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公开(公告)号:CN102766574B
公开(公告)日:2013-12-25
申请号:CN201210166089.X
申请日:2012-05-24
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所 , 中国科学院半导体研究所
IPC: C12M1/34
Abstract: 本发明公开了一种用于DNA测序仪的反应仓,包括底座、进行测序反应的反应池体和安装座,反应池体上设有环形凹槽,安装座上设有贯通的安装腔,测序芯片安装在安装腔的一端内,安装腔上设有多个定位槽,每个定位槽内均设有滑动伸入安装腔内以卡持测序芯片的滑动舌板;反应池体开设有环形凹槽的一侧面与安装座固定连接;反应池体的另一侧面贴在底座上,反应池体能在导向杆的轴向上滑动并能在导向杆的径向上微动;反应池体与底座之间设有第一弹性部件。本发明通过滑动舌板实现测序芯片的自动卡紧,通过反应池体在导向杆上的滑动及其径向上的稍微浮动,使光纤面板的外端面与测序芯片之间具有尽量高的平行度精度,实现高信噪比测序信号的获取。
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公开(公告)号:CN102703311B
公开(公告)日:2013-08-21
申请号:CN201210165398.5
申请日:2012-05-24
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所 , 中国科学院半导体研究所
IPC: C12M1/34
Abstract: 本发明公开了一种用于DNA测序仪的自适应调整的反应仓,包括底座、进行测序反应的反应池体和用于安装测序芯片的测序芯片安装座;测序芯片安装座固定连接在反应池体上,底座上固定连接有多个导向杆,反应池体上设有与导向杆对应的多个通孔,反应池体通过通孔滑动连接在导向杆上;反应池体与底座之间设有弹性部件。本发明的用于DNA测序仪的自适应调整的反应仓,可以使光纤面板的外端面与测序芯片尽量靠近,由于反应池体与导向杆之间留有间隙,并能使光纤面板的外端面与测序芯片之间具有尽量高的平行度精度、防止了外来的光学污染,从而降低了背景噪声,实现高信噪比测序信号的获取。
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公开(公告)号:CN110283754B
公开(公告)日:2021-02-02
申请号:CN201910626459.5
申请日:2019-07-11
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所
IPC: C12N1/20 , C12Q1/689 , C12Q1/06 , C12R1/145 , C12R1/025 , C12R1/38 , C12R1/05 , C12R1/20 , C12R1/065
Abstract: 本发明提供用于类风湿关节炎炎症状态评估及预后评价的肠道微生物菌群,所述肠道微生物菌群包括肠道产丁酸菌和肠道非发酵菌两类肠道菌;其中,所述肠道产丁酸菌包括12个产丁酸菌菌属的微生物,所述肠道非发酵菌包括33个非发酵菌菌属的微生物。本发明首次提出肠道菌群中产丁酸菌与非发酵菌通过产生/消耗肠道丁酸,影响肠道丁酸净产量,从而影响RA的炎症状态及预后。对大样本进行验证,结果表明,通过粪便宏基因组检测,获得产丁酸菌与非发酵菌总丰度比值,即可评估RA的炎症状态及预后情况,且具有较高的敏感性和特异性。
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公开(公告)号:CN106282332B
公开(公告)日:2019-11-15
申请号:CN201610645098.5
申请日:2016-08-08
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C40B50/06
Abstract: 本发明涉及分子生物学技术领域,具体涉及用于多重核酸测序的标签和用于构建真菌ITS序列多重测序文库的PCR引物。本发明提供的Index经过庞大数量的实际测序检验,将其包含于测序或建库引物后,混合测序反应得到的测序数据平衡性相对较好,进而能够更加真实可靠地反应样品中的真菌组成情况。本发明提供的用于构建真菌ITS序列多重测序文库的PCR引物比现有的常规ITS引物的特异性更高,不仅能够对动物肠道、水体以及大曲等复杂性相对较低的样品类型获得高特异的扩增产物;对土壤和淤泥等高复杂性的样品类型也具有较高的特异性,因此保障了后续测序结果的准确性,进而能够获得相对更加准确的分析结果和更加真实的真菌组成情况。
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公开(公告)号:CN107090399B
公开(公告)日:2019-06-28
申请号:CN201710288471.0
申请日:2017-04-27
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所
