸样本序列与核酸插入物的已知序列,计算核酸插入物序列的分数,及根据紧邻于核酸样本序列的重复序列上游或下游之一个或两个插入物的序列分数,接受或拒绝该核酸样本序列的重复序列。

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