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公开(公告)号:CN117106941A
公开(公告)日:2023-11-24
申请号:CN202210530743.4
申请日:2022-05-16
Applicant: 中国科学院微生物研究所 , 江汉大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , C12Q1/6806 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种鉴定香菇品种的MNP标记法的开发及应用。本发明基于香菇187个菌株基因组重测序数据,筛选得到501个广泛MNP标记位点;通过相关引物设计和对78份香菇商业品种的多重扩增、MNP‑Seq测序,构建了香菇的MNP标记位点数据库。在此基础上进一步筛选187个具有100%检测率的MNP标记位点作为核心MNP标记位点,利用240个菌株的核心位点序列构建系统发育图谱,计算不同谱系间和品种间遗传相似度,据此判断两个品种为不同品种还是相同品种,为不同谱系还是相同谱系。本发明具有重要的应用价值。