Abstract: 本发明提出一种痰液样品中病原菌的快速提纯装置,包括病原菌收集通道和由串联的分离单元构成的主通道,多个串联的分离单元形成串状结构,所述串状结构与病原菌收集通道平行;每个分离单元包括至少有部分凸起朝向所述病原菌收集通道的弧形部分,弧形部分的凸起与所述病原菌收集通道通过栅栏连接。本发明还提出一种痰液样品中病原菌的快速提纯方法。本发明提出的痰液样品中病原菌的快速提纯装置操作方便,操作时只需要简单将样品推过芯片即可。稳定性高,对不同的流速大小,不同粘度的样品,不同细菌比率的样本,分离去除动物细胞的效率稳定在99%以上,收集病原菌能保持接近原样品一半的水平。
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公开(公告)号:CN105112412A
公开(公告)日:2015-12-02
申请号:CN201510586662.6
申请日:2015-09-14
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所
Abstract: 本发明涉及基因工程领域,具体提供了一种提供一种用于敲除细胞人BTF(Bcl-2-associated transcription factor 1)基因的sgRNA序列。在细胞中该gRNA能够特异结合于人BTF编码序列第251-269bp,并与Cas形成复合物,对BTF基因核酸序列进行特异切割,利用细胞非重组末端连接(NHEJ)修复机制,造成BTF基因移码突变,进而获得BTF基因敲除细胞。
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公开(公告)号:CN102703302B
公开(公告)日:2013-11-27
申请号:CN201210165663.X
申请日:2012-05-24
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所 , 中国科学院半导体研究所
IPC: C12M1/00
Abstract: 本发明公开了一种自动卡持测序芯片的安装座,包括用于容置所述测序芯片的安装腔,所述安装腔的一端设有用于定位所述测序芯片的定位环,其特征在于,所述安装腔的内壁上沿其径向设有多个贯通所述内壁的定位槽,所述定位槽沿所述安装腔的圆周均匀分布,每个所述定位槽内均设有沿所述定位槽滑动伸入所述安装腔内以卡持所述测序芯片使其紧贴在所述定位环上并沿所述定位槽缩回所述定位槽内以松开所述测序芯片的滑动舌板。本发明的自动卡持测序芯片的安装座自通过设置能自动弹出的滑动舌板伸入安装腔以卡持测序芯片,和在外力下缩回安装定位槽内,以实现快速装卸测序芯片,提高测序效率。
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公开(公告)号:CN102703310A
公开(公告)日:2012-10-03
申请号:CN201210165396.6
申请日:2012-05-24
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所 , 中国科学院半导体研究所
IPC: C12M1/34
Abstract: 本发明公开了一种与测序芯片直接耦合的CCD相机,包括测序芯片装卡于DNA测序仪的测序芯片安装座内,所述CCD相机包括相机体和位于所述相机体内的用于捕捉测序反应的光信号的光纤面板,所述光纤面板的一端伸出所述相机体的前端直接与位于所述DNA测序仪的测序芯片安装座上的测序芯片的一侧面直接接触以获取在测序芯片的另一侧面上进行的测序反应所产生的光信号。本发明的与测序芯片直接耦合的CCD相机,通过设置能与测序芯片直接耦合的光纤面板,可以使在测序芯片上所产生的微弱的可见光直接被光纤面板接收,转化为电信号,提高光耦合效率,光耦合效率可超过70%,保证了高质量的测序信号的获取。
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公开(公告)号:CN102703301A
公开(公告)日:2012-10-03
申请号:CN201210164839.X
申请日:2012-05-24
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所 , 中国科学院半导体研究所
IPC: C12M1/00
Abstract: 本发明公开了一种用于测序芯片的安装座与CCD相机间的暗室,所述测序芯片的安装座上设有围绕在所述测序芯片外侧的环形凹槽;所述CCD相机前端的连接有连接法兰,所述连接法兰的前端具有用于插入所述环形凹槽并与所述环形凹槽密封配合的凸圈。本发明的用于测序芯片的安装座与CCD相机间的暗室,通过环形凹槽与凸圈的配合,在CCD相机与测序芯片的安装座之间形成封闭性的暗室环境,防止了外来的光学污染,从而降低了背景噪声,保证了高信噪比的测序信号的获取。
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公开(公告)号:CN102140539A
公开(公告)日:2011-08-03
申请号:CN201110030367.4
申请日:2011-01-28
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所
Abstract: 本发明提供一种甲型H1N1流感病毒检测试剂盒及检测方法。本发明的试剂盒对甲型H1N1流感病毒的HA基因上的2个不同区域(HA-1和HA-2)和NP基因上的2个不同区域(NP-1和NP-2)分别进行特异性检测,即平行检测其4个位点,降低了由于病毒突变而造成的假阴性率,以达到提高检出率的目的。
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