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公开(公告)号:CN101502248A
公开(公告)日:2009-08-12
申请号:CN200810202245.7
申请日:2008-11-05
Applicant: 东华大学
Abstract: 本发明涉及线粒体替代实验小鼠品系C57BL/6J-MitC3H/HeJ的构建,包括:(1)回交取C3H和B6两种品系的小鼠,以C3H做母本,B6做父本杂交得F1代;将F1代母鼠与B6雄鼠杂交得C3B61,为回交一代;以此轮回杂交十代,得到回交十代的小鼠C3B610;(2)鉴定回交(a)通过Blast两品系小鼠的线粒体序列,找到4个SNP位点,本实验通过扩增线粒体片段再对片段进行测序,鉴定回交小鼠的线粒体DNA;(b)从小鼠全基因组中随机选取40个STR位点,对40个STR位点进行引物设计,鉴定回交小鼠的基因组DNA。本发明用于研究小鼠性发育启动的影响。
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公开(公告)号:CN101245388A
公开(公告)日:2008-08-20
申请号:CN200810034460.0
申请日:2008-03-11
Applicant: 东华大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及通用方案和构象敏感凝胶电泳筛查单核苷酸多态性位点法,该方法首先利用通用引物方案对目的核酸序列区段进行PCR扩增,再应用F-CSGE技术进行高通量快速检测,最后通过DNA测序技术对筛查出的位点进行最终确证。与其他检测方法比较,本发明方法通量更高,检测速度更快,成本更低,可用于检测未知SNP和致病基因的单碱基突变,用于未知单碱基多态性、基因突变、单碱基插入或缺失等单碱基改变的筛查和确认。
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公开(公告)号:CN118064558A
公开(公告)日:2024-05-24
申请号:CN202410124430.8
申请日:2024-01-29
Applicant: 东华大学 , 上海翼和应用生物技术有限公司
IPC: C12Q1/6851
Abstract: 本申请涉及分子检测领域,公开了一种利用实时荧光定量PCR技术精确检测端粒绝对长度的方法,包括以下步骤:1,合成端粒引物和内参引物;2,提取基因组DNA;3,qPCR扩增;4,以标准品的端粒或者内参CT值作为横坐标,标准品3个浓度梯度的log2为纵坐标构建端粒和内参的拟合方程,待测样本与校正品带入拟合方程分别计算端粒T/S值,校正品的绝对长度/检测长度得到校正系数,待测样本的T/S值都要用校正系数进行校正,样本的绝对长度利用校正后T/S*标准品绝对长度得到。本申请的方法,检测结果的稳定性大大提高,且检测结果更加准确,实现了利用实时荧光定量PCR技术个性化检测端粒绝对长度。
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公开(公告)号:CN116144743A
公开(公告)日:2023-05-23
申请号:CN202211621752.0
申请日:2022-12-16
Applicant: 东华大学 , 上海翼和应用生物技术有限公司
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6876 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种基于多重长PCR结合高通量测序同时实现多个同源序列SNP分型的引物、试剂盒及方法。本发明通过跨过同源序列中SNP的侧翼序列(约200bp),根据特定的引物设计原则设计特异性的多重长PCR扩增引物(2000‑3000bp),扩增采用特异性和扩增效率较高的聚合酶并参考降落PCR反应条件做多重长PCR反应,多重长PCR产物可用于基于NGS测序平台的SNP分型鉴定。本发明的方法基于多重长PCR反应和巢式多重PCR反应,可同时实现对多个同源序列SNP精准分型,克服了KASP和三引物等位基因PCR技术通量小的缺点;相比于全基因测序,本发明只扩增目的序列,具有较低的成本和较高的性价比。
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公开(公告)号:CN110846399A
公开(公告)日:2020-02-28
申请号:CN201910938718.8
申请日:2019-09-30
Applicant: 东华大学 , 上海市松江区中心医院
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明涉及一种心血管疾病个体化用药基因检测体系试剂盒及其应用,包括PCR反应体系、LDR的反应体系。本发明所述试剂盒采用多重PCR技术和多重LDR技术,两种技术相结合,基于杂交反应和连接反应,双重保证,检测过程中无需DNA纯化,减少了污染的可能性,结果更加准确。PCR-LDR检测的准确度可以与Sanger测序相媲美,但是前者多样性更高、成本更低。
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公开(公告)号:CN103719021B
公开(公告)日:2017-06-20
申请号:CN201210382423.5
申请日:2012-10-10
Applicant: 上海西普尔-必凯实验动物有限公司 , 东华大学
IPC: C12N15/11 , A01K67/027 , C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及1号染色体替换野生小家鼠C57BL/6.枣庄2‑Chr1的建立。构建了一种新的染色体C57BL/6替代实验小鼠品系,该小鼠品系的遗传背景以C57BL/6小鼠为主,但其中1号染色体以枣庄2小鼠为主。本发明的染色体替换品系可用于研究在相同基因组背景下,由不同的1号染色体基因组带来的性状差异,是采用遗传学方法研究染色体基因组功能的有用工具。
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公开(公告)号:CN106544322A
公开(公告)日:2017-03-29
申请号:CN201611108955.4
申请日:2016-12-06
Applicant: 东华大学
Abstract: 本发明涉及一种用于研究Kiss1基因表达调控的报告系统及其构建方法,所述系统为红色荧光蛋白稳定表达,绿色荧光受Kiss1表达调控元件调控的双荧光Kiss1基因表达调控报告系统。构建方法包括:构建红色荧光蛋白打靶载体Ai9‑dtomato;构建绿色荧光蛋白打靶系统;EGFP受Kiss1表达调控元件控制的Cas9‑GT1‑7‑Kiss1‑2A‑EGFP细胞的构建;插入稳定表达的红色荧光背景,即得。本发明实现对研究对象对Kiss1作用效应的量化评估。
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公开(公告)号:CN104372083B
公开(公告)日:2016-11-16
申请号:CN201410606864.8
申请日:2014-10-31
Applicant: 东华大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及一种逆转录miR‑505的茎环引物的设计方法,包括:以miRNA‑505‑3P基因为特异性的转录本,分别将该逆转录茎环引物的茎部碱基对的数量和环部的碱基个数规律的设计对应的几个梯度,经过对miRNA‑505‑3P的逆转录和real time‑PCR检测,最终筛选出一个对于miRNA‑505‑3P基因特异性逆转录时效率最佳的逆转录茎环引物。本发明避免了对成熟体检测的干扰,通过茎环引物在茎部和环部的梯度性的调整,可以分别明确的看出环部碱基的结构和茎部碱基的结构分别对逆转录茎环引物的逆转录效率的影响,因此更容易设计出合理高效的逆转录引物。
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公开(公告)号:CN105177126A
公开(公告)日:2015-12-23
申请号:CN201510520015.5
申请日:2015-08-21
Applicant: 东华大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12Q2600/158 , C12Q2600/178 , C12Q2545/101 , C12Q2563/107 , C12Q2565/125
Abstract: 本发明涉及一种利用荧光PCR技术对小鼠的分型鉴定方法,利用荧光PCR引物,经PCR扩增后将产物与已知片段大小的ROX混合,利用377测序,使用Genemapper软件计算出PCR产物的大小,从而达到鉴定小鼠基因型的目的,即可。本发明简单直接准确的鉴定出Crispr/Cas9敲除的mircoRNA小鼠。
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